More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04808 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2645  hydrolase, TatD family  70.24 
 
 		 256 aa  340  2e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.430884  normal  0.313359 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0150  putative deoxyribonuclease  64.54 
 
 		 260 aa  334  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0133  TatD-related deoxyribonuclease  64.54 
 
 		 260 aa  311  6.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.285851  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3248  TatD-related deoxyribonuclease  55.56 
 
 		 255 aa  263  2e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  48.83 
 
 		 260 aa  229  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  45.53 
 
 		 259 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  44.36 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  42.64 
 
 		 263 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  46.18 
 
 		 268 aa  208  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3841  TatD-related deoxyribonuclease  44 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4402  TatD-related deoxyribonuclease  43.19 
 
 		 258 aa  205  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.922162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0825  TatD family hydrolase  43.58 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  41.63 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  42.41 
 
 		 259 aa  201  9e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  43.25 
 
 		 263 aa  198  7.999999999999999e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0488  putative TatD related DNase  43.82 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  37.35 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  39.37 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  39.77 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1829  TatD-related deoxyribonuclease  42.13 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3503  TatD-related deoxyribonuclease  38.8 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.76474 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0814  TatD family hydrolase  43.19 
 
 		 258 aa  185  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.636525  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0791  TatD family deoxyribonuclease  42.8 
 
 		 258 aa  184  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1444  TatD-related deoxyribonuclease  41.53 
 
 		 262 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.640002  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04254  predicted DNase  40.62 
 
 		 259 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3620  TatD-related deoxyribonuclease  40.62 
 
 		 259 aa  182  7e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04220  hypothetical protein  40.62 
 
 		 259 aa  182  7e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4926  putative deoxyribonuclease YjjV  39.61 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4922  putative deoxyribonuclease YjjV  40.39 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4972  putative deoxyribonuclease YjjV  41.73 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5418  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.463654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3583  TatD-related deoxyribonuclease  40.48 
 
 		 290 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  39.22 
 
 		 283 aa  178  7e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  38.58 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4818  putative deoxyribonuclease YjjV  41.34 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18210  TatD family deoxyribonuclease  43.72 
 
 		 225 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4920  putative deoxyribonuclease YjjV  41.34 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.97182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4979  putative deoxyribonuclease YjjV  41.34 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1158  TatD-related deoxyribonuclease  40.41 
 
 		 262 aa  178  9e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.227314  hitchhiker  0.00871913 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4885  putative deoxyribonuclease YjjV  41.34 
 
 		 257 aa  178  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0324163  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5891  putative deoxyribonuclease YjjV  39.61 
 
 		 260 aa  177  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  38.58 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4613  putative deoxyribonuclease YjjV  39.22 
 
 		 260 aa  177  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3678  putative deoxyribonuclease YjjV  39.61 
 
 		 260 aa  176  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00508775 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4976  putative deoxyribonuclease YjjV  39.22 
 
 		 260 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.336461  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  39.84 
 
 		 270 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  37.11 
 
 		 256 aa  176  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2130  TatD-related deoxyribonuclease  41.22 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0924229  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1889  TatD family hydrolase  40.17 
 
 		 262 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5965  TatD-related deoxyribonuclease  41.22 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2112  TatD-related deoxyribonuclease  41.22 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.363991  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2022  TatD-related deoxyribonuclease  39.18 
 
 		 262 aa  175  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  normal  0.212066 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  39.06 
 
 		 270 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3462  TatD-related deoxyribonuclease  41.57 
 
 		 278 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  38.67 
 
 		 260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0952  hydrolase, TatD family  39.82 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03379  hypothetical protein  39.3 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1683  TatD-related deoxyribonuclease  39.69 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2387  hydrolase, TatD family  48.21 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2017  TatD-related deoxyribonuclease  48.21 
 
 		 271 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  39.57 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5398  TatD-related deoxyribonuclease  43.82 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177339  normal  0.604779 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  35.57 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  34.39 
 
 		 255 aa  168  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  36.68 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001920  deoxyribonuclease TatD  37.8 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2149  TatD-related deoxyribonuclease  39.18 
 
 		 262 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.193647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  35.18 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  37.55 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2199  TatD family hydrolase  41.45 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2637  putative deoxyribonuclease yjjV  41.45 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00523609  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  35.18 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  35.18 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1694  TatD family hydrolase  41.45 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.928582  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  34.78 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  35.18 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1472  putative deoxyribonuclease yjjV  41.45 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3119  TatD family hydrolase  41.45 
 
 		 262 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  37.5 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  34.78 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  34.78 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  34.78 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1922  hypothetical protein  36.33 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2582  putative deoxyribonuclease yjjV  41.03 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.909143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2716  TatD family hydrolase  41.03 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  34.78 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4206  Sec-independent protein translocase TatD  40 
 
 		 261 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  35.18 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  37.45 
 
 		 257 aa  163  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1245  TatD-related deoxyribonuclease  37.64 
 
 		 286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  39.13 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  35.06 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3500  TatD family hydrolase  41.57 
 
 		 262 aa  162  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1099  TatD-related deoxyribonuclease  36.96 
 
 		 255 aa  161  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00265668  unclonable  0.000022958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  39.62 
 
 		 284 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  35.06 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1034  TatD-related deoxyribonuclease  36.58 
 
 		 255 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000105438  hitchhiker  0.00000000499451 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3233  TatD-related deoxyribonuclease  38.08 
 
 		 254 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00276118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>