More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2174 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  82.18 
 
 		 522 aa  897    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1721  2-isopropylmalate synthase  76.44 
 
 		 522 aa  826    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.455277 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  76.97 
 
 		 524 aa  844    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2174  2-isopropylmalate synthase  100 
 
 		 523 aa  1074    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0849  2-isopropylmalate synthase  83.78 
 
 		 523 aa  894    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.118383  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  53.37 
 
 		 525 aa  551  1e-156  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  54.47 
 
 		 532 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  54.18 
 
 		 517 aa  547  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0740  2-isopropylmalate synthase  52.65 
 
 		 537 aa  545  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.33125  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  52.49 
 
 		 505 aa  541  1e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  54 
 
 		 508 aa  545  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  53.28 
 
 		 509 aa  542  1e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  52.68 
 
 		 505 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  52.49 
 
 		 505 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  52.99 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  53.56 
 
 		 507 aa  538  9.999999999999999e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  53.27 
 
 		 509 aa  534  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1126  2-isopropylmalate synthase  52.52 
 
 		 536 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0478  2-isopropylmalate synthase  53.06 
 
 		 518 aa  530  1e-149  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0832  2-isopropylmalate synthase  51.64 
 
 		 536 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0860  2-isopropylmalate synthase  51.64 
 
 		 536 aa  527  1e-148  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1775  2-isopropylmalate synthase  53.66 
 
 		 516 aa  522  1e-147  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2253  2-isopropylmalate synthase  51.74 
 
 		 541 aa  520  1e-146  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.412449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0491  2-isopropylmalate synthase  52.35 
 
 		 504 aa  520  1e-146  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  51.56 
 
 		 512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  52.05 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0344  2-isopropylmalate synthase  52.12 
 
 		 541 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.46685 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0306  2-isopropylmalate synthase  50.7 
 
 		 503 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.168492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  52.5 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1193  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 504 aa  511  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.408954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1758  2-isopropylmalate synthase  51.29 
 
 		 520 aa  508  1e-143  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 521 aa  509  1e-143  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2111  2-isopropylmalate synthase  51.06 
 
 		 531 aa  507  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556699  normal  0.462239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1907  2-isopropylmalate synthase  51.49 
 
 		 513 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0903  2-isopropylmalate synthase  53.54 
 
 		 513 aa  507  9.999999999999999e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0384  2-isopropylmalate synthase  51.09 
 
 		 513 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1410  2-isopropylmalate synthase  51.06 
 
 		 540 aa  503  1e-141  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3325  2-isopropylmalate synthase  51.1 
 
 		 519 aa  504  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0367  2-isopropylmalate synthase  51.09 
 
 		 513 aa  503  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 515 aa  499  1e-140  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1897  2-isopropylmalate synthase  50.6 
 
 		 523 aa  499  1e-140  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1874  2-isopropylmalate synthase  49.8 
 
 		 522 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315845 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1981  2-isopropylmalate synthase  50.4 
 
 		 523 aa  498  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  51.39 
 
 		 515 aa  500  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11721  2-isopropylmalate synthase  49.52 
 
 		 546 aa  499  1e-140  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1344  2-isopropylmalate synthase  50.29 
 
 		 506 aa  499  1e-140  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  51 
 
 		 515 aa  498  1e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2041  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 511 aa  497  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1982  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 523 aa  498  1e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.527114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0438  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 504 aa  495  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.734565  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4323  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 530 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.712994  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2275  2-isopropylmalate synthase  50.99 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  51.89 
 
 		 511 aa  491  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0599  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.541423 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3268  2-isopropylmalate synthase  50.3 
 
 		 519 aa  489  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.983126  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1791  2-isopropylmalate synthase  50.2 
 
 		 514 aa  490  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.265436 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11711  2-isopropylmalate synthase  49.6 
 
 		 546 aa  489  1e-137  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1077  2-isopropylmalate synthase  49.4 
 
 		 546 aa  486  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0517  2-isopropylmalate synthase  50.59 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000128624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03085  2-isopropylmalate synthase  50.8 
 
 		 515 aa  486  1e-136  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11561  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 546 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0453  2-isopropylmalate synthase  52.08 
 
 		 510 aa  481  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1743  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.461114  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  49.3 
 
 		 499 aa  482  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0065  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 518 aa  482  1e-135  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0518457 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0335  2-isopropylmalate synthase  48.43 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15201  2-isopropylmalate synthase  47.58 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.381079  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4236  2-isopropylmalate synthase  50 
 
 		 522 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0686  2-isopropylmalate synthase  47.58 
 
 		 539 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0161169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2516  2-isopropylmalate synthase  51.18 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0505  2-isopropylmalate synthase  48.02 
 
 		 515 aa  480  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2096  2-isopropylmalate synthase  48.62 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0216  2-isopropylmalate synthase  49.31 
 
 		 519 aa  479  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.408005 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1889  2-isopropylmalate synthase  48.02 
 
 		 511 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  48.71 
 
 		 507 aa  478  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3588  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0368  2-isopropylmalate synthase  49.21 
 
 		 522 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3761  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 522 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.211233 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2477  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  48.13 
 
 		 510 aa  476  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0017  2-isopropylmalate synthase  48.02 
 
 		 511 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4208  2-isopropylmalate synthase  49.12 
 
 		 526 aa  474  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3071  2-isopropylmalate synthase  47.98 
 
 		 513 aa  472  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000941582 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1986  2-isopropylmalate synthase  48.81 
 
 		 503 aa  474  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.680034 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0397  2-isopropylmalate synthase  48.91 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563336 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3828  2-isopropylmalate synthase  48.32 
 
 		 523 aa  471  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.507391  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1939  2-isopropylmalate synthase  48.64 
 
 		 540 aa  475  1e-132  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0611  2-isopropylmalate synthase  50.1 
 
 		 514 aa  472  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0385  2-isopropylmalate synthase  48.62 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0334  2-isopropylmalate synthase  49.41 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42440  2-isopropylmalate synthase  49.61 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.892988  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0386  2-isopropylmalate synthase  48.62 
 
 		 522 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001656  2-isopropylmalate synthase  48.71 
 
 		 515 aa  474  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1183  2-isopropylmalate synthase  48.63 
 
 		 515 aa  472  1e-132  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2596  2-isopropylmalate synthase  50.69 
 
 		 513 aa  470  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2936  2-isopropylmalate synthase  47.04 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0411  2-isopropylmalate synthase  48.43 
 
 		 522 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000204337 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3472  2-isopropylmalate synthase  48.23 
 
 		 523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3405  2-isopropylmalate synthase  47.04 
 
 		 520 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>