More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0923 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0923  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  100 
 
 
318 aa  649    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1528  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  72.96 
 
 
320 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0994  alcohol dehydrogenase  69.18 
 
 
318 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1109  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  67.61 
 
 
318 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1181  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  62.89 
 
 
319 aa  431  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.531712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1497  chlorobiumquinone synthase BchC related protein  63.52 
 
 
318 aa  421  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.132648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1445  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  61.64 
 
 
318 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3261  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
327 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0255944 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1534  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.36 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00910743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3747  alcohol dehydrogenase  27.81 
 
 
323 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00165792  hitchhiker  0.00000793402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1422  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  26.81 
 
 
334 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3128  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  26.71 
 
 
328 aa  107  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0401  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  27.11 
 
 
332 aa  105  7e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.632471  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0938  chlorophyll synthesis pathway, BchC  25.24 
 
 
325 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0980  chlorophyll synthesis pathway, BchC  26.73 
 
 
334 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0898  chlorophyll synthesis pathway, BchC  24.29 
 
 
334 aa  90.9  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.714457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3696  chlorophyll synthesis pathway, BchC  26.11 
 
 
312 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  hitchhiker  0.00324331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1791  chlorophyll synthesis pathway, BchC  22.42 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.916125  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1611  chlorophyll synthesis pathway, BchC  24.76 
 
 
327 aa  80.1  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2180  putative zinc-containing alcohol dehydrogenase  24.23 
 
 
327 aa  69.3  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2269  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.8 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.992449  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2851  chlorophyll synthesis pathway, BchC  27.36 
 
 
312 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.754242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2981  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide  23.9 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.383171  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2729  chlorophyll synthesis pathway, BchC  25.94 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195631  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3516  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  21.73 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.549552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3032  alcohol dehydrogenase  23.14 
 
 
357 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0127  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.06 
 
 
345 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2956  chlorophyll synthesis pathway, BchC  26.09 
 
 
312 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.106767 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00443  alcohol dehydrogenase, zinc-containing, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04620)  22.35 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.712673  normal  0.179972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3300  alcohol dehydrogenase  23.82 
 
 
337 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0441476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5306  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  24.38 
 
 
329 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3133  alcohol dehydrogenase  22.22 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0832  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  25.77 
 
 
316 aa  63.2  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2051  chlorophyll synthesis pathway, BchC  25.16 
 
 
315 aa  63.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0614897 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1709  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.42 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2037  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.27 
 
 
318 aa  62.4  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.228307  normal  0.0545701 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2331  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  29.1 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.528911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4002  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  21.15 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.232331  decreased coverage  0.000580255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2642  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  29.06 
 
 
308 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00170598  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0263  chlorophyll synthesis pathway, bchC  23.58 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0233  alcohol dehydrogenase  23.88 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6438  2-desacetyl-2-hydroxyethyl bacteriochlorophyllide A dehydrogenase  25.24 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0239  alcohol dehydrogenase  23.88 
 
 
351 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1907  chlorophyll synthesis pathway, BchC  23.58 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal  0.343747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2604  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.74 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000105247  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06260  zinc-binding dehydrogenase, putative  23.03 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.040279  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3492  hypothetical protein  23.67 
 
 
342 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.835811  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2189  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.47 
 
 
346 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2498  sorbitol dehydrogenase  22.49 
 
 
347 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.503095  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2059  sorbitol dehydrogenase  23.02 
 
 
347 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  hitchhiker  0.0031409 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0577  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.47 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.105265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0351  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  22.47 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1417  sorbitol dehydrogenase  22.49 
 
 
347 aa  60.1  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2163  alcohol dehydrogenase  25.57 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2765  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family superfamily  28.57 
 
 
213 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000378311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01743  predicted oxidoreductase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  22.15 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.778779  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2056  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.03 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1868  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  22.15 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000261586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2412  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.41 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0431733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2606  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  28.41 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000263757 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2588  alcohol dehydrogenase  28.41 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01731  hypothetical protein  22.15 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.948294  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2819  chlorophyll synthesis pathway, BchC  24.37 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370469  normal  0.373141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1286  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  25 
 
 
346 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3757  chlorophyll synthesis pathway protein BchC  21.79 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00485804 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2561  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  26.86 
 
 
308 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3340  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.49 
 
 
356 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1780  threonine dehydrogenase or related Zn-dependent dehydrogenase  23.29 
 
 
337 aa  58.2  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1858  alcohol dehydrogenase  22.15 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.368595  hitchhiker  0.0000214432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4106  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  22.78 
 
 
336 aa  57  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.82135  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0633  alcohol dehydrogenase  24 
 
 
317 aa  57  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1998  sorbitol dehydrogenase  22.15 
 
 
347 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.329256  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0885  alcohol dehydrogenase  24.22 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1044  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  24.82 
 
 
335 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4137  alcohol dehydrogenase  22.78 
 
 
336 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.31521  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4677  alcohol dehydrogenase  24.29 
 
 
347 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1176  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  24.77 
 
 
344 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136787  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0153  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.5 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.568823  normal  0.158485 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2463  alcohol dehydrogenase  24.04 
 
 
338 aa  55.8  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4931  alcohol dehydrogenase  21.41 
 
 
337 aa  56.2  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2436  alcohol dehydrogenase  22.97 
 
 
345 aa  55.8  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4352  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  22.78 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1258  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
344 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0672332  normal  0.983976 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0475  alcohol dehydrogenase  22.65 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03240  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  21.02 
 
 
358 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000129511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1823  alcohol dehydrogenase  22.51 
 
 
350 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00496203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0827  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.55 
 
 
347 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4509  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.09 
 
 
343 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5128  zinc-binding dehydrogenase  23.49 
 
 
337 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6416  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.45 
 
 
343 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124082  normal  0.304265 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3998  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  25 
 
 
333 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.235514 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0614  alcohol dehydrogenase  24.68 
 
 
318 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0116847  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2713  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  22.39 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0389  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  21.89 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22350  Zn-dependent oxidoreductase, NADPH:quinone reductase  25.9 
 
 
327 aa  54.3  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3236  alcohol dehydrogenase  28.77 
 
 
311 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0698  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  23.14 
 
 
349 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0609  alcohol dehydrogenase  22.13 
 
 
352 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0295083  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13100  L-threonine 3-dehydrogenase  21.71 
 
 
336 aa  53.5  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3621  alcohol dehydrogenase  25 
 
 
347 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>