More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1024 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 682 aa  1393    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 686 aa  355  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1098  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 633 aa  313  4.999999999999999e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0013981  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0377  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 		 673 aa  300  5e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  27.23 
 
 		 696 aa  193  9e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.98 
 
 		 1273 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 		 1009 aa  160  8e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 686 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000161382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1256  histidine kinase  26.48 
 
 		 652 aa  144  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1562  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 680 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.327156  normal  0.581936 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5379  histidine kinase  24.92 
 
 		 698 aa  134  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5380  histidine kinase  23.93 
 
 		 689 aa  111  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  28.66 
 
 		 586 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 564 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  23.59 
 
 		 795 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  34.05 
 
 		 529 aa  105  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.968492 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  33.63 
 
 		 535 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.05 
 
 		 656 aa  103  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 535 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4796  sensor histidine kinase  21.17 
 
 		 668 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3784  histidine kinase  31.2 
 
 		 496 aa  101  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4322  histidine kinase  24.59 
 
 		 636 aa  100  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.461598  normal  0.0714354 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3783  Cache sensor signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 708 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1550  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.58 
 
 		 531 aa  100  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal  0.141787 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 602 aa  98.2  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 478 aa  97.8  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  30.29 
 
 		 488 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3766  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  22.03 
 
 		 802 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0676736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  28.51 
 
 		 908 aa  96.3  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0207  histidine kinase  30.2 
 
 		 566 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2761  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 679 aa  95.9  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.47205 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4339  sensor histidine kinase  21.31 
 
 		 677 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.691571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1862  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 349 aa  95.5  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00141174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3492  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 456 aa  95.5  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0651449 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 474 aa  94.7  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.130107  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  30.31 
 
 		 897 aa  95.1  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  28.51 
 
 		 908 aa  94.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  28.4 
 
 		 908 aa  94.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  30.89 
 
 		 906 aa  94.4  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3143  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.36 
 
 		 436 aa  94  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1900  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 1057 aa  93.6  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.053752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11630  putative two-component sensor  28.22 
 
 		 766 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0288  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 884 aa  92.8  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1893  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.54 
 
 		 644 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1069  CHASE domain-containing protein/sensory box histidine kinase  28.22 
 
 		 751 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4944  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  20.81 
 
 		 782 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.947631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 763 aa  92  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  31.42 
 
 		 1303 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3468  sensor histidine kinase  22.26 
 
 		 651 aa  92.4  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 		 816 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 348 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3387  histidine kinase  29.36 
 
 		 593 aa  91.7  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00490  sensor protein BarA  22.1 
 
 		 1042 aa  91.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 348 aa  90.9  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  27.05 
 
 		 356 aa  90.9  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 487 aa  90.9  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2945  histidine kinase  31.11 
 
 		 451 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 		 421 aa  90.5  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  29.64 
 
 		 1535 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05790  transmembrane signal transduction protein  30.68 
 
 		 634 aa  90.1  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3939  response regulator receiver domain-containing protein  26.16 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.238688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  27.27 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 456 aa  90.5  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 754 aa  90.5  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  30.05 
 
 		 422 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 463 aa  89.7  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  27.02 
 
 		 406 aa  89.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_927  two-component system, OmpR family, sensor kinase  29.07 
 
 		 470 aa  89.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.917191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  29.09 
 
 		 1162 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  27.34 
 
 		 885 aa  89  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 539 aa  89  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 356 aa  88.6  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 932 aa  88.6  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 763 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  26.21 
 
 		 348 aa  88.2  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  28.15 
 
 		 378 aa  88.6  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00652  fused sensory histidine kinase in two-component regulatory system with KdpE: signal sensing protein  25.82 
 
 		 895 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0554  sensor protein KdpD  25.82 
 
 		 894 aa  87.8  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0721  sensor protein KdpD  25.82 
 
 		 894 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.594911  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0717  sensor protein KdpD  25.82 
 
 		 894 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.649763  normal  0.772603 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0788  sensor protein KdpD  25.82 
 
 		 894 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.65 
 
 		 844 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00643  hypothetical protein  25.82 
 
 		 894 aa  88.2  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0742  sensor protein KdpD  25.82 
 
 		 894 aa  87.8  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2941  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 894 aa  87.8  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 		 356 aa  87.8  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 452 aa  87.8  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 763 aa  87.4  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  28.33 
 
 		 993 aa  87  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2914  Signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 456 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.435498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  28.09 
 
 		 910 aa  86.7  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 844 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 438 aa  87  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.56 
 
 		 752 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.09 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2961  sensor protein KdpD  26.12 
 
 		 895 aa  86.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.647759 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>