More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2782 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  52.42 
 
 		 688 aa  710    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  68.71 
 
 		 723 aa  1032    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  50.93 
 
 		 703 aa  664    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  65.65 
 
 		 708 aa  1003    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  45.1 
 
 		 745 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  63.13 
 
 		 677 aa  906    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  67.19 
 
 		 719 aa  1001    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  51.45 
 
 		 689 aa  707    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  69.88 
 
 		 730 aa  1024    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  52.42 
 
 		 688 aa  711    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  50.51 
 
 		 689 aa  691    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  67.39 
 
 		 700 aa  990    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  100 
 
 		 724 aa  1489    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  47.98 
 
 		 703 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  62.83 
 
 		 679 aa  910    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  51.4 
 
 		 688 aa  704    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  51.31 
 
 		 701 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  63.34 
 
 		 713 aa  905    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  68.01 
 
 		 719 aa  1037    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  53.63 
 
 		 685 aa  747    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  50.07 
 
 		 695 aa  678    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  43.59 
 
 		 718 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  46.06 
 
 		 696 aa  616  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  43.94 
 
 		 729 aa  617  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  46.84 
 
 		 685 aa  615  9.999999999999999e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  43.15 
 
 		 727 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  43.49 
 
 		 727 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  44.23 
 
 		 714 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  46.74 
 
 		 719 aa  612  9.999999999999999e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  43.35 
 
 		 727 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  42.74 
 
 		 727 aa  608  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  42.88 
 
 		 727 aa  610  1e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  43.35 
 
 		 727 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  42.74 
 
 		 726 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  43.35 
 
 		 727 aa  609  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  43.53 
 
 		 718 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  43.39 
 
 		 718 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  45.83 
 
 		 682 aa  597  1e-169  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  44.94 
 
 		 685 aa  597  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  44.96 
 
 		 719 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  44.74 
 
 		 710 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  43.81 
 
 		 711 aa  563  1.0000000000000001e-159  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  40.26 
 
 		 714 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  36.14 
 
 		 726 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  38.82 
 
 		 719 aa  480  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  37.69 
 
 		 670 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  37.76 
 
 		 707 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  36.05 
 
 		 703 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.94 
 
 		 1283 aa  448  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  37.28 
 
 		 690 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  35.64 
 
 		 690 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  35.19 
 
 		 702 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  35.86 
 
 		 713 aa  417  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  37.19 
 
 		 697 aa  418  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.54 
 
 		 740 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  33.04 
 
 		 666 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  33.56 
 
 		 705 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  34.24 
 
 		 692 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  34.75 
 
 		 709 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  34.64 
 
 		 723 aa  395  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  34.29 
 
 		 717 aa  376  1e-103  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  34.4 
 
 		 742 aa  374  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  33.43 
 
 		 704 aa  358  1.9999999999999998e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  30.63 
 
 		 686 aa  316  8e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  30.08 
 
 		 734 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  30.64 
 
 		 697 aa  269  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  28.23 
 
 		 704 aa  268  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  44.15 
 
 		 696 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  29.05 
 
 		 730 aa  267  4e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  29.91 
 
 		 697 aa  267  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  29.26 
 
 		 701 aa  264  3e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  30.52 
 
 		 695 aa  263  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  27.58 
 
 		 688 aa  261  3e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  30.17 
 
 		 697 aa  260  7e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  30.17 
 
 		 697 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  30.17 
 
 		 697 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  29.24 
 
 		 697 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  29.94 
 
 		 697 aa  256  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  29.24 
 
 		 697 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  28.57 
 
 		 690 aa  253  6e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  26.67 
 
 		 733 aa  253  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2328  oligopeptidase B  28.19 
 
 		 697 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0142443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47360  putative oligopeptidase  28.59 
 
 		 683 aa  248  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3948  prolyl oligopeptidase  30.74 
 
 		 702 aa  248  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  29.81 
 
 		 614 aa  247  6e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  27.58 
 
 		 718 aa  246  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  41.37 
 
 		 696 aa  244  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1399  oligopeptidase B  28.47 
 
 		 684 aa  243  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.357658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1781  oligopeptidase B  27.63 
 
 		 678 aa  243  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4087  putative oligopeptidase  28.51 
 
 		 683 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0844  oligopeptidase B  26.49 
 
 		 699 aa  238  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  40.57 
 
 		 722 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1579  oligopeptidase B  26.97 
 
 		 682 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.767471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03460  oligopeptidase B  26.72 
 
 		 703 aa  236  9e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4583  oligopeptidase B  27.82 
 
 		 680 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  26.16 
 
 		 721 aa  236  1.0000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4802  Prolyl oligopeptidase  30.29 
 
 		 697 aa  236  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4277  Prolyl oligopeptidase  26.56 
 
 		 705 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  39.67 
 
 		 710 aa  234  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46548  predicted protein  29.09 
 
 		 793 aa  234  5e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.560157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>