217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2335 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2335  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 338 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0387808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0139  FAD dependent oxidoreductase  56.34 
 
 		 348 aa  309  5e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.297271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2540  FAD dependent oxidoreductase  53.39 
 
 		 353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0170113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0880  oxidoreductase  52.8 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0146  FAD dependent oxidoreductase  50.15 
 
 		 346 aa  289  5.0000000000000004e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00168666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0141  FAD dependent oxidoreductase  51.62 
 
 		 353 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0153  FAD dependent oxidoreductase  52.8 
 
 		 352 aa  272  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4487  FAD dependent oxidoreductase  38.48 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3154  FAD dependent oxidoreductase  39.08 
 
 		 392 aa  182  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.358247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  40.38 
 
 		 417 aa  172  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2890  FAD dependent oxidoreductase  39.94 
 
 		 392 aa  169  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0610119 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 		 378 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.36 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  29.81 
 
 		 398 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1866  putative D-amino acid oxidase  28.85 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.17 
 
 		 374 aa  90.1  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2269  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  29.11 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0136  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  39.31 
 
 		 361 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  28.49 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2406  FAD dependent oxidoreductase  28.14 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000101651  normal  0.0131925 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  38.19 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1956  oxidoreductase, FAD-binding  27.43 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.034563  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1624  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.909673  hitchhiker  0.0000164974 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5036  glycine oxidase ThiO  26.43 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  38.64 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  38.1 
 
 		 366 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  27.3 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  26.7 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  29.75 
 
 		 384 aa  72.8  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  28.07 
 
 		 378 aa  72.4  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 365 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  35.42 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  36.43 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  34.72 
 
 		 365 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  36.84 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0721  FAD dependent oxidoreductase  35.34 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  24.45 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  28.77 
 
 		 371 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  28.99 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  36.36 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2715  oxidoreductase, FAD-binding  40.2 
 
 		 361 aa  67  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.725073  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  25.56 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  26.46 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  26.12 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  26.39 
 
 		 371 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1568  glycine oxidase ThiO  30.43 
 
 		 652 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272773 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  27.03 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  26.39 
 
 		 371 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3219  thiazole synthase  26.24 
 
 		 652 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  25.83 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  22.87 
 
 		 369 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  25.83 
 
 		 371 aa  63.9  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1461  FAD dependent oxidoreductase  34.19 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942129  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  25.83 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  30.23 
 
 		 334 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  25.83 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  23.84 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31544  predicted protein  35.66 
 
 		 1033 aa  63.2  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  30.06 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  26.68 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0807  glycine oxidase ThiO  23.61 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.35515e-47 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  23.16 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  23.16 
 
 		 369 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 		 376 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  26.11 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  25.83 
 
 		 371 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  27.14 
 
 		 373 aa  62  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  23.16 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0640  glycine oxidase  22.74 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.43 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0646  glycine oxidase ThiO  22.84 
 
 		 369 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  25.42 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4550  glycine oxidase ThiO  35.2 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  26.17 
 
 		 392 aa  61.2  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  31.13 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  30.61 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1793  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.075637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0520  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  27.43 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0537  FAD dependent oxidoreductase  29.63 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.872251 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2071  glycine oxidase, putative  29.23 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00506599  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  22.8 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  26.59 
 
 		 325 aa  58.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  22.59 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  28.4 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1415  glycine oxidase ThiO  30.3 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0617  glycine oxidase ThiO  22.5 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4109  glycine oxidase ThiO  28.29 
 
 		 666 aa  57  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  27.35 
 
 		 375 aa  57  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1201  iminodiacetate oxidase, putative  30.91 
 
 		 367 aa  57  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  26.15 
 
 		 375 aa  57  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  27.57 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1783  FAD dependent oxidoreductase  28.87 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.359042  normal  0.766074 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1426  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0313349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  27.17 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.363265 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>