More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1004 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1250  DNA mismatch repair protein MutS  50.43 
 
 		 823 aa  773    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.297858  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1001  DNA mismatch repair protein MutS  51.06 
 
 		 819 aa  800    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280502  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  47.25 
 
 		 793 aa  721    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  46.1 
 
 		 793 aa  724    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1004  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 817 aa  1644    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 872 aa  622  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  39.81 
 
 		 871 aa  611  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1478  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 		 828 aa  604  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  40.64 
 
 		 870 aa  602  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  40.85 
 
 		 881 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  43.86 
 
 		 910 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 910 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  42.84 
 
 		 873 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 869 aa  599  1e-170  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 869 aa  599  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 896 aa  598  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  41.18 
 
 		 932 aa  593  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  41.91 
 
 		 859 aa  593  1e-168  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  41.51 
 
 		 878 aa  591  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  42.15 
 
 		 858 aa  589  1e-167  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 857 aa  590  1e-167  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  40.65 
 
 		 872 aa  587  1e-166  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  39.9 
 
 		 873 aa  585  1.0000000000000001e-165  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  40.02 
 
 		 875 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.52 
 
 		 895 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  41.5 
 
 		 867 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 		 882 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  39.23 
 
 		 903 aa  579  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 		 860 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  38.23 
 
 		 870 aa  581  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  39.13 
 
 		 872 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  40.73 
 
 		 863 aa  580  1e-164  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  41.17 
 
 		 858 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  38.22 
 
 		 887 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  39.02 
 
 		 873 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 		 872 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 857 aa  573  1.0000000000000001e-162  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  38.61 
 
 		 889 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 890 aa  570  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 892 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  38.71 
 
 		 854 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 892 aa  570  1e-161  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 892 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 890 aa  569  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  39.72 
 
 		 900 aa  570  1e-161  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 892 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  41.53 
 
 		 858 aa  569  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 		 862 aa  571  1e-161  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 892 aa  569  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  38.06 
 
 		 860 aa  569  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 898 aa  567  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  39.83 
 
 		 894 aa  568  1e-160  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 872 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  39.45 
 
 		 890 aa  566  1e-160  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  38 
 
 		 872 aa  568  1e-160  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  38.37 
 
 		 864 aa  567  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  38.51 
 
 		 868 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  38.07 
 
 		 862 aa  568  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  39.33 
 
 		 892 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  38.98 
 
 		 863 aa  563  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0358  DNA mismatch repair protein MutS  38.52 
 
 		 918 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.613152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 853 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  39.16 
 
 		 858 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  38.36 
 
 		 855 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 		 865 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  39.07 
 
 		 871 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  38.94 
 
 		 859 aa  562  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 856 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3118  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 856 aa  559  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1671  DNA mismatch repair protein MutS  37.25 
 
 		 891 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207117  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  39.55 
 
 		 856 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 874 aa  561  1e-158  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  39.73 
 
 		 861 aa  560  1e-158  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2612  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 		 939 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1446  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.350724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  39.85 
 
 		 863 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  36.99 
 
 		 893 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2173  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.01775  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  39.48 
 
 		 872 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 862 aa  561  1e-158  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  38.54 
 
 		 856 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  38.55 
 
 		 863 aa  561  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  39.53 
 
 		 861 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 861 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3145  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 		 939 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  39.5 
 
 		 856 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  38.76 
 
 		 823 aa  556  1e-157  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  38.55 
 
 		 869 aa  556  1e-157  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  37.39 
 
 		 938 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  37.7 
 
 		 871 aa  556  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 		 858 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0670  DNA mismatch repair protein MutS  38.2 
 
 		 902 aa  557  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.48055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  36.33 
 
 		 896 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  37.1 
 
 		 870 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1195  DNA mismatch repair protein MutS  39.41 
 
 		 861 aa  558  1e-157  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  39.43 
 
 		 850 aa  558  1e-157  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3218  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 855 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.864156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3030  DNA mismatch repair protein MutS  38.58 
 
 		 855 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.32 
 
 		 863 aa  553  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  37.02 
 
 		 928 aa  555  1e-156  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>