264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2543 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 613 aa  1202    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  40 
 
 		 623 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  38.34 
 
 		 623 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  38.68 
 
 		 622 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  38.02 
 
 		 623 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  37.52 
 
 		 611 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  37.64 
 
 		 626 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  37.14 
 
 		 619 aa  359  9e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  36.98 
 
 		 623 aa  334  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  37.77 
 
 		 632 aa  319  1e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  37.83 
 
 		 632 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  38.29 
 
 		 623 aa  317  5e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  38.13 
 
 		 632 aa  312  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  34.38 
 
 		 618 aa  286  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  34.3 
 
 		 627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  34.08 
 
 		 599 aa  233  9e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  33.02 
 
 		 727 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  29.1 
 
 		 588 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  29.49 
 
 		 588 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  34.48 
 
 		 587 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  33.55 
 
 		 485 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  32.9 
 
 		 482 aa  130  8.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2046  flagellar hook-associated protein FlgK  26.75 
 
 		 547 aa  125  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.147605  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3168  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  27.8 
 
 		 585 aa  123  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.993978  normal  0.158632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  30.31 
 
 		 682 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  30.16 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  32.3 
 
 		 493 aa  117  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  29.87 
 
 		 657 aa  117  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  30.34 
 
 		 637 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  29.57 
 
 		 647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  30.46 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1474  flagellar hook-associated protein FlgK  30.03 
 
 		 676 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0329611  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0758  flagellar hook-associated protein FlgK  28.98 
 
 		 683 aa  114  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  30.16 
 
 		 472 aa  114  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 		 481 aa  113  9e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  31.35 
 
 		 486 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  31.13 
 
 		 490 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0935  flagellar hook-associated protein FlgK  28.55 
 
 		 640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.789193  normal  0.776781 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  30.45 
 
 		 481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  25.24 
 
 		 495 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1461  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.597207  hitchhiker  0.00000199333 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  29.56 
 
 		 486 aa  112  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  29.66 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0984648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  29.66 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2518  flagellar hook-associated protein FlgK  29.66 
 
 		 547 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.38905  hitchhiker  0.00149416 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  26.37 
 
 		 566 aa  111  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  27.83 
 
 		 456 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  30.39 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  29.36 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  31.83 
 
 		 457 aa  109  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0624  flagellar hook-associated protein FlgK  25.07 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  29.88 
 
 		 696 aa  108  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  29.69 
 
 		 485 aa  108  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  26.54 
 
 		 456 aa  108  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.25 
 
 		 484 aa  107  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  31.37 
 
 		 642 aa  107  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1596  flagellar hook-associated protein FlgK  26.67 
 
 		 546 aa  106  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  29.74 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  31.21 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  25.56 
 
 		 452 aa  105  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2422  flagellar hook-associated protein FlgK  30.4 
 
 		 698 aa  104  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.314403 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2725  flagellar hook-associated protein FlgK  27.52 
 
 		 640 aa  104  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000557458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 		 487 aa  104  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  26.91 
 
 		 477 aa  104  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2204  hypothetical protein  26.21 
 
 		 920 aa  103  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2236  flagellar hook-associated protein FlgK  28.05 
 
 		 568 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  31.39 
 
 		 457 aa  103  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  26.06 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  29.13 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  25.61 
 
 		 704 aa  101  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  25.98 
 
 		 657 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1675  flagellar hook-associated protein FlgK  25.32 
 
 		 525 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3078  flagellar hook-associated protein FlgK  24.82 
 
 		 638 aa  101  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1251  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 553 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.577758  normal  0.294007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2005  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 553 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00869488  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1280  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 553 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.227106  hitchhiker  0.000609554 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1295  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 553 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.216547  hitchhiker  0.000168062 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2189  flagellar hook-associated protein FlgK  29.75 
 
 		 553 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000358653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0079  flagellar hook-associated protein FlgK  30.29 
 
 		 588 aa  100  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0654859 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3110  flagellar hook-associated protein FlgK  25.5 
 
 		 672 aa  101  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293616  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2961  flagellar hook-associated protein FlgK  24.96 
 
 		 548 aa  100  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24090  flagellar hook-associated protein  28.53 
 
 		 541 aa  100  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160366  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  24.61 
 
 		 484 aa  99  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4195  flagellar hook-associated protein FlgK  29.34 
 
 		 583 aa  99  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  26.43 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50360  flagellar hook-associated protein FlgK  26.12 
 
 		 683 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0589172  hitchhiker  0.000676236 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2001  flagellar hook-associated protein FlgK  30.67 
 
 		 715 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0532033  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0511  flagellar hook-associated protein FlgK  25 
 
 		 685 aa  98.6  3e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1330  flagellar hook-associated protein FlgK  30.77 
 
 		 638 aa  98.2  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4182  flagellar hook-associated protein FlgK  27.07 
 
 		 652 aa  97.8  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4291  flagellar hook-associated protein FlgK  27.8 
 
 		 682 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6361  flagellar hook-associated protein FlgK  30.26 
 
 		 660 aa  97.4  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0276  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 		 714 aa  97.4  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0473  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 		 667 aa  97.1  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3335  flagellar hook-associated protein FlgK  30.43 
 
 		 667 aa  97.1  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  31.72 
 
 		 483 aa  97.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>