146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3150 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2794  hypothetical protein  68.5 
 
 		 487 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3150  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  942    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1935  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  68.3 
 
 		 473 aa  636    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55600  hypothetical protein  65.68 
 
 		 471 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.325851 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4840  hypothetical protein  64.12 
 
 		 471 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2522  hypothetical protein  65.9 
 
 		 476 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0740789  normal  0.855778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2427  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  63.85 
 
 		 472 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3118  hypothetical protein  64.27 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.617034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2599  hypothetical protein  64.27 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.938894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2739  hypothetical protein  63.85 
 
 		 472 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.203149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2379  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase-like protein  55.51 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.286987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02090  hypothetical protein  50.42 
 
 		 472 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0974  hypothetical protein  32.64 
 
 		 473 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1094  hypothetical protein  38.85 
 
 		 437 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.095311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0829  hypothetical protein  36.15 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.692902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2165  hypothetical protein  33.4 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1743  hypothetical protein  35.5 
 
 		 432 aa  193  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2598  hypothetical protein  28.49 
 
 		 506 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1941  hypothetical protein  31.71 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0469275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2299  hypothetical protein  32.16 
 
 		 505 aa  164  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02867  hypothetical protein  28.1 
 
 		 467 aa  161  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2733  hypothetical protein  33.49 
 
 		 441 aa  160  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.340285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2887  hypothetical protein  32.11 
 
 		 495 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524264  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2745  hypothetical protein  31.49 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4524  hypothetical protein  28.97 
 
 		 528 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0691  hypothetical protein  31.15 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0509  hypothetical protein  31.15 
 
 		 491 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1475  hypothetical protein  30.94 
 
 		 488 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2903  hypothetical protein  30.94 
 
 		 488 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0113  hypothetical protein  30.94 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0526  hypothetical protein  31.15 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003015  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.36 
 
 		 467 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.600573  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4129  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  30.62 
 
 		 527 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0035  hypothetical protein  26.5 
 
 		 484 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0444  hypothetical protein  30.12 
 
 		 491 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.404806  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4622  hypothetical protein  29.11 
 
 		 540 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0814384  normal  0.0497308 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4489  hypothetical protein  29.11 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0757544  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0517  hypothetical protein  31.76 
 
 		 405 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4537  hypothetical protein  30.54 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0203  hypothetical protein  29.18 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2214  hypothetical protein  30.63 
 
 		 483 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2827  hypothetical protein  30.63 
 
 		 498 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0608535  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6270  hypothetical protein  29.03 
 
 		 492 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.656674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6157  hypothetical protein  30.63 
 
 		 498 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.594108  normal  0.405129 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6830  hypothetical protein  29.7 
 
 		 459 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2838  hypothetical protein  29.98 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6870  hypothetical protein  29.47 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0618  hypothetical protein  30.83 
 
 		 392 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0254373 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0476  hypothetical protein  30.88 
 
 		 495 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1971  hypothetical protein  28.24 
 
 		 489 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6768  hypothetical protein  29.55 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3997  hypothetical protein  28.57 
 
 		 499 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1226  hypothetical protein  31.09 
 
 		 431 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1383  hypothetical protein  27.98 
 
 		 593 aa  123  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.573523  normal  0.0118968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0055  hypothetical protein  26.78 
 
 		 536 aa  123  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1834  hypothetical protein  31.26 
 
 		 478 aa  123  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000159073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4575  hypothetical protein  29.05 
 
 		 500 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.782674  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2530  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  27.34 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.397333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3165  hypothetical protein  28.41 
 
 		 589 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.907765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1326  nucleotidyltransferase/DNA polymerase  26.67 
 
 		 473 aa  116  6.9999999999999995e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1533  hypothetical protein  28.63 
 
 		 466 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110393  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1559  hypothetical protein  28.88 
 
 		 477 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.293786 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1545  hypothetical protein  30.36 
 
 		 470 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00402889 
 
 
-
 
NC_003296  RS01908  hypothetical protein  27 
 
 		 523 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.223055 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5035  hypothetical protein  28.57 
 
 		 467 aa  109  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.878273  normal  0.0411477 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1766  hypothetical protein  31.78 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.569912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2671  hypothetical protein  32.5 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.101016 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0108  putative DNA repair enzyme  25.75 
 
 		 534 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0727599 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1458  putative DNA repair enzyme  25.38 
 
 		 534 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1966  hypothetical protein  31.78 
 
 		 469 aa  107  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.630688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3891  putative nucleotidyltransferase protein  25.96 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0759407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1332  hypothetical protein  28.45 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1537  hypothetical protein  28.01 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4497  hypothetical protein  28.45 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0330891 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0809  hypothetical protein  26.41 
 
 		 507 aa  104  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2902  hypothetical protein  32.89 
 
 		 547 aa  103  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.107212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2387  hypothetical protein  26.94 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.434046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5156  hypothetical protein  27 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.249554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4462  hypothetical protein  27.31 
 
 		 525 aa  102  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0070  hypothetical protein  29.11 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2344  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.92 
 
 		 499 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0116755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3146  hypothetical protein  26.6 
 
 		 507 aa  99.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41691  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1870  hypothetical protein  30.04 
 
 		 440 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4948  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  22.75 
 
 		 519 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.777522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3264  hypothetical protein  27.43 
 
 		 477 aa  96.7  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3766  hypothetical protein  25.1 
 
 		 486 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3022  hypothetical protein  25.81 
 
 		 471 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.302557 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2779  hypothetical protein  27.1 
 
 		 545 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.989391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3469  hypothetical protein  28.63 
 
 		 480 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3381  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.51 
 
 		 499 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130693  normal  0.720575 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4895  hypothetical protein  29.7 
 
 		 443 aa  94.4  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.275823 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2399  cytosolic protein  22.7 
 
 		 500 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.843761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00039  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  21.6 
 
 		 484 aa  93.2  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000511104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3205  hypothetical protein  28.05 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0102672  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3293  nucleotidyltransferase/DNA polymerase involved in DNA repair-like protein  25.62 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5394  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  22.41 
 
 		 503 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0080  hypothetical protein  27.88 
 
 		 489 aa  91.3  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2986  putative DNA-directed DNA polymerase  24.6 
 
 		 529 aa  90.5  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.579616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0176  hypothetical protein  26 
 
 		 433 aa  89.4  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.876193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5202  hypothetical protein  24.63 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.45217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>