146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0922 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0922  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
300 aa  610  1e-173  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2122  acyltransferase  26.71 
 
 
298 aa  132  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.946895  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1857  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.57 
 
 
296 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2652  acyltransferase  30.17 
 
 
303 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1104  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.3 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1995  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.35 
 
 
288 aa  112  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.834184  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0549  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.28 
 
 
299 aa  112  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.3206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03895  hypothetical protein  26.62 
 
 
290 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0478  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.16 
 
 
299 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3516  glycosyl transferase family protein  27.01 
 
 
572 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3893  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
585 aa  96.7  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0336  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 
606 aa  95.9  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0347  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
606 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1376  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.27 
 
 
326 aa  94.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227614  hitchhiker  0.00151708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0345  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
610 aa  93.6  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3681  glycosyl transferase family protein  26.23 
 
 
610 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 
629 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
567 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0917  hypothetical protein  27.11 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3689  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
573 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.329039 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4766  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
573 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  25.72 
 
 
619 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  25.24 
 
 
623 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0342  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
619 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0800  hypothetical protein  25.56 
 
 
282 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3384  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.63 
 
 
552 aa  86.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0943  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.56 
 
 
306 aa  87  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0335  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
619 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4806  glycosyl transferase, family 2  26.06 
 
 
558 aa  86.3  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.705565  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4373  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.83 
 
 
594 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3059  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
575 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158212  normal  0.489966 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0066  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.89 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3989  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.99 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1990  acyltransferase  25.25 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.186271  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0932  hypothetical protein  27.21 
 
 
575 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2748  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  26.82 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252016  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3891  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
563 aa  82.8  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.845308 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4078  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 
568 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724186  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0434  hypothetical protein  24.76 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.037729  normal  0.512971 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3603  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
568 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4601  glycosyl transferase family protein  25.08 
 
 
567 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228674 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2067  acyltransferase  24.92 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.61 
 
 
302 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1320  hypothetical protein  27.34 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.605124  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004069  acyltransferase  26.52 
 
 
568 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0695  glycosyl transferase family protein  27.74 
 
 
593 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.841638 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.41 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0243  hypothetical protein  27.23 
 
 
299 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00785  hypothetical protein  25.74 
 
 
567 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2098  putative glycosyl transferase  26.23 
 
 
563 aa  78.2  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4175  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  28.19 
 
 
301 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0895  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
572 aa  78.2  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.661363  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0435  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.87 
 
 
320 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.646584  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0117  acyltransferase  23.38 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000125573  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4574  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
571 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03733  xanthomonadin biosynthesis acyltransferase  25.17 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3931  hypothetical protein  28.9 
 
 
323 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.959639  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3299  putative lauroyl/myristoyl acyltransferase involved in LPS biosynthesis  27.24 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.921474  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0307  hypothetical protein  24.36 
 
 
320 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3613  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.48 
 
 
300 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0319  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.36 
 
 
320 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.362183  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5098  hypothetical protein  26.88 
 
 
315 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4383  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.5 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0399697  normal  0.120258 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3918  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.26 
 
 
313 aa  70.1  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0999  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2099  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.31 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0432  hypothetical protein  28.12 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  24.33 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  22.66 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2753  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.25 
 
 
324 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.602528  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2177  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.54 
 
 
536 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000219359  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1688  hypothetical protein  24.87 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.426385  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0431  hypothetical protein  25.4 
 
 
323 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691434  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.02 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.19 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2814  acyltransferase-like protein  26.32 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2681  acyltransferase-like protein  26.32 
 
 
324 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.640182  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.73 
 
 
299 aa  63.5  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6092  acyltransferase-like  26.45 
 
 
327 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0436764  normal  0.372543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2148  acyltransferase-like  26.13 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2762  acyltransferase-like protein  26.13 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00399604  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3419  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.27 
 
 
342 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000119507  hitchhiker  0.000028719 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0306  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.8 
 
 
298 aa  59.3  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000601508  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2672  hypothetical protein  25.61 
 
 
332 aa  58.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.258257  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3063  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.88 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0505202  normal  0.2304 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.66 
 
 
307 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.83 
 
 
295 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.85 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.42 
 
 
302 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  24.1 
 
 
291 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.57 
 
 
295 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  18.58 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0972  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 
535 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000724117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.94 
 
 
303 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.53 
 
 
295 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2037  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.65 
 
 
310 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2101  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.04 
 
 
304 aa  52.8  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00461081  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.88 
 
 
334 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.29 
 
 
308 aa  52  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2112  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.41 
 
 
311 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.113083  normal  0.0192779 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>