More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3134 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3134  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
219 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2943  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  75.23 
 
 
218 aa  347  8e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.86932  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  57.28 
 
 
221 aa  268  7e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.35 
 
 
220 aa  168  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.72 
 
 
225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0136  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.21 
 
 
225 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.38 
 
 
231 aa  141  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3792  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 
229 aa  131  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.86 
 
 
218 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  30.73 
 
 
456 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  30.91 
 
 
456 aa  125  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
456 aa  122  5e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0320  HAD family hydrolase  35.52 
 
 
241 aa  122  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.288784  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0332  HAD family hydrolase  32.52 
 
 
232 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.827004  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2702  HAD family hydrolase  29.05 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.81 
 
 
233 aa  114  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.79 
 
 
223 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.69 
 
 
232 aa  114  8.999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.52 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.49 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0853  HAD family hydrolase  32.23 
 
 
221 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0114666 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.05 
 
 
233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.49 
 
 
254 aa  112  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  27.96 
 
 
228 aa  109  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  29.91 
 
 
225 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
218 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.25 
 
 
221 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  30.43 
 
 
228 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2682  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.96 
 
 
226 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  31.51 
 
 
220 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.09 
 
 
221 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2690  HAD family hydrolase  32.97 
 
 
221 aa  105  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.365385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  27.32 
 
 
220 aa  104  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
227 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  26.56 
 
 
234 aa  103  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  29.03 
 
 
396 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.11 
 
 
217 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1761  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
230 aa  102  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0120798  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 
217 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12643  Predicted phosphatase  30.62 
 
 
216 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2233  HAD family hydrolase  26.46 
 
 
225 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1765  HAD family hydrolase  32.04 
 
 
236 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0140115 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.14 
 
 
218 aa  99.4  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.85 
 
 
223 aa  99.4  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.61 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4325  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.2 
 
 
234 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  30.32 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1614  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.44 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0147527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1040  HAD family hydrolase  34.22 
 
 
226 aa  97.1  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000171478  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000391  2-deoxyglucose-6-phosphate hydrolase YniC  31.52 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0106831  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1676  HAD-like hydrolase  29.19 
 
 
219 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.340852 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2488  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
237 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.271509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3315  HAD family hydrolase  25.45 
 
 
242 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.354727 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7216  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.89 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  32.47 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3410  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0110715  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1893  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
222 aa  93.2  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1749  HAD family hydrolase  29.44 
 
 
227 aa  94  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0431  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.53 
 
 
217 aa  92.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1096  hypothetical protein  29.44 
 
 
222 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0876  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.52 
 
 
215 aa  92.4  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0836  hypothetical protein  37.14 
 
 
195 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1093  hypothetical protein  29.44 
 
 
222 aa  91.7  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.1 
 
 
226 aa  92  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281035  normal  0.462582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2542  HAD family hydrolase  29.35 
 
 
214 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.214098 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3420  HAD family hydrolase  27.63 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.964625  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  33.16 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  31.44 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4038  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.28 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.65 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4075  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.28 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.280264  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3593  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.05 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000011766  normal  0.672534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.36 
 
 
224 aa  89  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  25.73 
 
 
221 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  28.23 
 
 
225 aa  89  5e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1738  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 
235 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.324615  normal  0.173582 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  31.61 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  31.08 
 
 
219 aa  88.2  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  27.75 
 
 
218 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0641  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
220 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.950078  normal  0.0427696 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2344  HAD family hydrolase  27.7 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000386998  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2387  HAD family hydrolase  27.7 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000185425  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40332  predicted protein  29.52 
 
 
247 aa  86.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1428  putative phosphatase  29.38 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307964  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1348  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
226 aa  86.3  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.523514  hitchhiker  0.0000000193697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2101  HAD family hydrolase  28.78 
 
 
231 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1743  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.79 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.293469  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  30.48 
 
 
219 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  31.58 
 
 
219 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
216 aa  85.5  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  30.11 
 
 
216 aa  85.9  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.5 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.0108500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  25.24 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2939  fructose-1-phosphatase  30.85 
 
 
188 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320797  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3022  fructose-1-phosphatase  30.85 
 
 
188 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0218888  decreased coverage  0.00000512461 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3926  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.05 
 
 
219 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000238408  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0251  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.4 
 
 
216 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.822561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0432  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.02 
 
 
218 aa  85.1  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000498152  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0985  fructose-1-phosphatase  28.49 
 
 
188 aa  84.7  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000117667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
217 aa  84.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.022243  hitchhiker  0.00896914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>