242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1076 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1076  anthranilate synthase component I and chorismate binding protein  100 
 
 		 91 aa  187  2.9999999999999997e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.151096 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0745  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  76.92 
 
 		 607 aa  156  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.766935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2324  chorismate binding enzyme  55.06 
 
 		 668 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3318  chorismate binding enzyme  55.06 
 
 		 668 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0503  chorismate binding enzyme  55.06 
 
 		 668 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.710623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1096  chorismate binding enzyme  55.06 
 
 		 668 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3275  para-aminobenzoate synthase, component I  55.06 
 
 		 668 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.964466  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3308  para-aminobenzoate synthase, component I  55.06 
 
 		 669 aa  104  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2203  para-aminobenzoate synthase, component I  55.06 
 
 		 668 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1310  chorismate binding enzyme  57.14 
 
 		 669 aa  103  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.255509  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0671  chorismate binding-like protein  52.81 
 
 		 648 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.117508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2495  para-aminobenzoate synthase, subunit I  52.94 
 
 		 621 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0270  para-aminobenzoate synthase, component I  51.76 
 
 		 637 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0754  para-aminobenzoate synthase, subunit I  51.76 
 
 		 637 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2631  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50.57 
 
 		 620 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3841  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  50.57 
 
 		 644 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2844  para-aminobenzoate synthase, subunit I  50 
 
 		 673 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0929877  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0648  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  50.57 
 
 		 639 aa  90.5  8e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0723  chorismate binding-like protein  50.57 
 
 		 635 aa  89.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2633  putative PARA-aminobenzoate synthetase component I protein  48.91 
 
 		 626 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2868  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.81 
 
 		 632 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0739  para-aminobenzoate synthase, subunit I  46.07 
 
 		 638 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.647067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2462  para-aminobenzoate synthase, subunit I  47.83 
 
 		 632 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0699736  normal  0.734756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3959  Para-aminobenzoate synthase, component I  44.94 
 
 		 640 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0742895 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2783  Para-aminobenzoate synthase, component I  46.81 
 
 		 595 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.688281  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2920  para-aminobenzoate synthase, component I  43.62 
 
 		 637 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.388176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3062  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.22 
 
 		 630 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2628  chorismate binding enzyme  42.7 
 
 		 623 aa  79.7  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.530164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0651  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.13 
 
 		 629 aa  69.3  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3087  Para-aminobenzoate synthase, component I  48.78 
 
 		 555 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972054  normal  0.655519 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0455  para-aminobenzoate synthase, subunit I  45.68 
 
 		 618 aa  63.5  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.68845 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2692  aminodeoxychorismate lyase apoprotein / aminodeoxychorismate synthase, subunit I  38.1 
 
 		 629 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0502  para-aminobenzoate synthase, subunit I  41.46 
 
 		 710 aa  60.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1683  Para-aminobenzoate synthase, component I  42.17 
 
 		 615 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2114  para-aminobenzoate synthase, subunit I  42.35 
 
 		 601 aa  58.5  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0490  para-aminobenzoate synthase, subunit I  40.45 
 
 		 607 aa  57.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.104803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0634  hypothetical protein  40.96 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0422  Para-aminobenzoate synthase, component I  41.46 
 
 		 590 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.744844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0607  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.74 
 
 		 574 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.120756  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4189  aminotransferase class IV  41.25 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1318  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0438396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1516  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1307  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.898461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1281  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00322304  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1449  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1416  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.493343  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1555  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.285962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3895  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1487  branched-chain amino acid aminotransferase  42.17 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0645  hypothetical protein  36.36 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0629  hypothetical protein  36.36 
 
 		 271 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3298  hypothetical protein  38.82 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0445  para-aminobenzoate synthase, component I  40 
 
 		 595 aa  54.3  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1280  branched-chain amino acid aminotransferase  40.96 
 
 		 298 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.668596  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0616  aminotransferase, class IV  34.09 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.27072  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1992  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.47 
 
 		 611 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0499  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.02 
 
 		 615 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0163  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.47 
 
 		 587 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0380  para-aminobenzoate synthase, subunit I  39.24 
 
 		 577 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0364924  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1357  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.55 
 
 		 635 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963322  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0179  aminotransferase class IV  39.53 
 
 		 271 aa  53.5  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.613423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0523  para-aminobenzoate synthase, component I  39.74 
 
 		 596 aa  52  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120338  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2639  aminotransferase class IV  36.36 
 
 		 298 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.30047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1131  branched chain amino acid: 2-keto-4-methylthiobutyrate aminotransferase  43.75 
 
 		 288 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1537  branched-chain amino acid aminotransferase  39.76 
 
 		 308 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42028  aminotransferase-like protein  30.12 
 
 		 294 aa  52.4  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0332  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.46 
 
 		 573 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42564e-18 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0939  para-aminobenzoate synthase, subunit I  34.88 
 
 		 591 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3496  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.36 
 
 		 599 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466989  normal  0.962279 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3704  hypothetical protein  34.12 
 
 		 214 aa  51.6  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2675  branched-chain amino acid aminotransferase  37.8 
 
 		 288 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1095  branched-chain amino acid aminotransferase, putative  36.78 
 
 		 244 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0167966  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2218  aminotransferase class IV  40.74 
 
 		 278 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522777  hitchhiker  0.00267671 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4262  hypothetical protein  34.12 
 
 		 211 aa  50.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2989  para-aminobenzoate synthase, subunit I  38.75 
 
 		 584 aa  50.4  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3314  anthranilate synthase component I/chorismate-binding protein  38.64 
 
 		 615 aa  50.8  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4434  hypothetical protein  42.35 
 
 		 192 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.883018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2032  branched-chain-amino-acid transaminase  38.89 
 
 		 285 aa  50.4  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000736742  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2604  aminotransferase class IV  46.15 
 
 		 270 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.946338  normal  0.143432 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3581  aminotransferase class IV  39.02 
 
 		 263 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000213768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0171  para-aminobenzoate synthase, component I  36.36 
 
 		 612 aa  50.4  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.394655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2480  branched-chain amino acid aminotransferase  36.25 
 
 		 293 aa  49.7  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000254665  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3010  Para-aminobenzoate synthase, component I  37.18 
 
 		 586 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.173618  normal  0.824102 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2216  aminotransferase class IV  32.95 
 
 		 250 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.556361  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3849  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.36 
 
 		 599 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0066  4-amino-4-deoxychorismate lyase  33.33 
 
 		 285 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2835  para-aminobenzoate synthase, subunit I  36.36 
 
 		 599 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.722861 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0074  hypothetical protein  35.29 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.452444  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1083  D-alanine aminotransferase  36.9 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1706  branched-chain amino acid aminotransferase  38.75 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.966018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2488  aminotransferase class IV  38.1 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0379  branched-chain amino acid aminotransferase  40.24 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1756  branched-chain amino acid aminotransferase  40.51 
 
 		 303 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000715407 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1444  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 299 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.224106  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1933  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.595721  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0079  hypothetical protein  35.29 
 
 		 226 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2686  hypothetical protein  34.12 
 
 		 208 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.531081 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0904  para-aminobenzoate synthase, component I  34.09 
 
 		 594 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1965  branched-chain amino acid aminotransferase  40 
 
 		 299 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2490  branched-chain amino acid aminotransferase  37.14 
 
 		 319 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>