More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3296 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3296  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  322  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1576  hypothetical protein  48.32 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.667817  normal  0.289363 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1330  hypothetical protein  46.85 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.519307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1521  hypothetical protein  45.75 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.661029  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2438  hypothetical protein  40.71 
 
 		 151 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.284994  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1391  hypothetical protein  43.14 
 
 		 148 aa  120  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.230903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2554  hypothetical protein  46.85 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572152  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1110  Mammalian cell entry related domain protein  47.41 
 
 		 196 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0820134  normal  0.240411 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1750  hypothetical protein  40.54 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1451  hypothetical protein  47.97 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.813641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0171  hypothetical protein  42.36 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0194  ABC transporter substrate-binding protein  45.53 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.176856  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1827  hypothetical protein  44.72 
 
 		 156 aa  103  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.607055 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1268  hypothetical protein  43.55 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1818  toluene tolerance protein  41.22 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0449  ABC-type transport system protein  35.81 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.58514e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1967  hypothetical protein  36.71 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.539275  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0687  hypothetical protein  38.99 
 
 		 169 aa  99  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2784  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents periplasmic component  40.4 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162084  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0160  mce-related protein  36.42 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0339  Mammalian cell entry related domain protein  36.42 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.620596 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3238  Mammalian cell entry related domain protein  36.09 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4018  Mammalian cell entry related domain protein  46.02 
 
 		 174 aa  96.3  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.129238  normal  0.186584 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0739  Mammalian cell entry related domain protein  42.36 
 
 		 152 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.942465  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2891  Mammalian cell entry related domain protein  35.5 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2118  hypothetical protein  39.33 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0384  Mammalian cell entry related domain protein  41.14 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.214826 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2719  hypothetical protein  37.96 
 
 		 151 aa  94.4  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2960  signal peptide protein  38.1 
 
 		 173 aa  94.4  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2937  hypothetical protein  38.89 
 
 		 162 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.887715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03209  toluene tolerance protein  44.88 
 
 		 183 aa  92  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2691  hypothetical protein  38.1 
 
 		 189 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0995365  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0416  hypothetical protein  38.1 
 
 		 189 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249405  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0395  hypothetical protein  38.1 
 
 		 187 aa  90.9  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.147868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0534  Mammalian cell entry related domain protein  40.88 
 
 		 150 aa  90.5  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0718  Mammalian cell entry related domain protein  36.25 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0389  putative signal peptide protein, toluene tolerance Ttg2C-like  37.41 
 
 		 181 aa  90.1  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1818  hypothetical protein  39.86 
 
 		 148 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0319  hypothetical protein  45.37 
 
 		 187 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0287402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0750  hypothetical protein  36.25 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0854  Mammalian cell entry related domain protein  39.26 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.102404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1015  hypothetical protein  43.36 
 
 		 163 aa  89  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3702  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  87.8  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0761  Mammalian cell entry related domain protein  36.69 
 
 		 145 aa  87.8  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2768  hypothetical protein  36.73 
 
 		 184 aa  87.8  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.422541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3120  hypothetical protein  36.05 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.771354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0815  mce-related protein  34.03 
 
 		 149 aa  86.3  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0343  hypothetical protein  36.73 
 
 		 187 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3514  ABC transporter, inner membrane subunit  37.41 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.531635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2299  putative ABC transport system substrate-binding protein  40.91 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0104875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3569  Mammalian cell entry related domain protein  36.62 
 
 		 186 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424468  hitchhiker  0.0000173433 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3002  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.52 
 
 		 176 aa  85.5  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.784047  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0334  hypothetical protein  36.73 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0098  hypothetical protein  41.67 
 
 		 160 aa  85.9  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.334829  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2411  hypothetical protein  34.84 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108225  normal  0.153742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1007  Mammalian cell entry related domain protein  38.32 
 
 		 152 aa  85.1  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.063355  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0981  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2439  hypothetical protein  39.04 
 
 		 271 aa  85.1  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0222447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5534  hypothetical protein  34.16 
 
 		 161 aa  84.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.264569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2399  hypothetical protein  35.9 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1779  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4445  mce-related protein  39.6 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2724  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0905  hypothetical protein  41.88 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0874  hypothetical protein  41.88 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3702  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3675  mce family protein  42.59 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.090883  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.42671  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2221  hypothetical protein  36.67 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.693824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2774  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  42.59 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0474  hypothetical protein  37.31 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000014845  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3733  mce family protein  42.59 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4139  hypothetical protein  38.93 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0786  virulence factor MCE-like protein-related protein  41.12 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1041  hypothetical protein  34.48 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0890  Mammalian cell entry related domain protein  37.21 
 
 		 156 aa  81.3  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0283  Mammalian cell entry related domain protein  31.79 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3257  hypothetical protein  40.74 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1898  putative ABC transporter substrate-binding protein  33.96 
 
 		 155 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0239  hypothetical protein  35.14 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.852395 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12870  organic solvent tolerance ABC efflux transporter, substrate binding protein  34.9 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0795  hypothetical protein  36.73 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0097  Mammalian cell entry related domain protein  38.53 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000148019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0878  hypothetical protein  37.58 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.600632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1156  Mammalian cell entry related domain protein  33.55 
 
 		 163 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.482142  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0290  Mammalian cell entry related domain protein  31.21 
 
 		 188 aa  78.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3392  hypothetical protein  39.5 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3572  Mce family protein  35.97 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3503  Mce family protein  35.97 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.869463  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3670  Mce family protein  35.97 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0296035 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3608  Mce family protein  35.97 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.345737 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3501  Mce family protein  35.97 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0513461  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3183  Mammalian cell entry related domain protein  29.66 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0865  hypothetical protein  40.91 
 
 		 155 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2747  hypothetical protein  36.3 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0560  hypothetical protein  34.58 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000625618  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3099  putative ABC transport system substrate-binding protein  36.25 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.369391  normal  0.460198 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0403  hypothetical protein  34.59 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3681  Mce family protein  33.53 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0116721  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3577  Mce family protein  33.53 
 
 		 183 aa  73.9  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.45422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>