59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3951 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3951  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 113 aa  228  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1571  helix-turn-helix domain protein  63.3 
 
 		 109 aa  143  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140228  normal  0.176478 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2266  helix-turn-helix domain protein  40.38 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0639842 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1818  helix-turn-helix domain protein  33.02 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0350108  decreased coverage  0.0000000000623016 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3121  helix-turn-helix domain protein  39.81 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.23599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0914  helix-turn-helix domain protein  36.19 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0680459  hitchhiker  0.00000175026 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1997  helix-turn-helix domain protein  36.27 
 
 		 107 aa  62.8  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.285438  hitchhiker  0.000964376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4907  helix-turn-helix domain protein  37.33 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0998227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  31.11 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0935  hypothetical protein  38.81 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0670  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 129 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000580347  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 211 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4208  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.629555  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0620  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 128 aa  47.4  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.855265  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1142  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.343255  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  36.67 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4575  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.810922 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0924  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  26.83 
 
 		 323 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325541  normal  0.296459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  38.33 
 
 		 383 aa  45.4  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  29.51 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  27.14 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  26.32 
 
 		 303 aa  44.7  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  45.83 
 
 		 264 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  32.35 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4304  transcriptional regulator, XRE family  28.79 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.663644 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1796  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1460  molybdate metabolism transcriptional regulator  47.22 
 
 		 368 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4802  helix-turn-helix domain protein  34.43 
 
 		 233 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2384  transcriptional regulator, XRE family  33.87 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0894  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1118  putative transcriptional regulator  36.07 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1136  helix-turn-helix domain-containing protein  31.25 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 374 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  29.69 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4798  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 222 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  29.69 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  44.64 
 
 		 212 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1190  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 126 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.815543  normal  0.235581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 252 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2912  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 200 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2717  hypothetical protein  30.48 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.570521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2567  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.25 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.375259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2247  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.17 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.616763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 361 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3106  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 121 aa  40.4  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2740  transcriptional regulator, XRE family  28.41 
 
 		 395 aa  40.8  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0255  transcriptional regulator, putative  28.72 
 
 		 308 aa  40.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0772  transcriptional regulator, XRE family  31.17 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 183 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0165  transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 201 aa  40  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>