More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2404 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2404  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0620494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2183  Polyprenyl synthetase  81.14 
 
 		 297 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000465843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2176  polyprenyl synthetase  76.35 
 
 		 297 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000107352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1765  geranyltranstransferase  76.35 
 
 		 297 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316781  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1935  farnesyl-diphosphate synthase  75.68 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  70.61 
 
 		 295 aa  422  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  70.95 
 
 		 295 aa  422  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1668  geranyltranstransferase (farnesyldiphosphate synthase)  67.46 
 
 		 296 aa  358  7e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000016201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  55.25 
 
 		 294 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  54.39 
 
 		 296 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0608  Polyprenyl synthetase  54.58 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1049  farnesyl-diphosphate synthase  55.25 
 
 		 294 aa  315  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  54.58 
 
 		 297 aa  313  2.9999999999999996e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0776  farnesyl-diphosphate synthase  54.73 
 
 		 301 aa  312  3.9999999999999997e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1697  farnesyl-diphosphate synthase  50.51 
 
 		 297 aa  312  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.110898 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11191  polyprenyl synthetase  52.19 
 
 		 300 aa  307  1.0000000000000001e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.646183 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17563  predicted protein  51.51 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0164113  normal  0.0513256 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0681  polyprenyl synthetase  52.19 
 
 		 299 aa  302  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0156  Polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0152  Polyprenyl synthetase  50.51 
 
 		 309 aa  302  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00117274  hitchhiker  0.00332618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0972  Polyprenyl synthetase  51.19 
 
 		 320 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23311  normal  0.31243 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11601  polyprenyl synthetase  52.36 
 
 		 300 aa  299  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15151  polyprenyl synthetase  51.85 
 
 		 299 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.423714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11761  polyprenyl synthetase  51.35 
 
 		 299 aa  298  8e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2704  farnesyl-diphosphate synthase  50 
 
 		 309 aa  296  3e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000153186  normal  0.671867 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1081  polyprenyl synthetase  51.35 
 
 		 300 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.168923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4173  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 316 aa  295  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  normal  0.522672 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11751  polyprenyl synthetase  51.01 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2586  Polyprenyl synthetase  53.22 
 
 		 296 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0968269  normal  0.362813 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09331  polyprenyl synthetase  51.18 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0250  Polyprenyl synthetase  53.99 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1926  farnesyl-diphosphate synthase  54.18 
 
 		 296 aa  285  9e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0831  farnesyl-diphosphate synthase  50.17 
 
 		 295 aa  282  5.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000171972  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0833  farnesyl-diphosphate synthase  51.19 
 
 		 299 aa  281  8.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0162065  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0739  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  54.52 
 
 		 296 aa  280  2e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.396283  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1025  polyprenyl synthetase  52.65 
 
 		 295 aa  279  5e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1400  Polyprenyl synthetase  51.85 
 
 		 286 aa  276  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19000  farnesyltranstransferase  45.97 
 
 		 337 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.916261  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1264  Polyprenyl synthetase  49.66 
 
 		 297 aa  274  2.0000000000000002e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  46.42 
 
 		 294 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2320  Polyprenyl synthetase  48.73 
 
 		 297 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  48.15 
 
 		 315 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0945  farnesyl-diphosphate synthase  51.22 
 
 		 306 aa  268  5e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3491  Polyprenyl synthetase  53.05 
 
 		 290 aa  264  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000932682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3841  farnesyl-diphosphate synthase  53.33 
 
 		 295 aa  262  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20600  geranyltranstransferase  54.36 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.715859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07880  geranyltranstransferase  54.36 
 
 		 295 aa  261  8.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0580  polyprenyl synthetase  53.24 
 
 		 295 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0569  polyprenyl synthetase  47.83 
 
 		 301 aa  255  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0210108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2894  Polyprenyl synthetase  47.7 
 
 		 292 aa  254  8e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2437  polyprenyl synthetase  52.22 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1788  geranyltranstransferase  44.14 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.188169  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0605  polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158094  normal  0.173751 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2074  geranyltranstransferase  43.79 
 
 		 290 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00203562  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0562  polyprenyl synthetase  52.61 
 
 		 295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109586  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0699  geranyltranstransferase  51.53 
 
 		 295 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1456  farnesyl-diphosphate synthase  48.43 
 
 		 299 aa  253  3e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292762  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0528  polyprenyl synthetase  52.61 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5006  farnesyl-diphosphate synthase  51.01 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0573  polyprenyl synthetase  52.26 
 
 		 295 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0235  polyprenyl synthetase  43.92 
 
 		 297 aa  247  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2616  farnesyl-diphosphate synthase  48.48 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0537917  normal  0.394724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1663  polyprenyl synthetase  45.08 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1902  Polyprenyl synthetase  45.77 
 
 		 294 aa  245  6e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.267224  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2441  Polyprenyl synthetase  47.49 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0818  geranyltranstransferase  48.65 
 
 		 300 aa  242  6e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06510  farnesyl-diphosphate synthase  46.8 
 
 		 296 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000111006  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0416  Polyprenyl synthetase  47.44 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11560  geranyltranstransferase  52 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2755  farnesyl-diphosphate synthase  45.96 
 
 		 299 aa  239  4e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1643  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000512207 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1975  geranyltranstransferase  44.44 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.668358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2871  polyprenyl synthetase  52.31 
 
 		 297 aa  237  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2037  polyprenyl synthetase  43.36 
 
 		 296 aa  236  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  47.19 
 
 		 305 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1058  geranyltranstransferase  52.03 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1719  polyprenyl synthetase  50.17 
 
 		 299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.130705  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4251  geranyltranstransferase  50.78 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0195367  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4308  geranyltranstransferase  50.78 
 
 		 296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4030  polyprenyl synthetase  51.36 
 
 		 297 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0332417  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0946  geranyltranstransferase  51.17 
 
 		 296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.228897  hitchhiker  0.0000625392 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1500  polyprenyl synthetase  44.19 
 
 		 327 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3221  farnesyl-diphosphate synthase  49.62 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1423  Polyprenyl synthetase  42.62 
 
 		 300 aa  230  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.37451  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4082  geranyltranstransferase  48.91 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3920  geranyltranstransferase  48.91 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00628392  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3931  geranyltranstransferase  48.91 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4402  geranyltranstransferase  48.91 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.137146  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4198  geranyltranstransferase  48.91 
 
 		 296 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.116270000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4288  geranyltranstransferase  50.78 
 
 		 296 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.185381  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0267  polyprenyl synthetase  41.39 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.879349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2212  farnesyl-diphosphate synthase  43.92 
 
 		 294 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0955  Polyprenyl synthetase  52.42 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3060  farnesyl-diphosphate synthase  45.26 
 
 		 297 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.016258  hitchhiker  0.00000723246 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1651  geranyltranstransferase  42.52 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1775  Polyprenyl synthetase  46.83 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0714998  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0516  polyprenyl synthetase  45.36 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.472432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0088  Polyprenyl synthetase  45.27 
 
 		 311 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0102091  normal  0.401967 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3212  geranyltranstransferase  43.52 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000111364 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>