More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1369 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1369  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 		 1026 aa  2104    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.408174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0382  arsenite oxidase, large subunit  33.37 
 
 		 854 aa  481  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000386632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2365  arsenite oxidase, large subunit  33.4 
 
 		 853 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0377  arsenite oxidase, large subunit  32.05 
 
 		 861 aa  451  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.103982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3950  arsenite oxidase large subunit  31.03 
 
 		 820 aa  267  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.616487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4427  arsenate reductase (azurin)  29.63 
 
 		 820 aa  265  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5678  arsenite oxidase, large subunit  30.19 
 
 		 829 aa  257  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5704  arsenite oxidase, large subunit  34.28 
 
 		 829 aa  229  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3084  arsenate reductase (azurin)  32.93 
 
 		 827 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  23.35 
 
 		 1396 aa  80.9  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.5 
 
 		 987 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 		 949 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.98 
 
 		 987 aa  77.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3203  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 		 980 aa  74.7  0.000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.542235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1915  formate dehydrogenase alpha subunit  28.12 
 
 		 953 aa  74.7  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3720  formate dehydrogenase alpha subunit  26.19 
 
 		 950 aa  74.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.933728 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0504  formate dehydrogenase alpha chain  27.12 
 
 		 986 aa  73.9  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3791  formate dehydrogenase alpha subunit  25.93 
 
 		 950 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1026  molybdopterin oxidoreductase  23.33 
 
 		 894 aa  72  0.00000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3916  formate dehydrogenase alpha subunit  26.39 
 
 		 950 aa  72  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4509  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.12 
 
 		 949 aa  71.6  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4224  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 950 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4106  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 950 aa  70.5  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0233  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 950 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00484847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4136  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 950 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.448434  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  24.47 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.47 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0057  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 		 949 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  24.47 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.47 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2724  molybdopterin oxidoreductase  27.42 
 
 		 741 aa  69.3  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.178384 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.47 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  24.47 
 
 		 715 aa  69.3  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3126  twin-arginine translocation pathway signal  26.2 
 
 		 983 aa  68.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.389263  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3613  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.86 
 
 		 949 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.982249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  26.19 
 
 		 949 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.08 
 
 		 1028 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1740  molybdopterin oxidoreductase  35.51 
 
 		 759 aa  67.4  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  33.05 
 
 		 745 aa  67.4  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0457  molybdopterin oxidoreductase  25.26 
 
 		 980 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.134785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0063  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 		 951 aa  67.4  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4171  molybdopterin oxidoreductase  25.68 
 
 		 776 aa  67.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0561971  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.08 
 
 		 1028 aa  67.4  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1453  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  25.24 
 
 		 942 aa  67  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 		 949 aa  66.2  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2923  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  26.19 
 
 		 810 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3087  molybdopterin oxidoreductase  24.8 
 
 		 987 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.08 
 
 		 1020 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 		 949 aa  65.5  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2449  twin-arginine translocation pathway signal  27.3 
 
 		 973 aa  65.1  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0389  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 		 980 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  25.4 
 
 		 949 aa  64.7  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0421  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 		 980 aa  64.7  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273483  normal  0.81793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4228  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 		 950 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00413313 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04310  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.98 
 
 		 807 aa  64.3  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00139341  normal  0.037099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4110  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 		 950 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0229  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 		 950 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.363214 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  29.03 
 
 		 526 aa  64.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4140  molybdopterin oxidoreductase  25.33 
 
 		 950 aa  64.3  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  26.45 
 
 		 1010 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2062  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 		 1180 aa  63.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.72 
 
 		 1020 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0333  molybdopterin oxidoreductase  25.06 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3609  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.93 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  23.66 
 
 		 951 aa  63.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.85 
 
 		 986 aa  63.2  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  29.27 
 
 		 1171 aa  63.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.03 
 
 		 721 aa  63.2  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  25.27 
 
 		 951 aa  62.8  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.15 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0961  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 		 752 aa  62.4  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2945  molybdopterin oxidoreductase  27.34 
 
 		 542 aa  62  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  25.07 
 
 		 951 aa  62  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1591  nitrate reductase catalytic subunit  26.88 
 
 		 837 aa  62  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3128  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  25.44 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.58 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5278  molybdopterin oxidoreductase  24.94 
 
 		 979 aa  61.6  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.940063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0350  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family protein  24.64 
 
 		 809 aa  61.6  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.228796 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2427  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.9 
 
 		 929 aa  61.6  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3724  formate dehydrogenase alpha subunit  25.65 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3795  formate dehydrogenase alpha subunit  25.65 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0337  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.76 
 
 		 955 aa  61.6  0.00000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3867  molybdopterin oxidoreductase  26.47 
 
 		 715 aa  61.6  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.705324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  26.79 
 
 		 714 aa  61.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.26 
 
 		 994 aa  60.8  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0401  formate dehydrogenase alpha subunit  26.59 
 
 		 964 aa  61.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.298134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.4 
 
 		 689 aa  60.8  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5491  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 		 973 aa  60.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4513  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.32 
 
 		 950 aa  60.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1120  putative formate dehydrogenase, alpha subunit  23.53 
 
 		 951 aa  60.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.21 
 
 		 716 aa  59.7  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  24.87 
 
 		 951 aa  60.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.35 
 
 		 879 aa  60.1  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0958  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 		 752 aa  60.1  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.977403  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1320  periplasmic nitrate reductase/nitrite reductase  25.96 
 
 		 1176 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0472235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0169  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 		 720 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.59 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3920  formate dehydrogenase alpha subunit  25 
 
 		 950 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.922429 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.06 
 
 		 904 aa  60.1  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  26.28 
 
 		 1010 aa  59.3  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>