245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2264 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  100 
 
 
331 aa  691    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  51.09 
 
 
332 aa  338  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  44.38 
 
 
342 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  37.15 
 
 
348 aa  235  9e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  39.14 
 
 
343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.73 
 
 
341 aa  230  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  35.31 
 
 
330 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  31.87 
 
 
331 aa  194  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  34.44 
 
 
342 aa  192  7e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  34.14 
 
 
342 aa  192  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  36.39 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  31.56 
 
 
340 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  33.23 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  33.13 
 
 
339 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 
339 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  30.7 
 
 
342 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 
343 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  30.4 
 
 
590 aa  162  9e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  31.29 
 
 
338 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.97 
 
 
334 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  33.13 
 
 
351 aa  159  5e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  32.72 
 
 
339 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  31.46 
 
 
335 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  32.65 
 
 
342 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  28.75 
 
 
334 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  28.35 
 
 
341 aa  142  8e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  28.17 
 
 
340 aa  142  8e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.83 
 
 
342 aa  142  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 
329 aa  138  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.79 
 
 
340 aa  136  5e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  30.88 
 
 
366 aa  135  8e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.15 
 
 
341 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  27.96 
 
 
331 aa  133  5e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  28.61 
 
 
368 aa  126  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  27.71 
 
 
339 aa  126  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  29.28 
 
 
336 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  27.19 
 
 
339 aa  124  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  28.15 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  26.73 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  28.96 
 
 
344 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  30.27 
 
 
366 aa  119  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  25.23 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  29.48 
 
 
367 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 
365 aa  115  8.999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  31.5 
 
 
359 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  28.94 
 
 
332 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  29.06 
 
 
365 aa  105  8e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  26.97 
 
 
338 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  27.16 
 
 
318 aa  102  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  24.92 
 
 
338 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  25.3 
 
 
338 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.62 
 
 
338 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  24.62 
 
 
338 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  25.3 
 
 
338 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  23.78 
 
 
338 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  24.62 
 
 
338 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  23.69 
 
 
338 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  26.95 
 
 
318 aa  98.6  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.1 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  28.02 
 
 
317 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  23.33 
 
 
338 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  23.48 
 
 
338 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  24.77 
 
 
326 aa  95.1  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  28.12 
 
 
317 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  26.62 
 
 
360 aa  91.3  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  25.76 
 
 
320 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  25.12 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  24.75 
 
 
321 aa  82  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  27.49 
 
 
327 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  26.83 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  24.38 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  23.46 
 
 
326 aa  73.6  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  21.47 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  22.8 
 
 
344 aa  72  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  22.49 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  24.17 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  21.25 
 
 
321 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  22.87 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  23.01 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  25.13 
 
 
312 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  23.23 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  23.81 
 
 
319 aa  67.4  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  22.29 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  21.33 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  23.49 
 
 
328 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  21.67 
 
 
316 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  24.5 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  20.82 
 
 
313 aa  65.5  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  27.69 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  22.95 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  27.1 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  23.27 
 
 
319 aa  62.8  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  21.18 
 
 
317 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  27.69 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  23.36 
 
 
329 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  23.21 
 
 
340 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  29.95 
 
 
321 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  22.73 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  19.76 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  25.07 
 
 
323 aa  60.8  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>