More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1961 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1961  Beta-lactamase-like  100 
 
 		 327 aa  671    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5335  putative metallo-beta-lactamase; putative exported protein  51.4 
 
 		 351 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000323942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2021  beta-lactamase domain protein  51.72 
 
 		 334 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.102483  normal  0.869381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2214  hypothetical protein  52.41 
 
 		 339 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5401  Beta-lactamase-like  52.7 
 
 		 342 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2415  beta-lactamase domain protein  51.03 
 
 		 336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.991306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2878  Beta-lactamase-like  49.67 
 
 		 327 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3620  beta-lactamase domain protein  48.9 
 
 		 326 aa  282  4.0000000000000003e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3401  beta-lactamase domain protein  44.78 
 
 		 324 aa  263  3e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20427  normal  0.272374 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6125  beta-lactamase domain protein  44.05 
 
 		 332 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.396338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6043  Beta-lactamase-like  46.21 
 
 		 327 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.73428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2378  putative metallo-beta-lactamase  44.11 
 
 		 330 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.302327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1376  methyl parathion hydrolase  45 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0821  beta-lactamase domain protein  41.61 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3729  beta-lactamase domain-containing protein  43.09 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3377  beta-lactamase domain protein  40.32 
 
 		 329 aa  241  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5667  beta-lactamase domain protein  41.81 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3532  beta-lactamase domain protein  43 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.491749  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3375  beta-lactamase domain protein  42.43 
 
 		 327 aa  235  9e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3845  beta-lactamase domain-containing protein  44 
 
 		 320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5828  beta-lactamase domain-containing protein  42.63 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.593332  normal  0.577974 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3518  beta-lactamase domain-containing protein  40.54 
 
 		 335 aa  230  3e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2600  beta-lactamase domain protein  41.36 
 
 		 341 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3476  beta-lactamase-like  40.8 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.907089  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0301  beta-lactamase domain protein  42.61 
 
 		 322 aa  228  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5611  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 		 313 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0296607  normal  0.233668 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0855  beta-lactamase domain protein  40.96 
 
 		 324 aa  222  8e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6124  Beta-lactamase-like  40.97 
 
 		 328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0914  beta-lactamase domain protein  35.59 
 
 		 311 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0640856  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7014  beta-lactamase domain-containing protein  42.18 
 
 		 344 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0930659 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1481  beta-lactamase-like  41.67 
 
 		 348 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.404324  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6348  beta-lactamase domain-containing protein  41.67 
 
 		 348 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0118  beta-lactamase-like protein  40.14 
 
 		 339 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2140  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 		 293 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2455  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 		 293 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2177  beta-lactamase domain-containing protein  36.27 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.438356 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3238  metallo-beta-lactamase  42.29 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.192264  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1952  metallo-beta-lactamase family protein  30.87 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59502  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2325  hypothetical protein  31.31 
 
 		 321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.281842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1477  twin-arginine translocation pathway signal  34.85 
 
 		 322 aa  162  7e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.214116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2192  beta-lactamase domain-containing protein  37.59 
 
 		 290 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.119061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1359  beta-lactamase domain-containing protein  31.92 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.57457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1885  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5230  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 		 333 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.419907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5263  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 326 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000854827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4400  beta-lactamase domain-containing protein  35.09 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.179806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4919  beta-lactamase domain-containing protein  34.94 
 
 		 287 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0578  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.456404 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1473  beta-lactamase-like  35.11 
 
 		 287 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00744617  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1682  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 		 291 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.779181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2486  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0378  beta-lactamase domain-containing protein  31.21 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.433622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2825  beta-lactamase-like  31.42 
 
 		 329 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0338  metallo-beta-lactamase family protein  33.45 
 
 		 277 aa  142  7e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0519509  normal  0.539705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0431  beta-lactamase domain protein  32.64 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3592  beta-lactamase domain protein  32.73 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.869389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2767  beta-lactamase domain protein  29.14 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.506299  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0912  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.66 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3910  aldehyde dehydrogenase  32.13 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.259628 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0664  metal dependent hydrolase  38.43 
 
 		 238 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3268  beta-lactamase domain-containing protein  32.37 
 
 		 318 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.629137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0612  beta-lactamase domain protein  32.41 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2964  beta-lactamase domain-containing protein  34.59 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0290  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 		 285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2787  beta-lactamase domain-containing protein  30.51 
 
 		 305 aa  136  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1564  beta-lactamase domain protein  29.82 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.074508  normal  0.0114849 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5820  beta-lactamase domain-containing protein  29.81 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0920097 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2457  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.047493 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1716  beta-lactamase domain-containing protein  28.66 
 
 		 327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.692179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0756  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.401313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7261  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 301 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1993  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1157  beta-lactamase domain protein  31.75 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0062155 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5688  beta-lactamase-like  32.44 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6052  beta-lactamase domain-containing protein  32.44 
 
 		 281 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.825618 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6536  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123702  normal  0.116325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3433  beta-lactamase domain protein  30.11 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0476  beta-lactamase domain protein  30.5 
 
 		 330 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2976  twin-arginine translocation pathway signal  27.81 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.340706 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5395  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4159  beta-lactamase domain-containing protein  31.02 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.274128  normal  0.812615 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0705  beta-lactamase domain-containing protein  31.31 
 
 		 329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6085  beta-lactamase domain protein  31.03 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.621256  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2454  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0799  hypothetical protein  31.99 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2513  beta-lactamase domain-containing protein  26.99 
 
 		 331 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5891  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 		 301 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.126369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3769  Beta-lactamase-like  30.82 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2001  beta-lactamase domain protein  29.9 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1641  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.945334 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2983  beta-lactamase domain-containing protein  30.77 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5354  beta-lactamase domain-containing protein  28.17 
 
 		 322 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1642  beta-lactamase domain protein  29.57 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.526333  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0028  Beta-lactamase-like  32.6 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.739364  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0380  beta-lactamase domain-containing protein  30.82 
 
 		 306 aa  126  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.887943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2354  beta-lactamase domain-containing protein  28.8 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2276  twin-arginine translocation pathway signal  31.51 
 
 		 312 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5731  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2803  beta-lactamase domain-containing protein  30 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.428176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2842  Beta-lactamase-like  29.24 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.577034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>