90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3335 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3335  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 311 aa  629  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.593309  normal  0.179661 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1798  beta-lactamase-like  35.76 
 
 		 306 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24810  hypothetical protein  25.15 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2102  hypothetical protein  25.15 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5130  beta-lactamase domain protein  28.49 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  33.54 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  31.32 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1829  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0164526  normal  0.939049 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3407  beta-lactamase domain-containing protein  27.4 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  31.01 
 
 		 319 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  33.62 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  37.61 
 
 		 309 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  32.52 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  32.05 
 
 		 326 aa  53.9  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  28.39 
 
 		 305 aa  53.1  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 		 306 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0375  beta-lactamase domain-containing protein  28.49 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  29.3 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4084  beta-lactamase-like  28.24 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1256  Beta-lactamase-like  25.57 
 
 		 253 aa  50.8  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.812248  normal  0.015481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5309  beta-lactamase domain-containing protein  28.74 
 
 		 308 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0986  putative Zn-dependent hydrolases including glyoxylases  25.31 
 
 		 271 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3721  Beta-lactamase-like  30.26 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2345  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 261 aa  50.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000431661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3778  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 284 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4530  beta-lactamase domain-containing protein  24.9 
 
 		 249 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3366  beta-lactamase domain protein  28.77 
 
 		 210 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  28.78 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5016  beta-lactamase domain-containing protein  28.16 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.348107  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  26.74 
 
 		 312 aa  49.3  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4928  beta-lactamase-like protein  28.16 
 
 		 308 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2162  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 266 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 310 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3861  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 		 284 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4355  beta-lactamase domain protein  29.11 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.112156  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6698  beta-lactamase domain protein  28.65 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.386764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3174  metallo-beta-lactamase family protein  23.81 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0580046  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0685  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 282 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2747  beta-lactamase domain protein  24.03 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000061578  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3391  putative metallo-beta-lactamase family protein  25.32 
 
 		 266 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3685  beta-lactamase domain-containing protein  29.38 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265853  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1790  metallo-beta-lactamase family protein  24 
 
 		 250 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6025  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.706578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5781  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.14 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000796102  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2130  beta-lactamase-like protein  27.48 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3514  metallo-beta-lactamase family protein  25.14 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3474  metallo-beta-lactamase family protein  25.14 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3259  metallo-beta-lactamase family protein  25.14 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0731029  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  27.67 
 
 		 330 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2405  beta-lactamase-like  29.71 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2949  beta-lactamase domain-containing protein  29.31 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.161977  normal  0.098851 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  28.83 
 
 		 285 aa  47  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4233  Beta-lactamase-like  27.95 
 
 		 282 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  29.63 
 
 		 211 aa  46.6  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  28.95 
 
 		 312 aa  46.6  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3458  metallo-beta-lactamase family protein  25.14 
 
 		 250 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0113378  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4911  beta-lactamase domain protein  24.64 
 
 		 282 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0157  metallo-beta-lactamase family protein  29.27 
 
 		 312 aa  46.2  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.233934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 		 301 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1080  beta-lactamase domain-containing protein  25.35 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.0034606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3466  metallo-beta-lactamase family protein  24.57 
 
 		 250 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.285318  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1208  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  25.45 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6162  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5798  beta-lactamase-like  27.27 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  26.11 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6643  beta-lactamase domain-containing protein  28.98 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3166  beta-lactamase domain-containing protein  24.86 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0049  beta-lactamase domain-containing protein  26.54 
 
 		 635 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  29.49 
 
 		 326 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  27.59 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  31.62 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4140  beta-lactamase domain protein  23.47 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0309  beta-lactamase domain-containing protein  26.09 
 
 		 639 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1837  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1802  beta-lactamase domain-containing protein  22.75 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 321 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 		 320 aa  43.5  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3246  hypothetical protein  22.6 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  28.32 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0539  Zn-dependent hydrolase, including glyoxylase  25.15 
 
 		 210 aa  43.1  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  30.43 
 
 		 210 aa  42.7  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  24.28 
 
 		 277 aa  42.7  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 210 aa  42.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  27.61 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2937  metal-dependent hydrolase  21.92 
 
 		 287 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3000  hypothetical protein  21.8 
 
 		 282 aa  42.4  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.115353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>