37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1884 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1884  CRISPR-associated Cas family protein  100 
 
 
248 aa  492  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.84969  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1676  CRISPR-associated Cas family protein  40.96 
 
 
243 aa  196  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.602428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0936  CRISPR-associated Cas family protein  41.91 
 
 
240 aa  187  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1394  CRISPR-associated Cas family protein  40.56 
 
 
247 aa  181  9.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2303  CRISPR-associated Cas family protein  43.78 
 
 
240 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0535  CRISPR-associated Cas family protein  40.71 
 
 
252 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0971  CRISPR-associated protein Cas6  36.29 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3942  CRISPR-associated protein Cas6  35.56 
 
 
246 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000148244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1190  CRISPR-associated protein Cas6  33.2 
 
 
248 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2327  CRISPR-associated Cas family protein  36.43 
 
 
251 aa  156  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4292  CRISPR-associated protein Cas6  36.99 
 
 
244 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.160921  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2618  CRISPR-associated protein Cas6  32.68 
 
 
267 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.032021  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0355  CRISPR-associated Cas family protein  37.85 
 
 
242 aa  148  8e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.935699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1817  CRISPR-associated Cas family protein  30.28 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.536762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0625  CRISPR-associated protein Cas6  33.99 
 
 
256 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0312  CRISPR-associated protein Cas6  32.67 
 
 
249 aa  141  9e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.196521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0467  CRISPR-associated protein Cas6  35.46 
 
 
250 aa  136  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.301145  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0271  CRISPR-associated Cas6 family protein  30.86 
 
 
257 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1768  CRISPR-associated Cas family protein  34.89 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0524  CRISPR-associated protein Cas6  27.1 
 
 
265 aa  100  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1099  CRISPR-associated Cas family protein  31.4 
 
 
250 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000187286  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1007  CRISPR-associated Cas family protein  28.8 
 
 
250 aa  95.1  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000750551  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2448  CRISPR-associated protein Cas6  26.89 
 
 
264 aa  93.6  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.970754  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2044  CRISPR-associated Cas family protein  26.14 
 
 
267 aa  89.7  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0876015  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1170  CRISPR-associated Cas family protein  28.05 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0816614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0438  CRISPR-associated protein Cas6  23.42 
 
 
266 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3847  CRISPR-associated protein Cas6  22.46 
 
 
291 aa  70.1  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0301  CRISPR-associated Cas6 family protein  29.6 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0414334  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1121  CRISPR-associated Cas6 family protein  31.21 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2028  CRISPR-associated Cas family protein  25.67 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1593  CRISPR-associated protein Cas6  26.05 
 
 
242 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.24413  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1224  CRISPR-associated protein Cas6  25.09 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1088  CRISPR-associated Cas family protein  23.62 
 
 
241 aa  46.2  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2009  CRISPR-associated protein Cas6  23.08 
 
 
242 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0121  CRISPR-associated protein Cas6  28.89 
 
 
261 aa  43.5  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.127158  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2020  CRISPR-associated Cas5e family protein  21.95 
 
 
221 aa  42.7  0.005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.13521 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2218  hypothetical protein  21.29 
 
 
266 aa  42.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.498101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>