110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3882 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 		 467 aa  968    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  59.07 
 
 		 453 aa  556  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  56.14 
 
 		 460 aa  544  1e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  54.76 
 
 		 474 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  47 
 
 		 447 aa  375  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  29.66 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  28.15 
 
 		 459 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  28.64 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  26.36 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  31.01 
 
 		 483 aa  130  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  29.97 
 
 		 463 aa  127  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  30.94 
 
 		 515 aa  126  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  27.03 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  25.88 
 
 		 453 aa  124  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  26.3 
 
 		 475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  24.53 
 
 		 493 aa  91.7  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  23.02 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  21.85 
 
 		 490 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4261  rhamnulokinase  25.36 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.223325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4290  rhamnulokinase  25.36 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4442  rhamnulokinase  25 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4330  rhamnulokinase  25 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0691147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4376  rhamnulokinase  25 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3609  rhamnulokinase  22.17 
 
 		 490 aa  62.4  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09600  Rhamnulokinase  20.43 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  20.28 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1671  carbohydrate kinase, FGGY  23.21 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.831804  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3755  rhamnulokinase  22.53 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4382  rhamnulokinase  23.21 
 
 		 471 aa  56.2  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  22.46 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0743  rhamnulokinase  22.22 
 
 		 485 aa  55.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.145473 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1744  carbohydrate kinase FGGY  22.01 
 
 		 474 aa  55.8  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  23.19 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  26.04 
 
 		 489 aa  55.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  22.2 
 
 		 473 aa  54.7  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4435  rhamnulokinase  23.22 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  23.19 
 
 		 472 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  22.66 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  22.66 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  24.63 
 
 		 492 aa  54.3  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  24.63 
 
 		 492 aa  54.3  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  21.74 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  21.74 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3154  carbohydrate kinase FGGY  25.6 
 
 		 489 aa  53.9  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1146  rhamnulokinase  22.92 
 
 		 467 aa  53.5  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  21.74 
 
 		 482 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  21.74 
 
 		 482 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03790  rhamnulokinase  22.85 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4080  rhamnulokinase  22.85 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3788  rhamnulokinase  22.42 
 
 		 485 aa  53.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4133  rhamnulokinase  22.85 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3845  rhamnulokinase  23.02 
 
 		 472 aa  53.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4113  rhamnulokinase  22.85 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5356  rhamnulokinase  22.85 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  21.82 
 
 		 514 aa  53.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03739  hypothetical protein  22.85 
 
 		 489 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  21.74 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  23.61 
 
 		 494 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  21.74 
 
 		 472 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  21.74 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  21.67 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  21.74 
 
 		 482 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2496  gluconate kinase  26.74 
 
 		 499 aa  51.2  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0133  carbohydrate kinase FGGY  20.86 
 
 		 485 aa  51.2  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.555674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3214  rhamnulokinase  21.53 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.950631  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4067  rhamnulokinase  21.67 
 
 		 489 aa  50.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  20.43 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1616  carbohydrate kinase, FGGY  29.52 
 
 		 510 aa  50.4  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0809365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4295  rhamnulokinase  22.85 
 
 		 489 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0758535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  21.82 
 
 		 530 aa  50.4  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  24.52 
 
 		 472 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0552  gluconate kinase  23.33 
 
 		 512 aa  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3323  carbohydrate kinase FGGY  22.88 
 
 		 519 aa  50.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000061423  normal  0.0110516 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  21.16 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0841  carbohydrate kinase FGGY  23.28 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000141344  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  22.66 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  22.66 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0693  carbohydrate kinase FGGY  21.84 
 
 		 479 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.263915  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  22.66 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  23.38 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1300  carbohydrate kinase FGGY  22.12 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  22.55 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4007  putative sugar  24.23 
 
 		 494 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  22.17 
 
 		 502 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0428  carbohydrate kinase FGGY  21.4 
 
 		 493 aa  47.8  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.992473  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  23.18 
 
 		 481 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4112  putative sugar kinase  24.23 
 
 		 494 aa  47.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.189365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1697  carbohydrate kinase, FGGY  22.52 
 
 		 426 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.667396  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0499  rhamnulokinase  20.57 
 
 		 496 aa  47  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  22.17 
 
 		 502 aa  47  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  21.32 
 
 		 520 aa  46.6  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  22.97 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  22.1 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  21.32 
 
 		 515 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  23.1 
 
 		 508 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  21.64 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4062  carbohydrate kinase FGGY family protein  23.71 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  0.925843 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3991  putative sugar kinase  23.71 
 
 		 494 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.858143 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  21.11 
 
 		 524 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2058  gluconokinase  20.59 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>