50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2532 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2532  sterol-binding domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  208  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0766724  normal  0.1396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3466  hypothetical protein  88.24 
 
 		 104 aa  182  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40860  hypothetical protein  88.24 
 
 		 104 aa  182  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2458  sterol-binding  77.67 
 
 		 105 aa  163  8e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0333182  normal  0.0363969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2725  SCP-2 sterol transfer family protein  75.73 
 
 		 105 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3558  sterol-binding domain-containing protein  75.49 
 
 		 105 aa  157  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.336208  normal  0.355565 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3924  sterol-binding domain protein  75.49 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0884325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1911  sterol-binding domain-containing protein  75.49 
 
 		 105 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3213  sterol-binding domain-containing protein  75.49 
 
 		 105 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.533818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3116  sterol-binding  74.51 
 
 		 105 aa  157  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27580  Sterol-binding protein  68.63 
 
 		 104 aa  151  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1531  sterol-binding domain-containing protein  66.34 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00600993  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1939  sterol-binding  50.52 
 
 		 105 aa  111  3e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.530915  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1572  sterol-binding domain-containing protein  46.39 
 
 		 104 aa  100  7e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246813  hitchhiker  0.000825534 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1523  sterol-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 112 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0540458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2198  Sterol-binding domain protein  33.33 
 
 		 110 aa  70.5  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3405  hypothetical protein  35.92 
 
 		 115 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.952914  normal  0.525211 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0733  Sterol-binding domain protein  36.54 
 
 		 116 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0141  Sterol-binding domain protein  44.71 
 
 		 117 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1549  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 710 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1550  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 		 913 aa  57.8  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1772  sterol-binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0137  sterol-binding domain-containing protein  28.43 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0143  sterol-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.110171  decreased coverage  0.0000248953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0781  sterol-binding domain protein  42.31 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0276166  normal  0.045948 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1531  sterol-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.642179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4826  sterol-binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3088  Sterol-binding domain protein  34.83 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.54712 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2343  putative sterol carrier protein  28.44 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.606511  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3313  sterol-binding  39.24 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00254715  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0571  sterol-binding  34.69 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00913104  hitchhiker  0.00000396662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25410  JmjC-domain protein  30.21 
 
 		 375 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0341  putative transcriptional regulator  27.17 
 
 		 229 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1830  sterol-binding domain-containing protein  50 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.955664  normal  0.546759 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2459  sterol-binding protein  30.61 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.676777  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1608  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0960  sterol-binding domain-containing protein  39.24 
 
 		 179 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1526  Sterol-binding domain protein  27.52 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1621  Sterol-binding domain protein  27.52 
 
 		 110 aa  42.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0522723  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2973  hypothetical protein  43.14 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1641  transcription factor jumonji  29.17 
 
 		 373 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01560  sterol-binding protein  25.74 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1890  sterol-binding domain-containing protein  43.14 
 
 		 183 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.019099  hitchhiker  0.00481889 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2880  sterol-binding  37.5 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.933965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0774  beta-lactamase domain-containing protein  28.28 
 
 		 677 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6473  Sterol-binding domain protein  30.34 
 
 		 114 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2813  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 450 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0357883  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03915  hypothetical protein  27.27 
 
 		 661 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03955  predicted alkyl sulfatase  27.27 
 
 		 661 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.587237  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3943  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 661 aa  40.8  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>