194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1812 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1812  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  570  1e-161  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916129  decreased coverage  0.00793411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1338  PfkB  49.83 
 
 		 302 aa  265  1e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1434  ribokinase-like domain-containing protein  56.78 
 
 		 295 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00349214 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2307  PfkB  53.02 
 
 		 296 aa  248  6e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.013346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1509  ribokinase-like domain-containing protein  56.41 
 
 		 294 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0113854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1547  putative carbohydrate kinase  50.92 
 
 		 321 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.23954 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6216  carbohydrate kinase PfkB family  50.56 
 
 		 304 aa  208  8e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  26.22 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  29.14 
 
 		 321 aa  85.9  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  28.78 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  34.48 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  29.63 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  29.63 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  29.52 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  31.37 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  36.33 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  29.3 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  29.3 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  29.3 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  29.3 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  29.3 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  29.3 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  28.94 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  23.68 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  28.94 
 
 		 362 aa  66.2  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  24.63 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  27.01 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  24.91 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4043  ribokinase-like domain-containing protein  22.71 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 360 aa  62.4  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  32.33 
 
 		 377 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 		 380 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  24.23 
 
 		 363 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  30.29 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  24.48 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  38.64 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  24.48 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  32.64 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.48 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  24.48 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.48 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  25 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04400  sugar kinase, ribokinase  27.68 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.736771 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  22.08 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 		 312 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1264  PfkB  30.9 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  31.29 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 		 372 aa  56.2  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  36.9 
 
 		 324 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0562  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  27.67 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3843  fructoselysine 6-kinase  26.02 
 
 		 261 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0339  fructoselysine 6-kinase  25.59 
 
 		 261 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.457632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  30.08 
 
 		 324 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 		 326 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1884  ribokinase  22.22 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0118065  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  36.78 
 
 		 323 aa  52.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  23.49 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3751  fructoselysine 6-kinase  25.2 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03224  fructoselysine 6-kinase  25.2 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0339  PfkB domain protein  25.2 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2370  putative sugar kinase  28.42 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.976267  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  23.38 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  25.08 
 
 		 311 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03176  hypothetical protein  25.2 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3569  fructoselysine 6-kinase  25.2 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2297  ribokinase  26.16 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0434925  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1030  ribokinase-like domain-containing protein  28.42 
 
 		 316 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04580  Ribokinase  22.1 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.05 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  29.71 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1010  ribokinase-like domain-containing protein  35.51 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3778  PfkB domain protein  39.02 
 
 		 297 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00891877  normal  0.801682 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2764  PfkB domain protein  30.53 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.11778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  35.8 
 
 		 327 aa  50.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1580  ribokinase-like domain-containing protein  37.18 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0863941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  31.52 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1603  ribokinase  22.22 
 
 		 310 aa  50.1  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000677641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0873  ribokinase-like domain-containing protein  31.41 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  25.51 
 
 		 307 aa  50.1  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  24.1 
 
 		 313 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  29.77 
 
 		 303 aa  49.7  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>