More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1603 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1603  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 
203 aa  400  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.673195  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4876  thioredoxin-like  48.02 
 
 
224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.608782  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1401  redoxin domain-containing protein  58.14 
 
 
191 aa  159  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.774278  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1000  redoxin domain-containing protein  44.86 
 
 
238 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0826  thioredoxin-like protein  44.39 
 
 
222 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1980  thiol:disulfide interchange protein, putative  43.46 
 
 
238 aa  155  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1905  putative thiol:disulfide interchange protein  43.46 
 
 
238 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4016  thiol:disulfide interchange protein  46.31 
 
 
220 aa  154  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0716  thioredoxin-like protein  48.1 
 
 
223 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.620578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2535  redoxin domain-containing protein  47.12 
 
 
224 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.772759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1144  Thiol disulfide interchange protein tlpA (cytochrome c biogenesis protein tlpA)  46.7 
 
 
229 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243856  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3478  thioredoxin-like protein  46.5 
 
 
223 aa  151  7e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0935  thioredoxin-like  42.72 
 
 
222 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3037  redoxin  47.09 
 
 
221 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3502  hypothetical protein  52.86 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.460677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  48.7 
 
 
161 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1187  Redoxin domain protein  47.47 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3616  redoxin domain-containing protein  44.21 
 
 
226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0668445  normal  0.0142654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5226  Redoxin domain protein  49.29 
 
 
228 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.387928  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3857  Redoxin domain protein  46.81 
 
 
220 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0709217 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4503  redoxin domain-containing protein  46.24 
 
 
213 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5989  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.870389  normal  0.126817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1737  redoxin domain-containing protein  43.35 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.958182  normal  0.712311 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3488  Redoxin domain protein  50.65 
 
 
216 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.207064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2370  redoxin domain-containing protein  39.3 
 
 
195 aa  138  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.36236 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3564  Redoxin domain protein  45.21 
 
 
220 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3611  Redoxin domain protein  51.47 
 
 
213 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338922  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7297  Redoxin domain protein  46.07 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0540011  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3288  redoxin domain-containing protein  50.74 
 
 
213 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2444  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  46.32 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  0.571857 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0496  thiol:disulfide interchange protein, putative  43.26 
 
 
184 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2380  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.17 
 
 
183 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.632646 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3063  Thiol:disulfide interchange protein TlpA  37.1 
 
 
191 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3733  redoxin  45.9 
 
 
187 aa  122  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.78163 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0053  anti-oxidant AhpCTSA family protein  39.26 
 
 
232 aa  122  4e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0725  thioredoxin, thioldisulfide interchange protein  43.17 
 
 
183 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.409063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3210  redoxin domain-containing protein  38.78 
 
 
209 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0398  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  45.24 
 
 
223 aa  112  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0641884  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4643  putative thiol--disulfide interchange redox-active center transmembrane protein  39.72 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  37.88 
 
 
171 aa  105  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2006  redoxin domain-containing protein  37.24 
 
 
176 aa  102  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0112011  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0221  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.57 
 
 
198 aa  101  7e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000103908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0196  redoxin domain-containing protein  32.87 
 
 
195 aa  100  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000417571  normal  0.0470366 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.11 
 
 
202 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.305938 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  36.88 
 
 
182 aa  99.4  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2865  redoxin domain-containing protein  39.26 
 
 
170 aa  97.8  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.220691  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4281  redoxin domain-containing protein  31.58 
 
 
192 aa  95.9  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000444464  normal  0.0383421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0746  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.77 
 
 
200 aa  94  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.204935  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0486  redoxin domain-containing protein  32.37 
 
 
194 aa  94  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0251  thioredoxin, putative  34.48 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000212412  normal  0.0823497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0269  thioredoxin, putative  30.83 
 
 
194 aa  93.6  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0200  thioredoxin domain-containing protein  42.22 
 
 
189 aa  92.4  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3367  redoxin domain-containing protein  30.22 
 
 
194 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0237  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000458104  hitchhiker  0.00000000877704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0232  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
193 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000057561  normal  0.0469952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4005  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.94 
 
 
194 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4653  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.41 
 
 
191 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000929627  normal  0.021972 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0721  cytochrome C biogenesis protein  28.43 
 
 
403 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000290768  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0237  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
193 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000132187  unclonable  0.000000000045327 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1321  thioredoxin family protein  33.59 
 
 
168 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0237  redoxin domain-containing protein  30 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000304189  normal  0.555945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0234  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000676147  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0476  thioredoxin, putative  30.22 
 
 
194 aa  89.4  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1223  Redoxin domain protein  37 
 
 
170 aa  89  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.337108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0739  putative cytochrome C-type biogenesis protein  28.92 
 
 
403 aa  89  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0112308  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3412  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 
169 aa  88.2  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4480  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.5 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0476  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30 
 
 
177 aa  88.2  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4018  Redoxin domain protein  29.23 
 
 
195 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000656655  hitchhiker  0.00619092 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3474  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.37 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.163841 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0479  thioredoxin, putative  29.5 
 
 
196 aa  87.8  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.75 
 
 
184 aa  87.4  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0185  redoxin domain-containing protein  28.68 
 
 
179 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000121029  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3880  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.22 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3721  redoxin domain-containing protein  29.69 
 
 
195 aa  86.3  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000547051  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1851  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.48 
 
 
409 aa  86.3  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2678  thioredoxin family protein  32.95 
 
 
183 aa  85.5  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3545  redoxin domain-containing protein  29.5 
 
 
194 aa  85.9  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65179  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3774  thiol-disulfide isomerase-like protein  37.19 
 
 
173 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166782  normal  0.0186728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2212  thioredoxin-like  38.66 
 
 
133 aa  85.5  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.249121  normal  0.498719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3739  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  39.62 
 
 
170 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0260987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5421  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.56 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.305949 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0485  redoxin domain-containing protein  29.5 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  31.44 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  30.71 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  25.91 
 
 
188 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2082  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.06 
 
 
380 aa  79.3  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11808  thioredoxin, putative  37.27 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2863  putative thioredoxin-related transmembrane protein  35.83 
 
 
182 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1400  Redoxin domain protein  36.09 
 
 
188 aa  79  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.25356  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2452  thioredoxin family protein  29.51 
 
 
170 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000374764  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1249  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.67 
 
 
331 aa  79  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.768567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3362  periplasmic protein thiol--disulphide oxidoreductase DsbE  31.34 
 
 
192 aa  79  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.34018  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  37.96 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  34.75 
 
 
168 aa  78.2  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0717  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.5 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17044  normal  0.602428 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0087  thiol-disulfide isomerase-like protein  34.13 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1768  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.16 
 
 
446 aa  77.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.197214  normal  0.508736 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0738  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.04 
 
 
170 aa  77.8  0.00000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.296036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>