150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1128 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  100 
 
 		 257 aa  527  1e-149  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  75.78 
 
 		 257 aa  413  1e-114  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  72.66 
 
 		 258 aa  407  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  73.05 
 
 		 257 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 675 aa  95.1  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 251 aa  89  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  24.41 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  26.82 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  25.66 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 249 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  28.84 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 271 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 637 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 249 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1833  methyltransferase type 11  32.68 
 
 		 264 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.328176  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2097  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  27.23 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2027  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.73 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  22.71 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  32.14 
 
 		 663 aa  61.2  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  24.51 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  23.08 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.25 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  31.4 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  25.24 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  24.07 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  24.07 
 
 		 280 aa  52.8  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  24.29 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  25.51 
 
 		 253 aa  52  0.000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  28.05 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0618  methyltransferase type 12  23.01 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00582618  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  21.79 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  22.54 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2827  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.43 
 
 		 258 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0976107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  30.14 
 
 		 265 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  21.59 
 
 		 259 aa  50.4  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 243 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  26.39 
 
 		 339 aa  49.3  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0485  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  30.59 
 
 		 575 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 244 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 204 aa  48.9  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 352 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 		 231 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.29 
 
 		 240 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0600  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.93996  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_41  SAM dependent methyltransferase, UbiE family  26.97 
 
 		 202 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000057615  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.04 
 
 		 247 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 315 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  25.29 
 
 		 281 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1917  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.82 
 
 		 424 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0513783  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.41 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0038  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000354346  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  28 
 
 		 424 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.34 
 
 		 235 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  27.97 
 
 		 351 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.37 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  23.45 
 
 		 263 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2020  methyltransferase type 11  25.82 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.525149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  34.55 
 
 		 152 aa  46.2  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 327 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  23.86 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30 
 
 		 219 aa  45.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  27.41 
 
 		 377 aa  45.4  0.0009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  26.03 
 
 		 638 aa  45.1  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10041  methyltransferase  27.48 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  28.69 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1728  methyltransferase type 11  35.21 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.726631 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  24.77 
 
 		 711 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1521  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0312  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2248  Methyltransferase type 11  26.7 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.586689  normal  0.376735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.71 
 
 		 420 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  24 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 710 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  31.9 
 
 		 182 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.29 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>