More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1917 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1917  undecaprenyl diphosphate synthase  100 
 
 
251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.81385e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1254  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.81 
 
 
246 aa  289  4e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000210939  hitchhiker  0.00135433 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2752  undecaprenyl pyrophosphate synthase  58.05 
 
 
249 aa  287  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.497548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1489  undecaprenyl pyrophosphate synthase  57.2 
 
 
249 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00866438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1917  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.24 
 
 
246 aa  277  1e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3729  undecaprenyl pyrophosphate synthase  54.89 
 
 
256 aa  277  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000025897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1691  undecaprenyl diphosphate synthase  49.19 
 
 
246 aa  267  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2712  undecaprenyl pyrophosphate synthase  55.74 
 
 
246 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.221115  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0435  undecaprenyl diphosphate synthase  51.27 
 
 
276 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.064115  normal  0.101114 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0464  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  51.27 
 
 
285 aa  262  3e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1950  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
253 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1668  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.05 
 
 
253 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.225287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2048  undecaprenyl pyrophosphate synthase  53.19 
 
 
251 aa  261  8e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.454425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0433  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
282 aa  260  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3207  undecaprenyl diphosphate synthase  50.64 
 
 
266 aa  258  8e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000019604  hitchhiker  0.0000000636808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0985  undecaprenyl diphosphate synthase  52.14 
 
 
246 aa  256  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1051  undecaprenyl diphosphate synthase  51.68 
 
 
253 aa  255  4e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000164156  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1812  undecaprenyl diphosphate synthase  49.13 
 
 
248 aa  255  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000233358  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0401  undecaprenyl diphosphate synthase  50.84 
 
 
272 aa  255  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000128233  hitchhiker  0.0000340539 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0331  undecaprenyl diphosphate synthase  50.21 
 
 
276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.163815  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1356  undecaprenyl diphosphate synthase  50.86 
 
 
240 aa  252  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162548  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0478  undecaprenyl diphosphate synthase  52.4 
 
 
247 aa  251  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0264  undecaprenyl pyrophosphate synthase  51.53 
 
 
251 aa  249  4e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0398  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.97 
 
 
282 aa  249  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.216703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3705  undecaprenyl diphosphate synthase  51.32 
 
 
256 aa  248  9e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.153678  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3585  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  54.7 
 
 
251 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0914  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.56 
 
 
249 aa  246  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3706  undecaprenyl diphosphate synthase  52.79 
 
 
255 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3411  undecaprenyl pyrophosphate synthetase (di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase)  47.35 
 
 
260 aa  246  3e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4433  undecaprenyl diphosphate synthase  48.5 
 
 
245 aa  246  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0578119  normal  0.595421 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1199  undecaprenyl diphosphate synthase  49.78 
 
 
244 aa  245  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0136405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0844  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
249 aa  245  6e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.182424 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2624  undecaprenyl diphosphate synthase  48.26 
 
 
240 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000140477  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0886  di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase  48.68 
 
 
257 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000056248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1656  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1973  undecaprenyl diphosphate synthase  49.34 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1750  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  49.17 
 
 
291 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04320  Undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.79 
 
 
258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1782  undecaprenyl diphosphate synthase  50.42 
 
 
248 aa  243  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3674  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.56489  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3564  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3582  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0125  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.13 
 
 
249 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312961  normal  0.0375757 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3961  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  242  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3835  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3870  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.386864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0610  undecaprenyl diphosphate synthase  50.66 
 
 
252 aa  242  5e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.148358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3864  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  242  5e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.281196  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1847  undecaprenyl diphosphate synthase  49.79 
 
 
256 aa  242  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000092739  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2475  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  241  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000367791  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2918  undecaprenyl diphosphate synthase  53.48 
 
 
250 aa  241  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.15769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3921  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
257 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.878425  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2432  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.34 
 
 
248 aa  241  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1323  undecaprenyl pyrophosphate synthase  49.12 
 
 
258 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.364051  hitchhiker  0.000000000000272675 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3646  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
258 aa  239  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0097469  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4734  undecaprenyl diphosphate synthase  48.25 
 
 
249 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578001  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0583  undecaprenyl diphosphate synthase  50.88 
 
 
264 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4700  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50.22 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2631  undecaprenyl diphosphate synthase  47.23 
 
 
263 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000342439  normal  0.527492 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0486  undecaprenyl diphosphate synthase  48.41 
 
 
294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.407745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0128  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.7 
 
 
249 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1145  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
258 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000692152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3725  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
251 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3651  undecaprenyl diphosphate synthase  52.99 
 
 
251 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.86266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3192  undecaprenyl diphosphate synthase  48.73 
 
 
254 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0529  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
241 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3277  undecaprenyl diphosphate synthase  47.06 
 
 
264 aa  236  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000667775  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1038  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  48.95 
 
 
259 aa  237  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000636163  unclonable  0.0000000115387 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2037  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.68 
 
 
257 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2113  undecaprenyl diphosphate synthase  51.05 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1960  undecaprenyl diphosphate synthase  50.44 
 
 
273 aa  235  6e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.592737  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1923  undecaprenyl diphosphate synthase  54.63 
 
 
234 aa  235  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0594  undecaprenyl diphosphate synthase  47.39 
 
 
232 aa  234  7e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11831  undecaprenyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 
267 aa  234  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1587  undecaprenyl diphosphate synthase  48.29 
 
 
247 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0705  undecaprenyl diphosphate synthase  47.62 
 
 
228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000222485 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1193  undecaprenyl diphosphate synthase  48.91 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000857215  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0265  undecaprenyl diphosphate synthase  48.72 
 
 
312 aa  233  3e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.701414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0177  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
244 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000336524  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1384  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  49.15 
 
 
245 aa  232  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.380687  normal  0.0459529 
 
 
-
 
NC_004310  BR1158  undecaprenyl pyrophosphate synthase  50 
 
 
254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.500874  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0812  di-trans-poly-cis-decaprenylcistransferase  45.64 
 
 
252 aa  232  4.0000000000000004e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0447  undecaprenyl diphosphate synthase  49.35 
 
 
251 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00576081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2380  undecaprenyl diphosphate synthase  51.3 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01377  undecaprenyl diphosphate synthase  46.35 
 
 
261 aa  231  9e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0714251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2881  undecaprenyl diphosphate synthase  46.78 
 
 
266 aa  231  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000593074  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1115  undecaprenyl pyrophosphate synthase  47.52 
 
 
254 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1590  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.67 
 
 
244 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1516  undecaprenyl diphosphate synthase  48.68 
 
 
234 aa  230  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0685  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  46.47 
 
 
259 aa  230  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1126  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  50.84 
 
 
243 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1780  undecaprenyl diphosphate synthase  47.86 
 
 
247 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.959481 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1423  undecaprenyl diphosphate synthase  48.46 
 
 
254 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.241694  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0373  undecaprenyl diphosphate synthase  46.26 
 
 
236 aa  229  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1393  undecaprenyl pyrophosphate synthase  48.03 
 
 
260 aa  229  3e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3157  di-trans, poly-cis-decaprenylcistransferase  44.12 
 
 
264 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0130117  normal  0.0586851 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1558  undecaprenyl diphosphate synthase  43.93 
 
 
271 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445031  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0244  undecaprenyl pyrophosphate synthase  46.12 
 
 
249 aa  229  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000856656  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_317  undecaprenyl diphosphate synthase  45.37 
 
 
236 aa  229  4e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0690  undecaprenyl pyrophosphate synthetase  47.68 
 
 
270 aa  229  4e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000341789  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>