More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1661 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1661  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  100 
 
 
238 aa  479  1e-134  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0175002 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1034  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  85.71 
 
 
238 aa  426  1e-118  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000152795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1534  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  83.61 
 
 
238 aa  416  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.11001  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1468  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  81.93 
 
 
238 aa  412  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2181  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  59.41 
 
 
235 aa  289  2e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.290102  hitchhiker  0.0000501949 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1257  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  58.92 
 
 
242 aa  286  2e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.018938  hitchhiker  0.0000000057233 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1030  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  56.72 
 
 
240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.08615  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1428  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  53.56 
 
 
236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1606  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  44.26 
 
 
232 aa  192  4e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.877653  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1041  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  43.97 
 
 
234 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000448232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2571  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  41.91 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.613801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1794  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  41.42 
 
 
244 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.922708  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1136  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.75 
 
 
233 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000475056  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2092  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  39.09 
 
 
243 aa  158  9e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3806  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  40.25 
 
 
246 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1597  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  36.91 
 
 
236 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1720  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  36.91 
 
 
236 aa  144  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.996643  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1549  alanine--tRNA ligase  36.48 
 
 
236 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0332631  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1739  alanyl-tRNA synthetase domain protein  36.48 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1770  alanyl-tRNA synthetase domain protein  36.48 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1560  alanine--tRNA ligase  36.48 
 
 
236 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3604  alanyl-tRNA synthetase domain protein  36.52 
 
 
236 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1793  alanyl-tRNA synthetase domain-containing protein  36.48 
 
 
236 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1848  alanyl-tRNA synthetase domain protein  36.05 
 
 
236 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4831  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.33 
 
 
255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0107612  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1447  alanyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
882 aa  123  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0478  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.47 
 
 
238 aa  122  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2316  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  34.39 
 
 
243 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0821  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.48 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2194  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.99 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2149  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  36.33 
 
 
239 aa  118  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287127  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0823  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.67 
 
 
239 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0624764  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2509  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  32.64 
 
 
238 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0621  alanyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
910 aa  114  8.999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1000  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.33 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.332977  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0221  alanyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
907 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1638  alanyl-tRNA synthetase  34.32 
 
 
904 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1402  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4224  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.07 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  0.17727 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0379  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  33.33 
 
 
243 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.225416  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0770  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  33.33 
 
 
243 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1019  hypothetical protein  32.37 
 
 
247 aa  113  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.580747  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1096  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  33.33 
 
 
243 aa  113  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1263  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  32.02 
 
 
243 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.857416  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2345  Ala-tRNA(Pro) hydrolase  31.8 
 
 
237 aa  111  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1054  hypothetical protein  31.95 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2035  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.39 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1255  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  31.62 
 
 
243 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2301  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.41 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0988  hypothetical protein  34.71 
 
 
245 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0169723  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1384  alanyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
892 aa  109  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1993  alanyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 
896 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5605  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  32.02 
 
 
243 aa  108  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.675577  normal  0.974408 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1313  alanyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
900 aa  108  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1193  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  36.65 
 
 
252 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1395  alanyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
892 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0731  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.94 
 
 
249 aa  108  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2278  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.02 
 
 
243 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1666  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  32.02 
 
 
243 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.346483  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2228  alanyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
892 aa  107  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2313  aminoacyl-tRNA synthetase  33.06 
 
 
239 aa  106  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.938515  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2318  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  35.04 
 
 
237 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0513  alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
892 aa  106  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6121  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.04 
 
 
237 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4712  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  35.32 
 
 
403 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0289109  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0918  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.88 
 
 
239 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523038  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1241  alanyl-tRNA synthetase  35.17 
 
 
892 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.243126  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0367  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  30.31 
 
 
252 aa  104  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1616  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.11 
 
 
245 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.128558  normal  0.455534 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0919  alanyl-tRNA synthetase  35.37 
 
 
892 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.213328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4455  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
255 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0634638 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3853  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  32.94 
 
 
250 aa  103  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2025  threonyl/alanyl tRNA synthetase, SAD  29.34 
 
 
240 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0900  alanyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 
892 aa  102  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2141  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  32.78 
 
 
247 aa  102  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.316281  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3126  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.2 
 
 
250 aa  101  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1345  Alanyl-tRNA synthetase, class IIc-like protein  35.69 
 
 
249 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1437  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  31.84 
 
 
245 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.422716 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0730  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  36.73 
 
 
398 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00140336 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1364  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.47 
 
 
249 aa  99.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277683  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0849  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  30.29 
 
 
239 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.201539  normal  0.867542 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1995  metal-dependent hydrolases related to alanyl-tRNA synthetase  32.26 
 
 
246 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.140905  normal  0.529847 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0714  DHH domain-containing protein  33.76 
 
 
400 aa  95.1  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.148713  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0705  DHH domain-containing protein  33.33 
 
 
400 aa  95.1  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0618  Threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  33.33 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.920461  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1878  alanyl-tRNA synthetase  30.04 
 
 
245 aa  93.6  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3732  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.79 
 
 
400 aa  92.8  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.499023  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0657  alanyl-tRNA synthetase  32.92 
 
 
913 aa  92.4  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.459969  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0961  alanyl-tRNA synthetase-related protein  30.2 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1375  alanyl-tRNA synthetase-related protein  30.2 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0902986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0225  alanyl-tRNA synthetase-related protein  30.2 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0319301  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0417  alanyl-tRNA synthetase-related protein  30.2 
 
 
239 aa  88.6  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3643  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.71 
 
 
400 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1785  threonyl/alanyl tRNA synthetase domain-containing protein  30.2 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.170383  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0336  putative alanyl-tRNA synthetase related protein  30.2 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1871  putative alanyl-tRNA synthetase  30.2 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1023  alanyl-tRNA synthetase  31.96 
 
 
865 aa  87  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3652  alanyl-tRNA synthetase family protein  29.71 
 
 
400 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3310  threonyl/alanyl tRNA synthetase SAD  29.83 
 
 
411 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.463207  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0039  alanyl-tRNA synthetase  31.65 
 
 
916 aa  86.7  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>