295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2190 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2190  segregation and condensation protein B  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1222  segregation and condensation protein B  38.92 
 
 		 282 aa  137  1e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.11077  normal  0.29545 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0142  condensin subunit ScpB  35.84 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1690  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 206 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1884  segregation and condensation protein B  39.62 
 
 		 195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000125518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1318  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.321571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1360  condensin subunit ScpB  38.86 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1683  condensin subunit ScpB  41.4 
 
 		 387 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0662969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2759  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 		 299 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.331589  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0541  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 224 aa  112  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1417  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 171 aa  111  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02284  hypothetical protein  37.36 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.30198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2173  segregation and condensation protein B  40.76 
 
 		 372 aa  111  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2262  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.76 
 
 		 387 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.421554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09630  segregation and condensation protein B  37.58 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0854022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2313  putative transcriptional regulator  38.25 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2121  putative transcriptional regulator  36.87 
 
 		 352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.221388  normal  0.149139 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2614  condensin subunit ScpB  39.29 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00467525  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0777  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.25 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.194303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1418  condensin subunit ScpB  41.51 
 
 		 274 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1651  segregation and condensation protein B  36.42 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.742726 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2825  putative transcriptional regulator  38.12 
 
 		 250 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.994301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1285  hypothetical protein  40.62 
 
 		 304 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0167657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1206  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.24 
 
 		 389 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224346  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1066  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 442 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1492  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.5 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0987  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 442 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0179  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 442 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00549366  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1511  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 442 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1113  segregation and condensation protein B  40.24 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.411442  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2456  condensin subunit ScpB  38.99 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0826453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1736  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 455 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0336275  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1911  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 456 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.436133  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2568  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 458 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0143518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1758  segregation and condensation protein B  40.88 
 
 		 456 aa  107  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.304009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2002  condensin subunit ScpB  39.52 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0508753  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2181  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  41.88 
 
 		 281 aa  106  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0440  segregation and condensation protein B  35.85 
 
 		 206 aa  106  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000447089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5640  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.49 
 
 		 534 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90406  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1927  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.94 
 
 		 192 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0086  putative transcriptional regulator  40.12 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1733  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 360 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpB  41.71 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3424  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.85 
 
 		 196 aa  105  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1084  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  39.88 
 
 		 234 aa  104  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4637  condensin subunit ScpB  40.88 
 
 		 343 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0490684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1164  condensin subunit ScpB  39.88 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1418  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 		 340 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.201173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1628  segregation and condensation protein B  39.62 
 
 		 394 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189744  hitchhiker  0.00787891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1472  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1015  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1378  putative transcriptional regulator  40.25 
 
 		 340 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.477089  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1328  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.65 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.287533 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1496  putative transcriptional regulator  40.88 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3014  hypothetical protein  42.86 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2296  segregation and condensation protein B  35.67 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2032  condensin subunit ScpB  35.83 
 
 		 311 aa  103  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0392  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1040  chromosome segregation and condensation protein ScpB  37.72 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2756  segregation and condensation protein B  35.71 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1866  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.391123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1466  condensin subunit ScpB  42.86 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1532  condensin subunit ScpB  42.86 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.104314  normal  0.016321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1524  condensin subunit ScpB  42.86 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434208 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2232  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.13 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0160182  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1688  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40.49 
 
 		 200 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.145161  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3496  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.147487  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1759  segregation and condensation protein B  40.25 
 
 		 349 aa  102  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.450892  normal  0.0114777 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5025  segregation and condensation protein B  43.31 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.354604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1918  segregation and condensation protein B  36.31 
 
 		 191 aa  102  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.001088 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1231  putative transcriptional regulator  38.01 
 
 		 254 aa  102  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.457118  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2035  condensin subunit ScpB  40 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.401895 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2874  segregation and condensation protein B  39.08 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2125  putative transcriptional regulator  38.92 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2797  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2824  condensin subunit ScpB  38.99 
 
 		 408 aa  100  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1927  segregation and condensation protein B  36.65 
 
 		 282 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.121193  normal  0.224163 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2399  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.093672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1647  segregation and condensation protein B  40.99 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0202301  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19890  condensin subunit ScpB  35.23 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2206  segregation and condensation protein B  40.12 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1668  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  42.86 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000398849  hitchhiker  0.000392902 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1998  segregation and condensation protein B  32.7 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1269  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.68 
 
 		 208 aa  100  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.766726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2718  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.752294  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1873  condensin subunit ScpB  38.36 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2697  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0794  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  30.99 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0476  segregation and condensation protein B  33.54 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1135  putative transcriptional regulator  37.04 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5426  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  36.94 
 
 		 193 aa  99.8  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2135  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  37.2 
 
 		 174 aa  99  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2831  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  40 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00534313  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1567  putative transcriptional regulator  33.93 
 
 		 168 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0426273  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1595  hypothetical protein  42.74 
 
 		 193 aa  99  5e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0850  condensin subunit ScpB  38.04 
 
 		 287 aa  98.6  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0321676  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1746  chromosome segregation and condensation protein, ScpB  34.64 
 
 		 190 aa  99  5e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07180  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 179 aa  99  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000744296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0688  condensin subunit ScpB  34.38 
 
 		 198 aa  98.6  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1205  condensin subunit ScpB  37.58 
 
 		 193 aa  98.2  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>