57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2633 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  71.77 
 
 		 504 aa  728    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  100 
 
 		 544 aa  1082    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  81.68 
 
 		 551 aa  856    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  29.52 
 
 		 498 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  26.63 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  24.17 
 
 		 528 aa  117  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  24.9 
 
 		 503 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  27.42 
 
 		 530 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  26.58 
 
 		 558 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.63 
 
 		 535 aa  94  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.95 
 
 		 491 aa  89  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  24.23 
 
 		 581 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  26.24 
 
 		 540 aa  87  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  24.22 
 
 		 535 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25.76 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22.98 
 
 		 541 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  26.15 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  25 
 
 		 561 aa  80.1  0.00000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  23.68 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  24.86 
 
 		 581 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  24.57 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.12 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.61 
 
 		 545 aa  77  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  23.5 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  23.96 
 
 		 542 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.09 
 
 		 569 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  23.08 
 
 		 550 aa  74.7  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  30.15 
 
 		 510 aa  74.7  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  25.19 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  22.6 
 
 		 543 aa  72  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  24.59 
 
 		 563 aa  71.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  24.24 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  23.97 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  22.2 
 
 		 535 aa  65.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  21.61 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  21.57 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  23.46 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  21.32 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  24.58 
 
 		 579 aa  56.6  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  24.69 
 
 		 849 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  21.52 
 
 		 566 aa  56.2  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  21.45 
 
 		 574 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  22.77 
 
 		 572 aa  53.9  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.9 
 
 		 562 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  23.1 
 
 		 602 aa  53.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.9 
 
 		 562 aa  53.5  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.42 
 
 		 562 aa  53.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  32.69 
 
 		 163 aa  52.8  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  22.75 
 
 		 586 aa  50.4  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.02 
 
 		 561 aa  50.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  33.33 
 
 		 546 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  23.3 
 
 		 562 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  23.3 
 
 		 562 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  28.48 
 
 		 581 aa  45.8  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  22.86 
 
 		 583 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  25.34 
 
 		 581 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  22.06 
 
 		 229 aa  43.9  0.008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>