More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2994 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2994  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  689    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  70.11 
 
 		 357 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3687  hypothetical protein  67.88 
 
 		 357 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000304887 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1702  permease, putative  67.6 
 
 		 357 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.303674  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1667  hypothetical protein  70.11 
 
 		 357 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1265  hypothetical protein  70.95 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0876555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1225  hypothetical protein  71.07 
 
 		 357 aa  454  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  69.49 
 
 		 354 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36860  hypothetical protein  75.36 
 
 		 368 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  54.75 
 
 		 363 aa  352  5.9999999999999994e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02243  permease  49.29 
 
 		 388 aa  314  9.999999999999999e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.41641  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0971  protein of unknown function UPF0118  51.63 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0710399 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0728  protein of unknown function UPF0118  46.31 
 
 		 363 aa  277  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0725  protein of unknown function UPF0118  47.43 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0808655  hitchhiker  0.000000275011 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0571  hypothetical protein  47.43 
 
 		 347 aa  261  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.442056  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2668  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.31 
 
 		 665 aa  243  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1648  hypothetical protein  49.4 
 
 		 385 aa  242  9e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00424749  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1718  permease  49.1 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0792158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  37.54 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  37.83 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2250  permease  49.85 
 
 		 368 aa  227  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  37.95 
 
 		 378 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2759  protein of unknown function UPF0118  42.15 
 
 		 368 aa  219  5e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.163255  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0555  protein of unknown function UPF0118  48.51 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3565  hypothetical protein  41.95 
 
 		 356 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.501523 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2453  protein of unknown function UPF0118  41.6 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.563612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1439  hypothetical protein  37.61 
 
 		 366 aa  216  5e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0335022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2859  protein of unknown function UPF0118  40.74 
 
 		 356 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0672  hypothetical protein  43.25 
 
 		 353 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2624  ABC transporter permease  41.03 
 
 		 356 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.138735  normal  0.255995 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  38.02 
 
 		 361 aa  209  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3329  hypothetical protein  43.38 
 
 		 365 aa  207  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63767  normal  0.12265 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2488  hypothetical protein  38.55 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1577  permease  38.99 
 
 		 379 aa  201  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  38.72 
 
 		 374 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2774  hypothetical protein  40.91 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0353755  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  38.24 
 
 		 398 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  35.2 
 
 		 415 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  40.06 
 
 		 374 aa  194  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  38.27 
 
 		 374 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0793  hypothetical protein  39.26 
 
 		 379 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.114477  normal  0.678459 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1300  hypothetical protein  39.29 
 
 		 434 aa  182  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.493989  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  35.18 
 
 		 452 aa  181  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_004310  BR0713  permease, putative  35.75 
 
 		 382 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1428  hypothetical protein  40.33 
 
 		 547 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0747  protein of unknown function UPF0118  38.95 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0336709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  37.54 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  37.54 
 
 		 375 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  35.47 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3952  hypothetical protein  37.76 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00873367 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  36.94 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2164  hypothetical protein  41.48 
 
 		 369 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2536  hypothetical protein  38.91 
 
 		 364 aa  177  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3129  hypothetical protein  36.26 
 
 		 418 aa  175  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2339  protein of unknown function UPF0118  37.18 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2065  hypothetical protein  37.18 
 
 		 370 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  0.0900338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  38.52 
 
 		 380 aa  172  5.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  38.84 
 
 		 382 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0400  hypothetical protein  38.15 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3023  putative permease transmembrane transport protein  42.12 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  33.43 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2025  protein of unknown function UPF0118  37.87 
 
 		 370 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.653838 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1477  protein of unknown function UPF0118  34.94 
 
 		 329 aa  162  6e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  33.54 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  32.95 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0766  hypothetical protein  32.58 
 
 		 404 aa  160  5e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.838264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  31.56 
 
 		 344 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  29.94 
 
 		 341 aa  155  8e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1144  hypothetical protein  26.53 
 
 		 354 aa  155  9e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00155039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1762  hypothetical protein  34.5 
 
 		 329 aa  154  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5162  hypothetical protein  36.94 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235316  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  28.87 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  26.92 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  25.36 
 
 		 351 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4237  hypothetical protein  27.79 
 
 		 355 aa  145  9e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4286  hypothetical protein  28.4 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4123  hypothetical protein  28.4 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4134  hypothetical protein  28.4 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4470  hypothetical protein  28.4 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000112475 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5545  protein of unknown function UPF0118  35.65 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0252141  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4618  hypothetical protein  28.4 
 
 		 355 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569611  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  29.17 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0910  hypothetical protein  28.46 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  26.46 
 
 		 349 aa  142  7e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  28.66 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  27.79 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  27.79 
 
 		 355 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  29.65 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  27.83 
 
 		 349 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0196  hypothetical protein  26.59 
 
 		 373 aa  136  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  31 
 
 		 345 aa  136  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2861  permease PerM  30.65 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2730  permease PerM  30.65 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2640  permease PerM  30.65 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.419277  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2752  permease PerM  30.65 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2688  permease PerM  30.65 
 
 		 355 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  30.48 
 
 		 350 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4523  hypothetical protein  28.7 
 
 		 355 aa  133  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0610501  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  25.82 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1420  hypothetical protein  24.31 
 
 		 402 aa  132  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0644646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>