66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02539 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02539  cell Wall Hydrolase superfamily  100 
 
 		 153 aa  313  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0796  cell wall hydrolase SleB  84.87 
 
 		 152 aa  274  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.138978 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0542  cell wall hydrolase, SleB  35.71 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2400  hypothetical protein  34.88 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.459771  normal  0.693933 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0509  cell wall hydrolase, SleB  32.84 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1860  hypothetical protein  32.84 
 
 		 240 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.34417  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0856  cell wall hydrolase SleB  32.41 
 
 		 410 aa  67.8  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0646  cell wall hydrolase, SleB  32.52 
 
 		 228 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.221426 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2834  cell wall hydrolase, SleB  34.33 
 
 		 221 aa  67  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0954189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0694  cell wall hydrolase, SleB  35.88 
 
 		 377 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2729  cell wall hydrolase, SleB  30.94 
 
 		 229 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.813729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3463  cell wall hydrolase, SleB  33.06 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0100975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3115  cell wall hydrolase SleB  33.57 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0386161  normal  0.400578 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2889  cell wall hydrolase SleB  33.57 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3012  cell wall hydrolase SleB  32.86 
 
 		 301 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0552  cell wall hydrolase SleB  31.62 
 
 		 409 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.347701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4104  cell wall hydrolase, SleB  30.82 
 
 		 383 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.878501  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2709  cell wall hydrolase SleB  32.33 
 
 		 446 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.883037  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1116  cell wall hydrolase SleB  30.34 
 
 		 433 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3837  cell wall hydrolase SleB  32.33 
 
 		 365 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6175  cell wall hydrolase SleB  30.37 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4342  cell wall hydrolase, SleB  32.37 
 
 		 476 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0510  cell wall hydrolase SleB  30.88 
 
 		 402 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6696  cell wall hydrolase SleB  28.36 
 
 		 235 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2176  cell wall hydrolase, SleB  30.88 
 
 		 255 aa  57.8  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.319369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2308  cell wall hydrolase, SleB  32.09 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.809366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0108  cell wall hydrolase, SleB  33.57 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2848  cell wall hydrolase SleB  31.58 
 
 		 404 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0241878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0445  cell wall hydrolase SleB  29.85 
 
 		 391 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0946724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2708  cell wall hydrolase, SleB  34.35 
 
 		 460 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3504  cell wall hydrolase, SleB  33.59 
 
 		 466 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0498  cell wall hydrolase SleB  31.76 
 
 		 429 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2361  hypothetical protein  32.06 
 
 		 496 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.36307  normal  0.167398 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5847  cell wall hydrolase SleB  29.6 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1223  cell wall hydrolase family protein  28.06 
 
 		 284 aa  54.7  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0182396  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2059  putative lipoprotein  30.4 
 
 		 326 aa  54.3  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.332093  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1244  cell wall hydrolase SleB  31.3 
 
 		 476 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.445074  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2145  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 326 aa  53.9  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1225  cell wall hydrolase, SleB  30.94 
 
 		 474 aa  53.9  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.31402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3026  cell wall hydrolase SleB  26.72 
 
 		 245 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0983766  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2922  cell wall hydrolase SleB  27.78 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.818359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2798  cell wall hydrolase SleB  26.72 
 
 		 245 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0765  cell wall hydrolase SleB  30.71 
 
 		 315 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.769298  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6759  cell wall hydrolase SleB  28.35 
 
 		 278 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.582595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0730  cell wall hydrolase SleB  30.77 
 
 		 245 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.306821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4323  cell wall hydrolase SleB  33.33 
 
 		 375 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2593  cell wall hydrolase SleB  30.53 
 
 		 432 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1104  cell wall hydrolase, SleB  32.06 
 
 		 472 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_004310  BR0378  hypothetical protein  31.3 
 
 		 429 aa  50.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0543  cell wall hydrolase, SleB  24.82 
 
 		 169 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0934  cell wall hydrolase, SleB  27.27 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0249675  normal  0.838276 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2496  hypothetical protein  26.45 
 
 		 166 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1158  cell wall hydrolase SleB  27.41 
 
 		 207 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1195  cell wall hydrolase, SleB  30.08 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1928  cell wall hydrolase, SleB  26.45 
 
 		 169 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397103  normal  0.0105522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1671  cell wall hydrolase SleB  27.48 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.535782  decreased coverage  0.0020174 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1185  cell wall hydrolase, SleB  28.89 
 
 		 409 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1894  hypothetical protein  28.45 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3002  cell wall hydrolase SleB  29.6 
 
 		 488 aa  44.3  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000336661  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4305  cell wall hydrolase SleB  30.23 
 
 		 412 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5334  hypothetical protein  31.34 
 
 		 300 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.632965  normal  0.811239 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5166  cell wall hydrolase SleB  31.54 
 
 		 250 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.847272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0485  cell wall hydrolase SleB  32.23 
 
 		 186 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2212  cell wall hydrolase, SleB  29.63 
 
 		 203 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2190  cell wall hydrolase, SleB  30.91 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1113  cell wall hydrolase SleB  33.88 
 
 		 187 aa  40.4  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>