106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4112 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_4112  polysaccharide export protein  100 
 
 		 378 aa  761    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  28.08 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  27.72 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  24.31 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  26.86 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  28.52 
 
 		 388 aa  70.5  0.00000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  25.62 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  27.05 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  24.56 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  25.16 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.06 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  27.25 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2837  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 636 aa  62.8  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.823909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  26.09 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2210  polysaccharide export outer membrane protein  27.03 
 
 		 357 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  26.69 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  31.65 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  23.33 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  24.53 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  30.81 
 
 		 276 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  25 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  28.04 
 
 		 374 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  24.81 
 
 		 372 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  27.13 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  29.67 
 
 		 270 aa  53.9  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  30.7 
 
 		 277 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.77 
 
 		 373 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  25.26 
 
 		 431 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 363 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  28.79 
 
 		 309 aa  52.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  37 
 
 		 992 aa  52.4  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  26.73 
 
 		 379 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  25.53 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  32.41 
 
 		 264 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  24.52 
 
 		 827 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  31.01 
 
 		 184 aa  51.2  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  33.61 
 
 		 992 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  28.5 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  25.14 
 
 		 307 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  22.37 
 
 		 358 aa  50.1  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  25.58 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  25.44 
 
 		 333 aa  50.1  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  22.81 
 
 		 347 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0648  polysaccharide export periplasmic protein  24.26 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0639138  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  22.95 
 
 		 919 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  22.89 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  25.18 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  24.25 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  26.73 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  25.87 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  24.57 
 
 		 576 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  27.33 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  23.88 
 
 		 800 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.38 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  24.82 
 
 		 368 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  31.62 
 
 		 288 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.38 
 
 		 400 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  25.71 
 
 		 243 aa  47  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  24.27 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  23.41 
 
 		 940 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 910 aa  47  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  25.18 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  24.43 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  25.09 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  24.66 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  24.48 
 
 		 282 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  25.91 
 
 		 407 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  22.44 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  25.18 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  25.18 
 
 		 387 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.05 
 
 		 422 aa  47  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  31.03 
 
 		 869 aa  46.6  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  27.52 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  24.24 
 
 		 348 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  23.57 
 
 		 365 aa  46.6  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  24.46 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  25 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 392 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  24.43 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  24.74 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  25.33 
 
 		 391 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 402 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  22.43 
 
 		 358 aa  45.4  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  31.87 
 
 		 208 aa  44.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  22.71 
 
 		 417 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  23.87 
 
 		 428 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  24.39 
 
 		 803 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  21.54 
 
 		 473 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  31.82 
 
 		 153 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  28.74 
 
 		 440 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  26.64 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  27.07 
 
 		 205 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  27.15 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  22.43 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  25.1 
 
 		 422 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  24.04 
 
 		 1055 aa  43.1  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.925852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>