49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2779 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2779  exported exo-alpha-sialidase  100 
 
 		 378 aa  773    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4078  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  61.46 
 
 		 381 aa  464  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  64.08 
 
 		 1251 aa  464  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2148  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  62.36 
 
 		 361 aa  462  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1808  BNR/Asp-box repeat domain protein  58.84 
 
 		 348 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.694219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7180  putative neuraminidase  43.84 
 
 		 370 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.832478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01621  BNR/Asp-box repeat domain protein  44.92 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4268  hypothetical protein  41.64 
 
 		 366 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.168613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2045  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  39.62 
 
 		 349 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2863  hypothetical protein  38.79 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1340  putative cytoplasmic protein  36.01 
 
 		 347 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.153382 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3918  hypothetical protein  35.8 
 
 		 350 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1371  hypothetical protein  36.34 
 
 		 347 aa  162  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.182179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1929  putative cytoplasmic protein  36.34 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.733619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1356  putative cytoplasmic protein  36.34 
 
 		 347 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0360732 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6956  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.43 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1532  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.62 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6297  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  30.62 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.715127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1043  hypothetical protein  30.73 
 
 		 414 aa  126  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5961  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  29.01 
 
 		 395 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0562  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 391 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.270788  normal  0.469707 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02900  conserved hypothetical protein  31.61 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8131  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  31.2 
 
 		 398 aa  122  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.112958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3711  hypothetical protein  31.08 
 
 		 395 aa  119  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1110  hypothetical protein  30.47 
 
 		 413 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6450  putative glycosyl hydrolase protein  28.06 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.645858  normal  0.142716 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3540  hypothetical protein  30.62 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0644  hypothetical protein  30.79 
 
 		 391 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.175694  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6273  putative glycosyl hydrolase protein  27.98 
 
 		 395 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.160576  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0687  hypothetical protein  30.03 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3984  hypothetical protein  24.86 
 
 		 398 aa  86.3  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1246  BNR/Asp-box repeat-containing protein  27.52 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1110  BNR/Asp-box repeat protein  27.84 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07930  conserved hypothetical protein  26.2 
 
 		 333 aa  80.1  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3577  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.169929  normal  0.71691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3075  BNR/Asp-box repeat-containing protein  25.07 
 
 		 461 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1897  BNR/Asp-box repeat protein  24.09 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.417517  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0557  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.99 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.560584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3780  hypothetical protein  25.68 
 
 		 823 aa  61.2  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3508  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.14 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0061  hypothetical protein  31.61 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3583  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.35 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.436734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3584  hypothetical protein  24.9 
 
 		 583 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.632937 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2315  hypothetical protein  27.37 
 
 		 392 aa  50.8  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0204417 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4196  hypothetical protein  25.81 
 
 		 388 aa  50.4  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1324  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  22.75 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.12068  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0625  Exo-alpha-sialidase  23.14 
 
 		 419 aa  46.6  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.377281  normal  0.254881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2629  glycosyl hydrolase BNR repeat-containing protein  24.12 
 
 		 397 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2216  hypothetical protein  23.55 
 
 		 652 aa  43.5  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>