More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1984 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3131  dihydroxy-acid dehydratase  69.74 
 
 		 576 aa  783    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.696259  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2230  dihydroxy-acid dehydratase  71.7 
 
 		 576 aa  832    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.941332 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0129  dihydroxy-acid dehydratase  83.33 
 
 		 577 aa  996    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.256521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3010  dihydroxy-acid dehydratase  73.44 
 
 		 576 aa  865    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0062  dihydroxy-acid dehydratase  77.47 
 
 		 587 aa  931    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2494  dihydroxy-acid dehydratase  68.72 
 
 		 574 aa  790    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000806623  normal  0.595086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2806  dihydroxy-acid dehydratase  70.65 
 
 		 574 aa  801    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1688  dihydroxy-acid dehydratase  70.83 
 
 		 575 aa  813    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1909  dihydroxy-acid dehydratase  71.01 
 
 		 576 aa  823    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.832097 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2924  dihydroxy-acid dehydratase  70.88 
 
 		 576 aa  821    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4456  dihydroxy-acid dehydratase  69.77 
 
 		 574 aa  793    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.40325 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1954  dihydroxy-acid dehydratase  71.53 
 
 		 576 aa  831    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1984  dihydroxy-acid dehydratase  100 
 
 		 577 aa  1177    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.9458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5056  dihydroxy-acid dehydratase  71.8 
 
 		 577 aa  821    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.644776  hitchhiker  0.0033961 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5368  dihydroxy-acid dehydratase  71.63 
 
 		 577 aa  818    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0341444  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0886  dihydroxy-acid dehydratase  53.24 
 
 		 558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2674  dihydroxy-acid dehydratase  53.57 
 
 		 568 aa  571  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.143289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3271  dihydroxy-acid dehydratase  53.96 
 
 		 561 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0753246 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0711  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 557 aa  558  1e-158  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3109  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 573 aa  555  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1548  dihydroxy-acid dehydratase  53.51 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0456866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1660  dihydroxy-acid dehydratase  52.51 
 
 		 568 aa  544  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.06554 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4952  dihydroxy-acid dehydratase  50.99 
 
 		 567 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0624  dihydroxy-acid dehydratase  50.17 
 
 		 580 aa  535  1e-151  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0705  dihydroxy-acid dehydratase  51.54 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4076  dihydroxy-acid dehydratase  51.99 
 
 		 575 aa  537  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3669  dihydroxy-acid dehydratase  49.73 
 
 		 562 aa  533  1e-150  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.281782 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0901  dihydroxy-acid dehydratase  51.15 
 
 		 588 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.356877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2114  dihydroxy-acid dehydratase  50.09 
 
 		 578 aa  528  1e-149  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1524  dihydroxy-acid dehydratase  50.18 
 
 		 588 aa  529  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00289701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5162  dihydroxy-acid dehydratase  50.71 
 
 		 588 aa  525  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1326  dihydroxy-acid dehydratase  51.18 
 
 		 566 aa  526  1e-148  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.303836  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2280  dihydroxy-acid dehydratase  48.95 
 
 		 572 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000860305 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2347  dihydroxy-acid dehydratase  48.35 
 
 		 579 aa  523  1e-147  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1134  dihydroxy-acid dehydratase  50.54 
 
 		 570 aa  521  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0498657  hitchhiker  0.00011132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0237  dihydroxy-acid dehydratase  51.42 
 
 		 578 aa  524  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2540  dihydroxy-acid dehydratase  49.37 
 
 		 573 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0297342  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10650  dihydroxyacid dehydratase  49.82 
 
 		 582 aa  521  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0955511 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3419  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 567 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0173  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 565 aa  520  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0782  dihydroxy-acid dehydratase  45.96 
 
 		 557 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.729892  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0196  dihydroxy-acid dehydratase  49.09 
 
 		 566 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0486  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 589 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113463 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08361  dihydroxy-acid dehydratase  45.6 
 
 		 557 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1711  dihydroxy-acid dehydratase  48.6 
 
 		 571 aa  512  1e-144  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.835753  normal  0.93934 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08341  dihydroxy-acid dehydratase  45.42 
 
 		 557 aa  514  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.924218  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1406  dihydroxy-acid dehydratase  49.82 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1347  dihydroxy-acid dehydratase  48.31 
 
 		 577 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0142863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0146  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 580 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0155  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 580 aa  514  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.826193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2526  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 573 aa  513  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0136  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 580 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0617591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10190  dihydroxy-acid dehydratase  49.1 
 
 		 575 aa  510  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.539259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0639  dihydroxy-acid dehydratase  47.56 
 
 		 557 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2389  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 570 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0116  dihydroxy-acid dehydratase  49 
 
 		 555 aa  505  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2804  dihydroxy-acid dehydratase  46.84 
 
 		 557 aa  507  9.999999999999999e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416197  normal  0.582651 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1240  dihydroxy-acid dehydratase  47.74 
 
 		 564 aa  506  9.999999999999999e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.325015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11990  dihydroxy-acid dehydratase  48.2 
 
 		 579 aa  505  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.885522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2450  dihydroxy-acid dehydratase  50.27 
 
 		 658 aa  508  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0848  dihydroxy-acid dehydratase  47.14 
 
 		 558 aa  503  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0103963  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1758  dihydroxy-acid dehydratase  46.61 
 
 		 563 aa  504  1e-141  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.771853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08091  dihydroxy-acid dehydratase  45.6 
 
 		 559 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.287074  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1334  dihydroxy-acid dehydratase  49.46 
 
 		 563 aa  503  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2259  dihydroxyacid dehydratase  49.28 
 
 		 552 aa  502  1e-141  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1221  dihydroxy-acid dehydratase  46.84 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.240035 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09881  dihydroxy-acid dehydratase  45.59 
 
 		 556 aa  503  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.457791  normal  0.235349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08490  dihydroxy-acid dehydratase  50.82 
 
 		 571 aa  503  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3348  dihydroxy-acid dehydratase  45.93 
 
 		 557 aa  498  1e-140  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3155  dihydroxy-acid dehydratase  46.36 
 
 		 559 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2713  dihydroxy-acid dehydratase  45.82 
 
 		 554 aa  501  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.387248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3112  dihydroxy-acid dehydratase  47.21 
 
 		 556 aa  498  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.735973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0847  dihydroxy-acid dehydratase  46.37 
 
 		 567 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0511705 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1260  dihydroxy-acid dehydratase  46.67 
 
 		 557 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.77083  normal  0.952172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2676  dihydroxy-acid dehydratase  45.57 
 
 		 557 aa  497  1e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.531561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0019  dihydroxy-acid dehydratase  45.89 
 
 		 561 aa  498  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0832  dihydroxy-acid dehydratase  45.75 
 
 		 557 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.204756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2979  dihydroxy-acid dehydratase  46 
 
 		 559 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.633648  hitchhiker  0.000413857 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1593  dihydroxy-acid dehydratase  45.74 
 
 		 556 aa  497  1e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16921  dihydroxy-acid dehydratase  45.95 
 
 		 556 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2216  dihydroxy-acid dehydratase  45.57 
 
 		 557 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1222  dihydroxy-acid dehydratase  46.49 
 
 		 557 aa  495  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.640338  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0827  dihydroxy-acid dehydratase  45.39 
 
 		 557 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3634  dihydroxy-acid dehydratase  45.75 
 
 		 557 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.886517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1925  dihydroxy-acid dehydratase  49 
 
 		 561 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.906776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0302  dihydroxy-acid dehydratase  44.91 
 
 		 552 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1844  dihydroxy-acid dehydratase  46.73 
 
 		 554 aa  495  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0665  dihydroxy-acid dehydratase  46.11 
 
 		 552 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000174611  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08500  dihydroxy-acid dehydratase  48.29 
 
 		 575 aa  489  1e-137  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0463604  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2412  dihydroxy-acid dehydratase  45.75 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0023  dihydroxy-acid dehydratase  45.5 
 
 		 563 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.393007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2530  dihydroxy-acid dehydratase  45.65 
 
 		 564 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0988  dihydroxy-acid dehydratase  45.03 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2821  dihydroxy-acid dehydratase  46.21 
 
 		 561 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00495915 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1387  dihydroxy-acid dehydratase  46.38 
 
 		 560 aa  489  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.63064  normal  0.987031 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1247  dihydroxy-acid dehydratase  49.47 
 
 		 595 aa  489  1e-137  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.853909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2082  dihydroxy-acid dehydratase  46.09 
 
 		 562 aa  488  1e-136  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0677  dihydroxy-acid dehydratase  45.93 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2952  dihydroxy-acid dehydratase  45.93 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0058068  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1647  dihydroxy-acid dehydratase  45.93 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.332058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>