250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1823 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1823  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 
335 aa  676    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.63 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000666316  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0076  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.73 
 
 
338 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0089  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.21 
 
 
337 aa  156  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000627651  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1242  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.93 
 
 
340 aa  149  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0655276  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.22 
 
 
343 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  25.21 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.51 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3642  heat-inducible transcription repressor  26.55 
 
 
352 aa  90.1  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.175788  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  30.32 
 
 
343 aa  89  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  22.16 
 
 
341 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  23.55 
 
 
344 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.3 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  26.24 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  21.11 
 
 
339 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.49 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0852  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.9 
 
 
352 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000798952  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.91 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.68 
 
 
339 aa  87  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  20.81 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  27.98 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.63 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.36 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.84 
 
 
345 aa  84  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4435  heat-inducible transcription repressor  23.24 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000489937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  25.77 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0801  heat-inducible transcription repressor  22.94 
 
 
338 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000436482  hitchhiker  4.70073e-19 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.87 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.75 
 
 
351 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4397  heat-inducible transcription repressor  22.94 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.332663  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4053  heat-inducible transcription repressor  22.94 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00744253  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1661  heat-inducible transcription repressor  21.39 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10502  normal  0.194823 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4338  heat-inducible transcription repressor  22.94 
 
 
338 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3771500000000003e-32 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  27.98 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4449  heat-inducible transcription repressor  22.94 
 
 
338 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000694366  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  27.89 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.99 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4215  heat-inducible transcription repressor  22.94 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.05 
 
 
344 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4541  heat-inducible transcription repressor  22.94 
 
 
338 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0123825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  21.35 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0763  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.78 
 
 
336 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.94526  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4063  heat-inducible transcription repressor  22.94 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.526253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  20.82 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4167  heat-inducible transcription repressor  23.24 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00317032  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  21.07 
 
 
339 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1025  heat-inducible transcription repressor  32.29 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000723404  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  27.6 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3579  heat-inducible transcription repressor  25.85 
 
 
354 aa  80.9  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.621722  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  23.96 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.29 
 
 
341 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.11 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1266  heat-inducible transcription repressor  29.36 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0103094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  26.84 
 
 
340 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5123  heat-inducible transcription repressor  22.6 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.779513  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.75 
 
 
344 aa  79.7  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3042  heat-inducible transcription repressor  22.48 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00211057  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1360  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.3 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.39 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  26.29 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  22.99 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  26.29 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  26.29 
 
 
347 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.45 
 
 
351 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.05 
 
 
341 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.63 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1133  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.51 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.382582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1998  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.7 
 
 
344 aa  78.6  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.503074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  27.33 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0820  heat-inducible transcription repressor  25.84 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000704325  normal  0.585042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.79 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  22.65 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1515  heat-inducible transcription repressor HrcA  24.7 
 
 
342 aa  77  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.38 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2083  heat-inducible transcription repressor  24.39 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.47918 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.91 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  25.62 
 
 
343 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.47 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0616  heat-inducible transcription repressor  22.41 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.868365  normal  0.54676 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1584  heat-inducible transcription repressor HrcA  25.21 
 
 
355 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0405407  normal  0.92109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  25.13 
 
 
343 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1162  heat-inducible transcription repressor  22.19 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1457  heat-inducible transcription repressor  21.17 
 
 
349 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0770785  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  27.37 
 
 
336 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0102  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.15 
 
 
363 aa  73.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.354305  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1424  negative regulator of class I heat shock protein  25.71 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0712  heat-inducible transcription repressor  43.37 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0259646  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  28.66 
 
 
340 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1210  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.21 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000297014  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1183  heat-inducible transcription repressor  20.78 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000556143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  23.03 
 
 
354 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0901  heat-inducible transcription repressor  23.82 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1663  heat-inducible transcription repressor  22.87 
 
 
367 aa  72  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.971027  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1086  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.57 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0111351  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  21.2 
 
 
345 aa  72  0.00000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0704  heat-inducible transcription repressor  23.13 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.114577  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1514  heat-inducible transcription repressor  20.86 
 
 
349 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0875  heat-inducible transcription repressor  23.82 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.71 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1902  heat-inducible transcription repressor HrcA  20.74 
 
 
350 aa  71.2  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.807416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>