254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0410 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  456  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  43.33 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  34.05 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  31.22 
 
 		 236 aa  101  9e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  37.58 
 
 		 248 aa  96.7  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  40.91 
 
 		 285 aa  95.1  7e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  34.09 
 
 		 257 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  30.24 
 
 		 283 aa  93.2  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  30.41 
 
 		 283 aa  91.7  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 		 271 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  32.75 
 
 		 278 aa  89  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  31.16 
 
 		 273 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 270 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  35.4 
 
 		 275 aa  86.3  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  41.28 
 
 		 350 aa  84.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  38.38 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  38.38 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  38.38 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  37.07 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  39.09 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  38.38 
 
 		 266 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  34.06 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  33.04 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  40.91 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  38.38 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  31.94 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  36.36 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  30.41 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  31.18 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  33.9 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  35.45 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  35.45 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  32 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  39.56 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  29.1 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  28.07 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  28.76 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  31.91 
 
 		 345 aa  77.8  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  35.35 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  35.9 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  34.71 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  34.71 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  35.92 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  27.57 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  31.36 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  34.58 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1529  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  normal  0.395847 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  31.36 
 
 		 322 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  27.32 
 
 		 263 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  27.32 
 
 		 263 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  27.32 
 
 		 263 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  27.32 
 
 		 263 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  27.32 
 
 		 263 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 318 aa  72  0.000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  34.58 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  27.32 
 
 		 263 aa  72  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  36.7 
 
 		 279 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  26.43 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  27.32 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  27.32 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  33.33 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4400  hypothetical protein  35.04 
 
 		 279 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.374202  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  33.33 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  27.32 
 
 		 263 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  34.21 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  27.46 
 
 		 262 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  33.33 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  33.03 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  34.34 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  29.26 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  31.78 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  29.84 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  32.48 
 
 		 488 aa  68.9  0.00000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  32.48 
 
 		 488 aa  68.9  0.00000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 		 251 aa  68.2  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 262 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  33.08 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 269 aa  67  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0780  tol-pal system protein YbgF  32.73 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  31.48 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2729  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000699161  hitchhiker  0.0000235132 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  29.32 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  27.41 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  32.04 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  32.8 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>