72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2521 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2521  chorismate mutase  100 
 
 		 101 aa  199  9e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316614 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1986  chorismate mutase  53.26 
 
 		 108 aa  98.2  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3271  chorismate mutase  53.26 
 
 		 109 aa  97.1  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.735196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1139  chorismate mutase  47.25 
 
 		 108 aa  80.9  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2059  Chorismate mutase  42.05 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.897142  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0787  chorismate mutase  43.33 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1269  normal  0.218255 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1555  hypothetical protein  41.67 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.302636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0569  chorismate mutase  44.68 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4076  chorismate mutase  41.38 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1284  chorismate mutase related enzyme  46.32 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0206152  normal  0.407727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4456  chorismate mutase  39.8 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3653  chorismate mutase  41.18 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0357  Chorismate mutase  43.18 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0367  chorismate mutase  43.18 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0443  chorismate mutase  42.7 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259409 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0309  chorismate mutase  32.58 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0753  chorismate mutase  38.2 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3570  chorismate mutase  39.33 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2163  chorismate mutase family protein  31.76 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2170  chorismate mutase family protein  37.78 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.23691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3094  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  34.69 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.307275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0015  chorismate mutase family protein  30.59 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0691  chorismate mutase  39.78 
 
 		 105 aa  58.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4264  normal  0.337326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0169  chorismate mutase-related enzyme  38.14 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2350  chorismate mutase  46.43 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2357  chorismate mutase  37.65 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.708038 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2321  chorismate mutase  34.94 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0789941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2047  Chorismate mutase  33.71 
 
 		 107 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000724827 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0570  chorismate mutase  41.57 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0662  chorismate mutase  40.45 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2315  chorismate mutase  40.45 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.275699 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  37.5 
 
 		 358 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09580  chorismate mutase  35.71 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2759  isochorismate-pyruvate lyase  29.47 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0261778 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3163  isochorismate-pyruvate lyase  29.47 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 358 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2595  chorismate mutase  36.71 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.38 
 
 		 375 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1875  Chorismate mutase  37.66 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0566937 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  30.38 
 
 		 375 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  31.25 
 
 		 375 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2451  chorismate mutase  37.97 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228493 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0668  isochorismate-pyruvate lyase  25 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444426  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0958  chorismate mutase  30.38 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.993568 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  37.5 
 
 		 356 aa  43.5  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2596  isochorismate pyruvate-lyase  29.07 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.878016  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14790  chorismate mutase  35.44 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.165725  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3024  Chorismate mutase  35.06 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  30.49 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2720  chorismate mutase  36.71 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.50851  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0905  Prephenate dehydratase  30.38 
 
 		 386 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000067938  hitchhiker  0.00000000600467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  31.82 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1832  isochorismate-pyruvate lyase  27.06 
 
 		 101 aa  41.6  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46106  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0349  chorismate mutase  31.76 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.365009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0782  isochorismate-pyruvate lyase  27.06 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0872  isochorismate-pyruvate lyase  27.06 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1590  chorismate mutase  29.07 
 
 		 399 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01713  chorismate mutase/prephenate dehydratase  27.47 
 
 		 393 aa  41.2  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.342812  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  28.57 
 
 		 374 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5285  isochorismate-pyruvate lyase  25 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0852308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1078  chorismate mutase  34.09 
 
 		 103 aa  41.2  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0126644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2146  isochorismate-pyruvate lyase  27.06 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00415541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1757  chorismate mutase  36.36 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0074  chorismate mutase  34.21 
 
 		 125 aa  40.4  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.287871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1825  chorismate mutase  36.36 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2539  chorismate mutase  45.45 
 
 		 399 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.409768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5002  isochorismate-pyruvate lyase  25 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1341  prephenate dehydratase  31.91 
 
 		 384 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.409344  normal  0.126516 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3365  isochorismate-pyruvate lyase  25 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.311518  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3397  Chorismate mutase, type II  34.21 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2403  chorismate mutase  31.4 
 
 		 116 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>