41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3971 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3971  protein of unknown function DUF1549  100 
 
 
759 aa  1572    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1450  protein of unknown function DUF1549  36.22 
 
 
833 aa  457  1e-127  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1151  protein of unknown function DUF1549  36.1 
 
 
1737 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4094  protein of unknown function DUF1549  32.55 
 
 
998 aa  332  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0957  protein of unknown function DUF1549  28.63 
 
 
785 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.244644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1040  protein of unknown function DUF1549  29.36 
 
 
768 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0289706  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0522  protein of unknown function DUF1549  28.8 
 
 
626 aa  203  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2090  protein of unknown function DUF1549  27.12 
 
 
1178 aa  177  9e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0353884  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1120  protein of unknown function DUF1549  31.12 
 
 
841 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0525  protein of unknown function DUF1549  25.59 
 
 
893 aa  160  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.491399  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1826  protein of unknown function DUF1549  25.05 
 
 
562 aa  136  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.353964  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3719  protein of unknown function DUF1549  35.63 
 
 
725 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1978  protein of unknown function DUF1549  22.85 
 
 
772 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.558738  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1727  protein of unknown function DUF1549  24.91 
 
 
565 aa  122  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0959  protein of unknown function DUF1549  22.9 
 
 
776 aa  119  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185846 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1595  protein of unknown function DUF1549  22.41 
 
 
765 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.599315  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1334  protein of unknown function DUF1549  26.3 
 
 
1068 aa  99.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3229  protein of unknown function DUF1549  28.57 
 
 
1171 aa  98.2  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  25.63 
 
 
1091 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0775  protein of unknown function DUF1549  28.24 
 
 
883 aa  95.5  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.68888  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1890  protein of unknown function DUF1549  24 
 
 
922 aa  94  9e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2715  protein of unknown function DUF1549  26.32 
 
 
911 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.328097  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0575  hypothetical protein  31.31 
 
 
782 aa  92  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3816  protein of unknown function DUF1549  27.31 
 
 
984 aa  91.7  5e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3131  protein of unknown function DUF1549  27.83 
 
 
792 aa  91.7  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0333  protein of unknown function DUF1549  26.53 
 
 
1074 aa  91.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0087202 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0517  protein of unknown function DUF1549  30.56 
 
 
1063 aa  90.5  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5453  protein of unknown function DUF1549  26.57 
 
 
924 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.996886  normal  0.769679 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2165  protein of unknown function DUF1549  24.76 
 
 
963 aa  89.7  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1046  protein of unknown function DUF1549  28.1 
 
 
1066 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0815  hypothetical protein  26.54 
 
 
1074 aa  87  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3702  protein of unknown function DUF1549  27.78 
 
 
922 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1796  protein of unknown function DUF1549  26.11 
 
 
1013 aa  85.1  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2950  protein of unknown function DUF1549  27.03 
 
 
1046 aa  84.3  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.798695  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2794  protein of unknown function DUF1549  29.27 
 
 
1129 aa  84  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0191241  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1739  protein of unknown function DUF1549  26.64 
 
 
805 aa  83.2  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3921  protein of unknown function DUF1549  27.4 
 
 
1097 aa  77  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4084  protein of unknown function DUF1549  25.36 
 
 
917 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0328965  normal  0.233316 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0378  protein of unknown function DUF1549  25.36 
 
 
1067 aa  71.2  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00109161  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5932  protein of unknown function DUF1549  23.67 
 
 
1182 aa  70.9  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453716  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1526  protein of unknown function DUF1549  38.54 
 
 
888 aa  64.3  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.093283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>