64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4500 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4500  phosphoesterase, PA-phosphatase-like  100 
 
 		 258 aa  528  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4071  phosphoesterase, PA-phosphatase related  66.67 
 
 		 246 aa  358  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4375  PAP2 superfamily protein  68.7 
 
 		 247 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0900  PAP2 family protein  72.89 
 
 		 242 aa  330  1e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4487  hypothetical protein  68.83 
 
 		 242 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138399  normal  0.877135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0939  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  72 
 
 		 242 aa  308  8e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4953  hypothetical protein  59.49 
 
 		 263 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56960  hypothetical protein  59.07 
 
 		 264 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2474  phosphoesterase, PA-phosphatase related  55.26 
 
 		 241 aa  265  8e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2983  phosphoesterase, PA-phosphatase related  50.21 
 
 		 253 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.781375  hitchhiker  0.00646045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0525  PAP2 family protein  37.17 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2949  PAP2 family protein  34.71 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3724  PAP2 family protein  37.82 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0694  hypothetical protein  35.78 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0704  hypothetical protein  35.09 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3680  hypothetical protein  34.65 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0673  hypothetical protein  35.32 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3222  hypothetical protein  31.55 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1635  hypothetical protein  35.07 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3975  hypothetical protein  31.92 
 
 		 264 aa  120  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0660  hypothetical protein  31.8 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.12207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0661  hypothetical protein  33.18 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.47122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3361  hypothetical protein  33.18 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2980  hypothetical protein  30.61 
 
 		 277 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0556793 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04471  transmembrane protein  31.05 
 
 		 261 aa  111  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.981003  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2559  hypothetical protein  29.65 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.341104  normal  0.0354824 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0730  PAP2 superfamily protein  30.17 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  37.44 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.120651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2735  membrane protein  31.96 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.946683  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1558  hypothetical protein  32.73 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2650  hypothetical protein  31.96 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1864  PAP2 superfamily protein  31.28 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2994  hypothetical protein  28 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0439979 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1855  hypothetical protein  30.1 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0552137  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1784  hypothetical protein  30.2 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.277782  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2893  PAP2 superfamily protein  29.13 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00999602  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2706  hypothetical protein  29.52 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3092  PAP2 superfamily protein  29.61 
 
 		 290 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.315092  normal  0.505401 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0932  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.63 
 
 		 258 aa  98.6  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0321  PAP2 superfamily protein  28 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1333  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.47 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.134146 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0733  hypothetical protein  30.48 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1722  hypothetical protein  26.49 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239602 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1755  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.64 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2373  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  29.79 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1044  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.83 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2501  PAP2 superfamily protein  31.08 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1954  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  31.94 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.556435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3592  hypothetical protein  28.31 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0197  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  32.42 
 
 		 282 aa  80.5  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.296515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1873  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  33.33 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1165  hypothetical protein  26.24 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.103392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3872  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like protein  29.69 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3284  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  31.02 
 
 		 242 aa  77.8  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0420172  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4579  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein  31.88 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18810  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.14 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000200357  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4633  PAP2 (acid phosphatase) superfamily protein-like  28.17 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.432325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1241  hypothetical protein  26.17 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.269438 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0769  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.23 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1769  NADH:ubiquinone oxidoreductase, Na(+)-translocating, F subunit  26.55 
 
 		 227 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0165224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3625  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.77 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00395759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3619  PAP2 family protein  31.17 
 
 		 99 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3624  phosphoesterase, PA-phosphatase related  24.89 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0712  phosphoesterase, PA-phosphatase related  25.87 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.991586 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>