More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1637 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
171 aa  339  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.90867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0662  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  74.27 
 
 
224 aa  259  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.550294  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0511  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.84 
 
 
235 aa  249  1e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  68.42 
 
 
224 aa  244  4e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
267 aa  82.4  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.92 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7370  short-chain alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
247 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2616  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.721614  normal  0.0286411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.93 
 
 
240 aa  73.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.51 
 
 
245 aa  71.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200768  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.46 
 
 
227 aa  70.1  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 
241 aa  68.6  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0202435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0162  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1925  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.17 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.452035  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5285  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5374  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 
230 aa  67.8  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0331  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
297 aa  67.8  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2744  short chain dehydrogenase  32.07 
 
 
334 aa  67.8  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.972914  normal  0.0520687 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3338  tropinone reductase  31.38 
 
 
267 aa  67.4  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0617958 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
287 aa  67.4  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.16 
 
 
246 aa  67.4  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1843  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  32.6 
 
 
234 aa  67  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.136671  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
299 aa  67  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1175  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  28.57 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267366  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  31.72 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1292  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.62 
 
 
339 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22650  short-chain alcohol dehydrogenase like protein  29.95 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1207  short chain dehydrogenase  32.09 
 
 
337 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0675  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
301 aa  65.5  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5664  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.71 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0712  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0663  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0824  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.87827e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0748  short chain dehydrogenase  27.42 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13500  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.25 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0632  short chain dehydrogenase  28.65 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000680928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0655  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000332724  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01070  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.95 
 
 
238 aa  64.7  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  29.19 
 
 
291 aa  64.3  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0667  short chain dehydrogenase  32.52 
 
 
288 aa  64.3  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.401827  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
288 aa  64.3  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2778  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.43 
 
 
234 aa  64.3  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.408649 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
293 aa  63.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4525  short chain dehydrogenase  27.57 
 
 
288 aa  63.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.193288 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
293 aa  63.9  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.49 
 
 
264 aa  63.9  0.0000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5297  short chain dehydrogenase  27.81 
 
 
317 aa  63.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.460339 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0994  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.05 
 
 
248 aa  63.5  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.931337 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0560  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.65 
 
 
260 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.0340576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2524  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35 
 
 
254 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.63 
 
 
281 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.223454  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0756  twin-arginine translocation pathway signal  29.79 
 
 
328 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.98283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0805  short chain dehydrogenase  27.03 
 
 
288 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0912  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
288 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1237  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
328 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.688283  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4586  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
284 aa  63.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1917  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.87 
 
 
293 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0650  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.85 
 
 
244 aa  62.8  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.280666  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0818  short chain dehydrogenase  28.11 
 
 
288 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27180  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like protein  30.85 
 
 
281 aa  62.8  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7533  putative short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) family protein  38.95 
 
 
260 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436841  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.18 
 
 
244 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000616439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0313  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.9 
 
 
239 aa  62.8  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00087118  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1057  short chain dehydrogenase; 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30 
 
 
230 aa  62.8  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.474453 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2104  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.64 
 
 
234 aa  63.2  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.17 
 
 
285 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_006686  CND02280  oxidoreductase, putative  29.73 
 
 
309 aa  62.4  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.878194  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2743  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.9 
 
 
262 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0512455  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
287 aa  62.4  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1210  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.57 
 
 
337 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0664  cylG protein  27.89 
 
 
240 aa  61.6  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0030  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase, putative  30.65 
 
 
245 aa  62  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3274  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
273 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2377  short chain dehydrogenase  33.88 
 
 
273 aa  62  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.11 
 
 
287 aa  62  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259282  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5132  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.11 
 
 
273 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  0.457646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.32 
 
 
284 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.757824  normal  0.126466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4672  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.61 
 
 
253 aa  61.6  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572467  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4477  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
257 aa  61.6  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.211006  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1924  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 
238 aa  61.6  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.588945  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.22 
 
 
287 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.48 
 
 
368 aa  61.6  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521735  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0131  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.35 
 
 
245 aa  61.2  0.000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120855  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0027  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.65 
 
 
245 aa  61.2  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2059  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  30.85 
 
 
247 aa  61.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0884699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4753  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
284 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163262  normal  0.97721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1525  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.28 
 
 
266 aa  60.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191117  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.71 
 
 
249 aa  60.8  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
284 aa  60.8  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.847413  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.11 
 
 
306 aa  60.8  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1723  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.8 
 
 
247 aa  60.5  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000657249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2913  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 
234 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.98827 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0900  putative short-chain dehydrogenase/reductase  43.68 
 
 
263 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.285387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.74 
 
 
233 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.89 
 
 
225 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
288 aa  60.1  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0042  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
282 aa  60.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.144902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>