More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0316 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0316  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 320 aa  650    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5290  glycosyl transferase family 2  45.37 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4255  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2577  glycosyl transferase family protein  45.03 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3137  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.03 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  0.406504 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2908  glycosyl transferase family protein  44.55 
 
 		 325 aa  256  5e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.928359 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2718  glycosyl transferase family protein  44.92 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.543733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2397  glycosyl transferase family protein  45.57 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2550  glycosyl transferase family 2  41.03 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.324951 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3565  glycosyl transferase family 2  40.43 
 
 		 340 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1005  putative glycosyl transferase, group 2 family protein  42.55 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.626376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2373  glycosyl transferase family protein  41.43 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2877  glycosyl transferase family 2  41.08 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.257964  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2969  glycosyl transferase family 2  40.66 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.64 
 
 		 338 aa  162  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1850  glycosyl transferase family 2  38.5 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1813  glycosyl transferase family protein  38.5 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1703  glycosyl transferase family 2  33.59 
 
 		 353 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1376  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.75 
 
 		 369 aa  125  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.866808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2046  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 341 aa  89  9e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  25.7 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  29.75 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0484  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05340  Glycosyl transferase, family 2  36.36 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000520172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 470 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 		 528 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 841 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  27.45 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  27.23 
 
 		 1099 aa  63.5  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0452  putative glycosyl transferase  25.47 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 		 311 aa  63.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4035  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  29.49 
 
 		 470 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0149  glycosyl transferase family 2  26.07 
 
 		 357 aa  62.8  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.473763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2880  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.764984  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 284 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  26.67 
 
 		 752 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.33 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 		 924 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0657  glycosyl transferase family 2  27.47 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.56 
 
 		 283 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11300  predicted glycosyltransferase  30.73 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.438529  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3773  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3169  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  25.45 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0633  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.49 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5890  glycosyl transferase family 2  27 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  25.23 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2189  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3563  glycosyl transferase family 2  27.51 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365642  normal  0.553979 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2477  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  29.95 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  29.95 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 		 785 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  23.28 
 
 		 260 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  34.48 
 
 		 362 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3178  glycosyl transferase family protein  25.73 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  21.46 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  23.93 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  22.67 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0248  glycosyl transferase family 2  27.31 
 
 		 348 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  28.7 
 
 		 235 aa  55.5  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19050  glycosyl transferase  26.27 
 
 		 411 aa  54.7  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.251167  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.66 
 
 		 722 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 		 287 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0383  glycosyl transferase family protein  26.36 
 
 		 331 aa  55.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  25 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  26.15 
 
 		 298 aa  53.9  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3594  glycosyl transferase family 2  29.28 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.66 
 
 		 403 aa  53.9  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  24.87 
 
 		 316 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  27.47 
 
 		 1644 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 		 297 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 227 aa  53.5  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  27.47 
 
 		 1644 aa  53.5  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  27.51 
 
 		 284 aa  53.1  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 258 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3110  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  24.29 
 
 		 333 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3170  glycosyl transferase family protein  37.74 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.845407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.68 
 
 		 841 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  24.9 
 
 		 2401 aa  53.1  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0140  glycosyl transferase family protein  27.75 
 
 		 244 aa  53.1  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>