More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0979 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0979  two component sensor histidine kinase  100 
 
 		 550 aa  1143    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.325763  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1399  two component sensor histidine kinase  37.92 
 
 		 565 aa  347  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0010  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 		 508 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0502065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0604  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 1174 aa  152  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.42995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 508 aa  150  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0485  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 726 aa  145  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0662755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 711 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0008  sensory box histidine kinase/response regulator  27.2 
 
 		 516 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 719 aa  139  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0010  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 509 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.923259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 677 aa  136  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  26.59 
 
 		 867 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  29.5 
 
 		 1111 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2968  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 701 aa  126  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 620 aa  123  7e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.62 
 
 		 1131 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 1014 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 1017 aa  120  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0008  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 		 755 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.865749 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  23.17 
 
 		 621 aa  118  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3616  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 393 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159723  normal  0.789101 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 641 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 		 1043 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 639 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 958 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 639 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  28.15 
 
 		 617 aa  114  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 754 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3102  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 1211 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 639 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 1042 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  22.76 
 
 		 1629 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.67 
 
 		 905 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 1060 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 725 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 911 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 1039 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 880 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  27.16 
 
 		 539 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 359 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0871  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 		 763 aa  107  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.508031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 639 aa  107  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 640 aa  106  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.44 
 
 		 758 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 614 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 		 884 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 637 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.86 
 
 		 625 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 488 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 591 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 892 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0500  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  26.48 
 
 		 576 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 597 aa  104  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  23.39 
 
 		 608 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.39 
 
 		 608 aa  104  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 613 aa  104  5e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 		 933 aa  103  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 597 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 3470 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4555  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 406 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 611 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 718 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2558  histidine kinase  27.23 
 
 		 397 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.344287  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 722 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1630  sensory box histidine kinase  24.42 
 
 		 710 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00580838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1644  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 597 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 614 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  23.82 
 
 		 613 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  29.96 
 
 		 885 aa  101  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 456 aa  101  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.11 
 
 		 1084 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  25.18 
 
 		 762 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.19 
 
 		 1207 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 592 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  25.91 
 
 		 589 aa  100  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.94 
 
 		 1691 aa  100  8e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 		 475 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1945  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 690 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000961188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0857  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 698 aa  99.4  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0897898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 1010 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.65 
 
 		 1291 aa  99  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 718 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.48 
 
 		 930 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 467 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0218  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 695 aa  98.2  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  25.45 
 
 		 537 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  23.72 
 
 		 610 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2947  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 503 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2933  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 		 806 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.907124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  25.09 
 
 		 531 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 492 aa  98.6  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.73 
 
 		 453 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 897 aa  98.2  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 		 646 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>