57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1663 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1663  DNA-binding protein  100 
 
 
149 aa  300  5.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0991  protein of unknown function DUF296  52.08 
 
 
146 aa  152  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.825031  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10920  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  46.27 
 
 
140 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0220  hypothetical protein  42.55 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1110  hypothetical protein  44.03 
 
 
147 aa  110  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00185797  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0356  hypothetical protein  37.78 
 
 
142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2664  hypothetical protein  46.81 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.276535  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0490  hypothetical protein  40.44 
 
 
154 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2030  protein of unknown function DUF296  36.11 
 
 
143 aa  101  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.369285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1251  hypothetical protein  40.3 
 
 
135 aa  94.4  5e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0149  protein of unknown function DUF296  34.78 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1315  protein of unknown function DUF296  32.14 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.22327  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1618  protein of unknown function DUF296  34.06 
 
 
141 aa  77  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0764  protein of unknown function DUF296  33.09 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.218999  normal  0.4745 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05380  predicted DNA-binding protein with PD1-like DNA-binding motif  32.35 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0052  hypothetical protein  30.66 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0427014  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3691  protein of unknown function DUF296  32.86 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1994  protein of unknown function DUF296  30.71 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0700  hypothetical protein  30.61 
 
 
140 aa  60.8  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2721  hypothetical protein  29.17 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4305  hypothetical protein  28.81 
 
 
147 aa  57.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0835  protein of unknown function DUF296  29.93 
 
 
135 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0710  protein of unknown function DUF296  33.07 
 
 
169 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.804971 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3513  hypothetical protein  29.14 
 
 
158 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29448  predicted protein  31.58 
 
 
223 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0659224  normal  0.151084 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5223  hypothetical protein  32.29 
 
 
173 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17551  glutaredoxin  29.81 
 
 
201 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1066  hypothetical protein  27.47 
 
 
177 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.261002  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0734  hypothetical protein  23.57 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0718  hypothetical protein  23.57 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05593  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  30 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4183  protein of unknown function DUF296  29.9 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161362  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3311  hypothetical protein  31.15 
 
 
141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3233  hypothetical protein  31.15 
 
 
141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3308  hypothetical protein  31.15 
 
 
141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3413  hypothetical protein  31.15 
 
 
141 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.539764  normal  0.100868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4388  hypothetical protein  32.94 
 
 
285 aa  47  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.112104  normal  0.0499819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0588  hypothetical protein  31.31 
 
 
200 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4696  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.502558  normal  0.26797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5604  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184581  normal  0.849139 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3671  hypothetical protein  31.25 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.263926  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13731  hypothetical protein  30.3 
 
 
200 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.603876 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3244  hypothetical protein  29.75 
 
 
141 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.61827  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000003  predicted DNA-binding protein  28.46 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0764  hypothetical protein  28.16 
 
 
200 aa  43.9  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3353  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1894  hypothetical protein  29.59 
 
 
202 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.926042 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4225  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5456  hypothetical protein  32.32 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1123  hypothetical protein  26.77 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0502551  normal  0.204909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1086  hypothetical protein  27.14 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3258  hypothetical protein  29.29 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.343933  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4088  hypothetical protein  30.69 
 
 
133 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0011  hypothetical protein  27.41 
 
 
144 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0531  hypothetical protein  27.56 
 
 
130 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4553  hypothetical protein  30.69 
 
 
133 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0452809 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3065  hypothetical protein  27.55 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0546245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>