More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3572 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3572  Endoribonuclease L-PSP  100 
 
 		 126 aa  256  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.65097  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0871  putative endoribonuclease L-PSP  40.35 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0915568  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0631  putative endoribonuclease L-PSP  37.1 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1697  putative endoribonuclease L-PSP  37.19 
 
 		 144 aa  84.7  4e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  40.91 
 
 		 130 aa  84.3  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  38.18 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0308  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  37.04 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0614  putative endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  35.45 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5010  endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 127 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  36.22 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20920  putative endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  35.77 
 
 		 143 aa  79  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1053  endoribonuclease L-PSP  38.32 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000107956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  35.45 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1554  putative endoribonuclease L-PSP  40.74 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0414  putative endoribonuclease L-PSP  36.07 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.59864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0637  putative endoribonuclease L-PSP  35.54 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0939  endoribonuclease L-PSP  31.9 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.445862  normal  0.428403 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  29.37 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  36.45 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4550  endoribonuclease L-PSP  37.29 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1873  translation initiation inhibitor  33.33 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.595446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2009  endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2960  putative endoribonuclease L-PSP  30.71 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0144  putative endoribonuclease L-PSP  34.15 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00510728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3184  endoribonuclease L-PSP, putative  32.52 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0942  endoribonuclease L-PSP  29.84 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1799  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2357  endoribonuclease L-PSP  30.65 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.063190000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02363  endoribonuclease L-PSP, putative  33.33 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2538  endoribonuclease L-PSP, putative  33.6 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0266359  normal  0.960709 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  31.15 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1674  endoribonuclease L-PSP  34.13 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3257  endoribonuclease L-PSP  33.87 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  33.06 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0968  putative endoribonuclease L-PSP  30.4 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3210  endoribonuclease L-PSP  37.38 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000188329  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1208  putative endoribonuclease L-PSP  42.05 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0254  endoribonuclease L-PSP  33.86 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.600084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0919  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.13854 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1716  endoribonuclease L-PSP  33.61 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.220452  decreased coverage  0.00000724646 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2337  putative endoribonuclease L-PSP  36.46 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00394631 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0701  putative endoribonuclease L-PSP  36.36 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.363  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0751  endoribonuclease L-PSP, putative  36.36 
 
 		 123 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0230  YjgF-like protein protein  30.58 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  35.85 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1878  endoribonuclease L-PSP  34.51 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0815  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3374  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.066634 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  34.96 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1220  endoribonuclease L-PSP  30.08 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000020508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  31.71 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5680  Endoribonuclease L-PSP  35.14 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.979461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03190  lipoprotein  37.5 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02800  Endoribonuclease L-PSP family protein  31.4 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.140231  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  32.38 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1940  putative endoribonuclease L-PSP  29.92 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.049388  hitchhiker  0.000000582392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  32 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3008  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.981998  normal  0.146953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  29.51 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0709  putative endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3436  YjgF-like protein  33.02 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4391  endoribonuclease L-PSP  30.33 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0665991 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6623  Endoribonuclease L-PSP  34.23 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808088  normal  0.892457 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  31.15 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  29.51 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  29.03 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  31.4 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6115  hypothetical protein  29.51 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2247  endoribonuclease L-PSP  33.63 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.137208  normal  0.668732 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  31.45 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2593  endoribonuclease L-PSP  32.71 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1053  endoribonuclease L-PSP  33.9 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  29.51 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0156  endoribonuclease L-PSP  30.89 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2441  endoribonuclease L-PSP  31.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.248917 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03082  hypothetical protein  34.95 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1109  endoribonuclease L-PSP  38.95 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3222  putative endoribonuclease L-PSP  32.8 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>