52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1262 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1262  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  100 
 
 		 399 aa  771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6071  outer membrane efflux protein  35.39 
 
 		 486 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.362565  normal  0.0749065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1265  outer membrane efflux protein  36.73 
 
 		 481 aa  210  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000567174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2295  putative outer membrane efflux protein involved in copper resistance  34.07 
 
 		 476 aa  211  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.332291  normal  0.176348 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6292  outer membrane efflux protein  34.29 
 
 		 498 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.260908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0496  putative copper resistance-related lipoprotein  33.48 
 
 		 477 aa  199  7e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.620872 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4025  outer membrane efflux protein  34.74 
 
 		 470 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000146806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3911  outer membrane efflux protein  34.74 
 
 		 470 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0120008  normal  0.391344 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2041  outer membrane efflux protein  35.01 
 
 		 501 aa  196  7e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2657  outer membrane efflux protein  37.06 
 
 		 466 aa  195  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2911  copper tolerance protein  36.24 
 
 		 482 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0123072 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4754  outer membrane efflux protein  33.54 
 
 		 500 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.203593  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3413  outer membrane efflux protein  33.54 
 
 		 500 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4384  outer membrane efflux protein  31.5 
 
 		 485 aa  179  9e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4103  outer membrane efflux protein  33.77 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.733493  normal  0.726802 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0713  outer membrane efflux protein  35.14 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2765  outer membrane efflux protein  33.41 
 
 		 498 aa  178  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1090  outer membrane efflux protein  31.61 
 
 		 483 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0621  outer membrane efflux protein  35.14 
 
 		 554 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2008  copper tolerance protein  35.14 
 
 		 554 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3484  putative copper resistance-related lipoprotein  35.19 
 
 		 472 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4553  putative copper resistance-related lipoprotein  32.1 
 
 		 472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.910933 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4633  outer membrane efflux protein  31.65 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.706868  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1960  copper tolerance protein  34.98 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4826  outer membrane efflux protein  34.03 
 
 		 475 aa  169  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.836634  normal  0.338795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1209  copper tolerance protein  35.48 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0296816  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4601  outer membrane efflux protein  33.42 
 
 		 475 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.332073  normal  0.615443 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5687  putative copper resistance-related lipoprotein  34.68 
 
 		 475 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2599  copper tolerance protein  35.48 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0277245  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3982  putative metal ion efflux outer membrane protein  35.73 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2578  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 535 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0560227  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1030  outer membrane efflux protein  30.73 
 
 		 535 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4904  outer membrane efflux protein  30.72 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.878997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5189  outer membrane efflux protein  33.9 
 
 		 523 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3352  outer membrane efflux protein  33.76 
 
 		 512 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2723  putative copper resistance-related lipoprotein  35.62 
 
 		 476 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2199  putative copper resistance-related lipoprotein  34.75 
 
 		 476 aa  153  5e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2670  putative copper resistance-related lipoprotein  33.44 
 
 		 476 aa  151  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0933723  normal  0.360858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6518  putative Outer membrane efflux protein  31.1 
 
 		 475 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4267  copper tolerance protein  29.33 
 
 		 488 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.446194 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9851  copper tolerance protein  34.84 
 
 		 486 aa  149  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0118  putative copper resistance protein  31.01 
 
 		 543 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7875  outer membrane efflux protein  30.24 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.639992  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1205  Outer membrane protein-like protein  36.18 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1079  outer membrane efflux protein  33.48 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0935  outer membrane efflux protein  33.48 
 
 		 465 aa  140  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.365344  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1633  putative copper resistance-related lipoprotein  36.49 
 
 		 479 aa  137  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.158935 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5861  conserved hypothetical conserved membrane protein  31.16 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0736  putative copper resistance-related lipoprotein  29.43 
 
 		 475 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.83775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0314  outer membrane efflux protein  34.22 
 
 		 486 aa  99.8  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.116177  normal  0.192391 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5028  hypothetical protein  53.66 
 
 		 487 aa  96.3  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.924524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2225  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.17933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>