More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2727 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  68.02 
 
 		 172 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  70.93 
 
 		 172 aa  232  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  67.44 
 
 		 194 aa  231  5e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  229  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  228  4e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  66.86 
 
 		 172 aa  227  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  64.53 
 
 		 172 aa  226  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 172 aa  224  4e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  65.12 
 
 		 172 aa  224  6e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  62.79 
 
 		 172 aa  221  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  220  9e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  218  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  217  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 172 aa  216  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 172 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  62.21 
 
 		 172 aa  214  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  61.63 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  63.37 
 
 		 172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  62.94 
 
 		 175 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  61.05 
 
 		 172 aa  208  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  62.29 
 
 		 175 aa  205  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  60.23 
 
 		 171 aa  204  5e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  59.65 
 
 		 171 aa  203  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  60.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  59.06 
 
 		 174 aa  201  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  63.95 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  60.47 
 
 		 172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  63.16 
 
 		 171 aa  191  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  184  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  53.7 
 
 		 171 aa  169  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  54.44 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  48.54 
 
 		 171 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  52.63 
 
 		 171 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  53.85 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  52.05 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  44.77 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 174 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  39.77 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 174 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  43.37 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  43.14 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 174 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  42.48 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  37.5 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 174 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  39.29 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  37.2 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  40.76 
 
 		 183 aa  108  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  40.13 
 
 		 174 aa  107  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0508  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.270625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  39.13 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  39.13 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  41.18 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  39.46 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  40.83 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1337  50S ribosomal protein L10  37.79 
 
 		 174 aa  105  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.900212  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4533  50S ribosomal protein L10  40.52 
 
 		 168 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 168 aa  104  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3248  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 168 aa  104  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3899  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 168 aa  104  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  38.93 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1667  50S ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  36.69 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0226  ribosomal protein L10  36.99 
 
 		 173 aa  103  1e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4018  ribosomal protein L10  35.26 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  38 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  36.42 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  36.97 
 
 		 187 aa  100  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  35.09 
 
 		 172 aa  100  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  39.05 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  34.64 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1172  ribosomal protein L10  38.1 
 
 		 173 aa  99  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000357466  unclonable  0.0000000289216 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2262  50S ribosomal protein L10  39.22 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.168271  normal  0.476107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  37.59 
 
 		 167 aa  98.6  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  37.21 
 
 		 174 aa  98.2  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  33.99 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  35.76 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  38.2 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3869  50S ribosomal protein L10  39.69 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  36.26 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  34.1 
 
 		 176 aa  97.1  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  37.25 
 
 		 166 aa  96.7  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  38.46 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0396  50S ribosomal protein L10  39.72 
 
 		 173 aa  96.3  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.252363  hitchhiker  0.00709296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>