297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2790 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  60.61 
 
 		 299 aa  346  3e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  58.19 
 
 		 301 aa  344  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  56.86 
 
 		 298 aa  331  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  51.17 
 
 		 298 aa  295  5e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  53.99 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  51 
 
 		 304 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  49.83 
 
 		 307 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  45.64 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  43.75 
 
 		 309 aa  236  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  39.27 
 
 		 306 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  41.96 
 
 		 309 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  40.67 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  35.22 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  34.86 
 
 		 318 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  33.44 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  33.9 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  29.67 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  33.89 
 
 		 302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  30.1 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  29 
 
 		 306 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  33.85 
 
 		 314 aa  126  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  30.4 
 
 		 286 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  30.4 
 
 		 286 aa  125  7e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  30.63 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 316 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  31.16 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  31.67 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  32.27 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  30.39 
 
 		 316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  36.04 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 313 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  30.03 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  33.21 
 
 		 296 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  29.05 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  27.96 
 
 		 342 aa  105  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  31.2 
 
 		 326 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  30.67 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  30.39 
 
 		 313 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 		 295 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  30.46 
 
 		 312 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  29.86 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  28.97 
 
 		 337 aa  96.3  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  29.9 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  28.87 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  27.3 
 
 		 368 aa  92.4  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.92 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1950  peptidase S15  28.04 
 
 		 372 aa  90.5  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.286017 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0047  putative signal peptide protein  28.08 
 
 		 342 aa  89.7  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.314925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  27.1 
 
 		 359 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  29.55 
 
 		 345 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3166  peptidase S15  27.93 
 
 		 348 aa  83.6  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3398  peptidase S15  31.62 
 
 		 362 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.62942  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  29.31 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  29.55 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  27.31 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  26.99 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  27.92 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  25.4 
 
 		 351 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1162  peptidase S15  27.85 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000035975  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  28.42 
 
 		 356 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2708  putative signal peptide protein  27.68 
 
 		 355 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.849399  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  26.24 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  29 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  25.86 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1459  membrane protein  27.21 
 
 		 329 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0286008 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  33.1 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  26.99 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2737  hypothetical protein  27.3 
 
 		 358 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  28 
 
 		 340 aa  79  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0764  membrane protein  26.39 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000138363 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3656  hypothetical protein  41.12 
 
 		 132 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.954371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3047  putative signal peptide protein  27.24 
 
 		 355 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  24.92 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3098  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  26.13 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.610618  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  26.32 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  27.34 
 
 		 360 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  27.03 
 
 		 321 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  26.32 
 
 		 354 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1438  membrane protein  24.91 
 
 		 346 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1693  putative signal peptide protein  27.34 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  28.29 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  26.64 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3138  membrane protein  26.85 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  32.37 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0722  hypothetical protein  29.31 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.195254 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  23.34 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  32.37 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2117  hypothetical protein  34.33 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.150506 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  29.24 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  22.65 
 
 		 284 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  22.65 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  22.65 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>