More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01901 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_01901  glutamate symport protein  100 
 
 		 439 aa  871    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.876346  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1603  sodium:dicarboxylate symporter  82.76 
 
 		 437 aa  738    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1656  glutamate symport protein  82.07 
 
 		 437 aa  734    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.51516  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2889  sodium:dicarboxylate symporter  84.53 
 
 		 444 aa  733    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.568975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3562  proton/glutamate symporter, putative  41.75 
 
 		 413 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1216  sodium:dicarboxylate symporter  43.45 
 
 		 441 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1129  sodium:dicarboxylate symporter  43.4 
 
 		 419 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3263  sodium:dicarboxylate symporter  43.4 
 
 		 419 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.316295  normal  0.0437652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1095  sodium:dicarboxylate symporter  43.16 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1028  sodium:dicarboxylate symporter  43.16 
 
 		 419 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1055  sodium:dicarboxylate symporter  43.29 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.637343 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1326  sodium:dicarboxylate symporter  42.02 
 
 		 427 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.027246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3163  sodium:dicarboxylate symporter  43.29 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1206  sodium:dicarboxylate symporter  42.89 
 
 		 416 aa  317  3e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1069  sodium:dicarboxylate symporter  44.05 
 
 		 416 aa  316  6e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3065  sodium:dicarboxylate symporter  43.06 
 
 		 417 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1033  sodium:dicarboxylate symporter  43.4 
 
 		 419 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2983  sodium:dicarboxylate symporter  42.82 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.799074 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3329  sodium:dicarboxylate symporter  44.26 
 
 		 426 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153247 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1224  sodium:dicarboxylate symporter  41.87 
 
 		 416 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  36.77 
 
 		 440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  36.77 
 
 		 440 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  36.77 
 
 		 435 aa  289  6e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  37.2 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  35.98 
 
 		 433 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  36.82 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  35.6 
 
 		 432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  36.53 
 
 		 444 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  36.07 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  36.3 
 
 		 444 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  36.3 
 
 		 444 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  36.73 
 
 		 430 aa  277  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  37.09 
 
 		 409 aa  276  8e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  34.75 
 
 		 449 aa  272  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1067  sodium:dicarboxylate symporter  36.74 
 
 		 410 aa  264  3e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000677504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  36.58 
 
 		 417 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4122  sodium:dicarboxylate symporter  42.21 
 
 		 444 aa  260  3e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1315  sodium:dicarboxylate symporter  40.56 
 
 		 435 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6394  sodium:dicarboxylate symporter  38.7 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1358  sodium:dicarboxylate symporter  42.24 
 
 		 435 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16520  Na+/H+ dicarboxylate symporter  40.66 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0175926  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  40.1 
 
 		 500 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1278  sodium:dicarboxylate symporter  39.18 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.421424  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3041  sodium:dicarboxylate symporter  37.79 
 
 		 441 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0982219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1322  sodium:dicarboxylate symporter  38.92 
 
 		 480 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000258413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2831  sodium:dicarboxylate symporter  39.08 
 
 		 477 aa  242  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.292704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3945  sodium:dicarboxylate symporter  37.87 
 
 		 480 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3163  sodium:dicarboxylate symporter  40.09 
 
 		 456 aa  239  5.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13410  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.89 
 
 		 479 aa  236  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.02362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  35.17 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2338  sodium:dicarboxylate symporter  40.16 
 
 		 439 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0276413  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28490  Na+/H+ dicarboxylate symporter  37.92 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2850  hypothetical protein  37.6 
 
 		 439 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0118384 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  34.69 
 
 		 411 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  34.87 
 
 		 434 aa  227  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  33.5 
 
 		 436 aa  226  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4883  sodium:dicarboxylate symporter  34.58 
 
 		 445 aa  226  8e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  34.45 
 
 		 411 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  33.92 
 
 		 436 aa  226  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  35.32 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.45 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1033  proton/sodium-glutamate symport protein (glutamate-aspartate carrierprotein)  32.63 
 
 		 430 aa  225  1e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000352201  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1300  proton/glutamate symporter family protein  34.69 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.643511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1273  sodium:dicarboxylate symporter family protein  34.69 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  33.58 
 
 		 440 aa  225  2e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1408  proton/glutamate symporter family protein  34.69 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1479  proton/glutamate symporter family protein  34.69 
 
 		 411 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0616  sodium:dicarboxylate symporter  35.48 
 
 		 413 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1019  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.99 
 
 		 435 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00254139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 437 aa  224  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1571  sodium:dicarboxylate symporter  34.38 
 
 		 402 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000275384  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  34.21 
 
 		 411 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  33.59 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1191  sodium/dicarboxylate symporter family protein  31.82 
 
 		 435 aa  222  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0028335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  33.72 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  32.08 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.99 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  31.19 
 
 		 437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  34.21 
 
 		 411 aa  221  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  32.08 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0390  sodium:dicarboxylate symporter  35.6 
 
 		 428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000203  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  32.08 
 
 		 440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  34.42 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  31.35 
 
 		 440 aa  219  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  32.75 
 
 		 442 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  31.68 
 
 		 437 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  30.95 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.6 
 
 		 437 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  31.44 
 
 		 439 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  33.75 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  32.82 
 
 		 433 aa  212  1e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04780  Na+/H+ dicarboxylate symporter  32.15 
 
 		 445 aa  211  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.126443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2331  sodium:dicarboxylate symporter  32.31 
 
 		 438 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.712611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  32.23 
 
 		 441 aa  209  7e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02356  putative proton/glutamate symporter  32.99 
 
 		 448 aa  207  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126636  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2400  sodium:dicarboxylate symporter  31.48 
 
 		 439 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000628072  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1194  putative proton/glutamate symporter  33.67 
 
 		 447 aa  204  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17283  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2890  sodium:dicarboxylate symporter  31.58 
 
 		 424 aa  204  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  32.13 
 
 		 437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  30.61 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>