54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0580 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0580  tail tape measure protein  100 
 
 		 714 aa  1415    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.834112  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4592  Phage tail tape measure protein TP901, core region  88.58 
 
 		 719 aa  1238    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3865  phage tail protein, putative  45.53 
 
 		 651 aa  412  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2256  tail protein  40.69 
 
 		 642 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173389 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2253  tail protein  40.04 
 
 		 642 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725805  normal  0.182579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4475  tail protein  41.15 
 
 		 641 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323148 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01340  phage-related tail protein  32.97 
 
 		 956 aa  242  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.776722  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1157  TMP  30.36 
 
 		 590 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1298  phage tail tape measure protein, TP901 family  39.22 
 
 		 781 aa  197  6e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000950685 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1133  hypothetical protein  26.86 
 
 		 739 aa  163  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0394  hypothetical protein  26.86 
 
 		 739 aa  163  8.000000000000001e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01999  hypothetical protein  31.73 
 
 		 997 aa  162  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1155  TP901 family phage tail tape measure protein  26.79 
 
 		 739 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0222  TP901 family tail tape measure protein  25.51 
 
 		 738 aa  156  1e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2292  TP901 family phage tail tape measure protein  30.43 
 
 		 793 aa  141  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0268728  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0570  prophage P2W3, tail tape measure protein  24.69 
 
 		 680 aa  139  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2589  TP901 family phage tail tape measure protein  24.56 
 
 		 596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0411901 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0946  phage tail tape measure protein  25.96 
 
 		 1025 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2753  TP901 family phage tail tape measure protein  26.31 
 
 		 1025 aa  81.6  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000729903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1466  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.74 
 
 		 1092 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2489  phage tail tape measure protein  25.99 
 
 		 1025 aa  75.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4911  TP901 family phage tail tape measure protein  22.81 
 
 		 814 aa  73.6  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02660  phage tail tape measure protein, TP901 family  22.39 
 
 		 1095 aa  69.7  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000274947 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2844  phage tail tape measure protein  25.18 
 
 		 935 aa  69.7  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.581537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1626  hypothetical protein  27.64 
 
 		 925 aa  67.8  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0695  phage tail tape measure protein, TP901 family  25 
 
 		 762 aa  67.4  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3027  phage tail tape measure protein  25.18 
 
 		 935 aa  67  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1357  phage tail-like protein  24.22 
 
 		 550 aa  67  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0750  Phage tail tape measure protein TP901, core region  23.74 
 
 		 950 aa  65.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.173353 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3386  Phage tail tape measure protein TP901, core region  24.49 
 
 		 733 aa  64.3  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.576804  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1148  Phage tail tape measure protein TP901, core region  28.15 
 
 		 826 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0884  phage tail tape measure protein, TP901 family  23.39 
 
 		 823 aa  62  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0603938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4487  TP901 family phage tail tape measure protein  23.84 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.108183  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4860  putative phage-related tail transmembrane protein  22.94 
 
 		 920 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.582054  normal  0.698632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2891  TP901 family phage tail tape measure protein  26.19 
 
 		 1216 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2914  prophage MuMc02, TP901 family tail tape measure protein  21.74 
 
 		 993 aa  57.8  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2688  phage protein  26.19 
 
 		 721 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4550  putative phage tail protein  23.89 
 
 		 784 aa  57.4  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.423372  normal  0.711096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4549  putative phage tail protein  23.55 
 
 		 784 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.374859 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4465  putative phage tail protein  23.71 
 
 		 784 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0181  putative phage-related tail transmembrane protein  22.81 
 
 		 919 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1914  phage-related tail transmembrane protein  30.07 
 
 		 887 aa  53.9  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.575173  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3581  TMP repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1206 aa  50.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3413  prophage membrane protein  22.65 
 
 		 726 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1146  minor tail protein gp26-like protein  27.52 
 
 		 874 aa  48.1  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.668706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0597  putative prophage membrane protein  24.83 
 
 		 716 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3322  Phage tail tape measure protein TP901, core region  26.17 
 
 		 743 aa  47.8  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.787637  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0287  hypothetical protein  29.08 
 
 		 565 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00035869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1488  TP901 family phage tail tape measure protein  22.43 
 
 		 781 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0859  TP901 family phage tail tape measure protein  30.34 
 
 		 701 aa  46.2  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0227343  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2893  phage tail tape measure protein, TP901 family  25 
 
 		 817 aa  45.8  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.772057  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5330  TP901 family phage tail tape measure protein  24.65 
 
 		 1127 aa  45.1  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0522  phage tail tape measure protein, TP901 family  21.63 
 
 		 1628 aa  45.1  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.389644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1389  phage protein  23.14 
 
 		 805 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>