More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1366 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_1366  hypothetical protein  100 
 
 
269 aa  538  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.504151  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0449  hypothetical protein  84.39 
 
 
327 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4169  hypothetical protein  68.77 
 
 
319 aa  384  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.719911  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4714  hypothetical protein  41.64 
 
 
337 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  43.12 
 
 
326 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5400  hypothetical protein  42.53 
 
 
322 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0715  hypothetical protein  41.83 
 
 
327 aa  209  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  41.33 
 
 
324 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  44.7 
 
 
323 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5882  extra-cytoplasmic solute receptor  42.15 
 
 
328 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  39.41 
 
 
325 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1908  hypothetical protein  41.83 
 
 
328 aa  205  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.865584  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4457  extra-cytoplasmic solute receptor  39.03 
 
 
327 aa  204  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00706561  normal  0.0529107 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1820  hypothetical protein  41.44 
 
 
328 aa  203  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.939306 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40.81 
 
 
333 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.97 
 
 
325 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.91 
 
 
328 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.91 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  40.68 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  42.75 
 
 
322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  38.29 
 
 
329 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  42.59 
 
 
349 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  37.64 
 
 
356 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.8 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.7 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.7 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.82 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  39.47 
 
 
325 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  39.77 
 
 
328 aa  192  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  36.4 
 
 
324 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40.89 
 
 
348 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  39.77 
 
 
328 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.48 
 
 
328 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  38.81 
 
 
325 aa  192  7e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  36.94 
 
 
325 aa  191  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  38.81 
 
 
327 aa  191  8e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  39.02 
 
 
339 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.1 
 
 
330 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  44.32 
 
 
330 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.1 
 
 
330 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  39.39 
 
 
335 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  36.9 
 
 
329 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.97 
 
 
327 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  38.31 
 
 
322 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 
331 aa  188  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  38.58 
 
 
358 aa  188  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  40.23 
 
 
335 aa  188  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1316  hypothetical protein  36.74 
 
 
334 aa  188  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.293847  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4184  hypothetical protein  38.95 
 
 
331 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.639585 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  38.2 
 
 
326 aa  187  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  37.22 
 
 
337 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  41.33 
 
 
338 aa  186  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  38.35 
 
 
321 aa  186  3e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.19 
 
 
304 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  37.83 
 
 
324 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  38.81 
 
 
331 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  39.1 
 
 
324 aa  185  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  40.23 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  40.91 
 
 
323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0363  hypothetical protein  36.9 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0180  hypothetical protein  33.83 
 
 
327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.3063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4820  hypothetical protein  38.46 
 
 
322 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3234  hypothetical protein  40.66 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.746028  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.38 
 
 
326 aa  183  3e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.48 
 
 
320 aa  182  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2485  hypothetical protein  38.29 
 
 
346 aa  183  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0644524  normal  0.0188147 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  38.46 
 
 
353 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3789  extra-cytoplasmic solute receptor  36.76 
 
 
326 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1840  hypothetical protein  39.25 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0526902  normal  0.401977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0840  hypothetical protein  39.26 
 
 
324 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270486  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3390  hypothetical protein  40.3 
 
 
330 aa  182  6e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.254723  normal  0.0522505 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  40.6 
 
 
331 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3672  hypothetical protein  33.7 
 
 
327 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.423242  normal  0.0951882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  38.24 
 
 
328 aa  181  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  38.06 
 
 
336 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  36.06 
 
 
335 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  36.92 
 
 
355 aa  180  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  36.5 
 
 
337 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  34.56 
 
 
328 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.09 
 
 
344 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4279  hypothetical protein  38.2 
 
 
356 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.877893  normal  0.56539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  36.16 
 
 
318 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4242  extra-cytoplasmic solute receptor  37.16 
 
 
330 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.289881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  39.39 
 
 
328 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  36.47 
 
 
328 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  38.2 
 
 
698 aa  178  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  37.31 
 
 
322 aa  178  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1198  hypothetical protein  32.22 
 
 
322 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.667586  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.93 
 
 
339 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  37.97 
 
 
361 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  38.32 
 
 
333 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  38.6 
 
 
339 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1190  hypothetical protein  36.16 
 
 
347 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1812  hypothetical protein  38.11 
 
 
326 aa  177  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  36.9 
 
 
310 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  37.45 
 
 
337 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4598  hypothetical protein  37.04 
 
 
332 aa  176  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  35.61 
 
 
325 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  36.53 
 
 
344 aa  176  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  38.72 
 
 
322 aa  176  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>